入門級!6種常見報告基因介紹下篇——熒光素酶luc你是否瞭解

延續上期我們對報告基因的初步認識,今天我們來介紹一下另外的3種類型。

β-半乳糖苷酶基因(β-Gal)報告基因

β-半乳糖苷酶:由大腸桿菌lacZ基因編碼,可催化半乳糖苷水解。

最大優勢是易於用免疫組織化學法觀測其原位表達,是最常用的監測轉染率的報 基因之一。

以鄰-硝基苯-β-D-半乳吡喃糖苷(ONPG)為底物可用標準的比色法檢測酶活性,其檢測動力學範圍為6個數量級。氯酚紅-β-D-半乳吡喃糖苷(CPRG)是另一個可用比色法檢測酶活性的底物,其靈敏度比ONPG高近10倍。以MUG和熒光素二半乳糖苷(FDG)為底物則可用熒光法檢測其活性。此法可檢測單個細胞的酶活性,並可用於流式細胞學(FACS)分析。如以二氧雜環丁烷為底物,可用化學發光法檢測酶活性,其檢測動力學範圍最大,靈敏度最高,與用生物發光法檢測熒光素酶活性的靈敏度相似。

β半乳糖苷酶是動物和微生物基因工程中最常用、最成熟的一種報告基因。

它作為報告基因的應用主要有以下幾個方面:

(1)用於研究啟動子的效能和啟動子不同位點突變對錶達效能的影響;

(2)用於研究表達系統中增強序列等調控序列的功能;

(3)用來衡量載體的表達特性和外源物質對錶達調控的影響;

(4) 以融合基因的形式用於研究外源基因的表達及其規律。

檢測方法:

  1. 用轉染的細胞製備細胞抽提物。
  2. 對於每個用於測定的轉染細胞裂解物樣品,混合:
  • 100xMg2+溶液—— 3ul
  • 1xONPG—— 66ul
  • 細胞抽提物—— 30ul
  • 0.1mol/L 磷酸鈉(PH7.5) —— 201ul

3. 反應液在 37°C 孵育 30 min 或者直到淡黃色出現。大多數細胞類型中,內源性β-半乳糖苷酶的背景非常低,允許孵育時間長到 4~6 h;

4. 每管加入 500ul 1mol/L Na2CO3 使反應終止。在分光光度計上讀 420nm 波長的光密度值。

常用載體:

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氯黴素轉乙酰酶報告基因 ( chlormnphenicol acetyltransferase, CAT)

氯黴素轉乙酰酶報告基因 (CAT):該報告基因來源於大腸桿菌轉位子9,是第1個用於檢測細胞內轉錄活性的報告基因。氯黴素乙酰基轉移酶可催化乙酰CoA的乙酰基轉移到氯黴素3羥基,而使氯黴素解毒。CAT在哺乳細胞無內源性表達,性質穩定,半衰期較短,適於瞬時表達研究。可用同位素、熒光素和酶聯免疫吸附測定(enzyme—linkedimmunosorbantassay,ELISA)檢測其活性,也可進行蛋白質印跡(Westernblotting)和免疫組織化學分析。CAT與其他報告基因相比,線性範圍較窄,靈敏性較低。

檢測步驟:

1. 轉染後 24~72 h,用 D-PBSA 液洗滌細胞;

2. 將培養板置於冰上,每孔中加入 1 mL 的 Tris/Triton;

3. 將培養板-70℃ 冷凍 2 h;

4. 於 37℃ 下解凍培養板,然後將其置於冰上;

5. 將細胞裂解物移至微量離心管中,以最大速度離心 5 min;

6. 收集上清液,65℃ 加熱 10 min,以滅活 CAT 抑制物質;

7. 最大速度離心 3 min 後收集上清液(細胞裂解物),將上清液保存在-70℃;

8. 從每一樣品中取 5~150μL 細胞裂解物,移至一個 3.5 mL 多聚丙烯閃爍杯中,並且加入足夠的 0.1mol/L Tris,終末體積為 150μL;

9. 設空白杯,加入 150μL 0.1mol/LTris 液,作為陰性對照;

10. 陽性對照:

(a)取 5 個閃爍杯,各加入 150μL 0.1mol/LTris;

(b)將 5μL 的 CAT 標準液加入到每個閃爍杯中,繪製 1、5、10、20、50mU 的 CAT 標準曲線。

11. 在所有樣品杯(包括對照)中,加入 100μL 以下混合液:

(a)84μL 超純水;(b)10μL 0.1mol/LTris;(c)1μL 的氯黴素;

(d)5μL(50nCi)的 14C-CoA;

12. 擰緊杯蓋,於 37℃ 下孵育 2 h;

13. 向所有閃爍杯中加入 3 mL Econofluor,擰緊杯蓋;

14. 上下倒置混勻閃爍杯中成分;

15. 室溫下孵育 2 h;

16. 在一個液閃計數儀上測定 30s 閃爍次數。

注意事項:

1. 在表達質粒擴增與製備一步,要特別注意其純度(不能含RNA和染色體DNA)以免影響轉化效率

2. 製備方法最好選用溶菌酶加Triton10,然後氯化豔梯度離心。

3. 一定要有對照組用CAT酶代替細胞提取液,來驗證反應及層析等過程的可行性,或用Psv:CAT和Psv。cAT表達質粒驗證轉化及重組兩步的正確性。

4. 在製備細胞提取液中最好選用超聲波破碎法,離心前要注意檢查破碎程度。凍融法繁瑣有時破碎不徹底影響結果。

5. 4mmol/L乙酞輔酶A可每次取1.smg溶在500純水中,最好用前配製,配製的溶液可保存於一20℃,但不可超過十天。

常見載體:


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熒光素酶(Luc)報告基因

熒光素酶報告基因是指以熒光素(luciferin)為底物來檢測螢火蟲熒光素酶(fireflyluciferase)活性的一種報告系統。熒光素酶是能夠催化不同底物氧化發光的一類酶,它可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的過程中,會發出生物熒光(bioluminescence)。

最常用的熒光素酶有細菌熒光素酶、螢火蟲熒光素酶和Renilla熒光素酶。哺乳細胞無內源性熒光素酶,細菌熒光素酶對熱敏感,因此在哺乳細胞的應用中受到限制。螢火蟲熒光素酶靈敏度高,檢測線性範圍寬達7~8個數量級,是最常用於哺乳細胞的報告基因,用熒光比色計即可檢測酶活性,因而適用於高通量篩選。隨著具有膜通透性和光裂解作用的螢火蟲熒光素酶的應用,無需裂解細胞即可檢測酶活性。Renilla熒光素酶催化腸腔素(coelenterazine)氧化,產物可透過生物膜,可能是最適用於活細胞的報告分子。將熒光素酶報告基因載體轉染到細胞中,可用熒光素酶檢測系統靈敏方便地測定熒光素酶基因的表達。

自1986年起,螢火蟲熒光素酶基因被用作測定基因表達的報告基因,獲得了廣泛的應用。Promega公司的pGL3及pGL2系列載體,含SV40啟動子及增強子的不同組合,有助於分析DNA片段的轉錄活性。

熒光素酶報告基因有許多優點:①非放射性;②比CAT及其他報告基因速度快;③比CAT靈敏100倍;④熒光素酶在哺乳細胞中的半衰期為3小時,在植物中的半衰期為3.5小時。由於半衰期短,故啟動子的改變會即時導致熒光素酶活性的改變,而熒光素酶不會積累。相反,CAT在哺乳細胞中的半衰期為50小時。熒光素酶濃度在10—16mol/L(10pS/L)到10-8mol/L(1mg/L)範圍內,熒光信號強度與酶濃度成正比。在理想條件下,可檢測到l0-20mol/L的熒光素酶。

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檢測步驟:

(1) 用生物信息學方法分析並預測啟動子區可能的轉錄因子結合位點。

(2)設計引物用PCR法從基因組DNA中克隆所需的靶啟動子片段,將此片段插入到熒光素酶報告基因質粒(pGL3-basic)中。

(3)篩選陽性克隆,測序。擴增克隆並提純質粒備用。

(4) 擴增轉錄因子質粒,提純備用。同時準備相應的空載質粒對照,提純備用。

(5) 培養293(或其它目的細胞),並接種於24孔板中,生長10-24小時(80%匯合度)。

(6) 將報告基因質粒與轉錄因子表達質粒共轉染細胞。

(7) 提取蛋白並用於熒光素酶檢測。

(8) 加入底物,測定熒光素酶的活性。

(9) 計算相對熒光強度,並與空載對照比較。

常見載體:

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