奥美拉唑和西咪替丁都是临床上常用的抑酸药，可抑制胃酸的分泌，是临床上治疗反流性食管炎、胃、十二指肠溃疡、卓-艾综合征等酸相关性疾病的首选药物。
奥美拉唑属于质子泵抑制剂，通过与胃壁细胞上的H+-K+-ATP酶不可逆的结合，使H+-K+-ATP酶失去活性，从而抑制胃壁细胞分泌胃酸，发挥抑酸作用，奥美拉唑的优点是抑酸作用强大而持久，可使胃内达到无酸水平，抑酸作用可长达72小时。西咪替丁属于H2受体拮抗剂，主要作用于胃壁细胞的H2受体，竞争性抑制组胺释放，达到抑制胃酸分泌的目的，西咪替丁的优点是抑制夜间基础胃酸的分泌。
人体胃酸分泌的机制主要通过三种受体，即H2组胺受体、乙酰胆碱受体和促胃泌素受体，激动这三种受体都可刺激胃酸分泌，但最终都要通过质子泵这个环节，胃酸才能最终分泌，因此，胃壁细胞上的质子泵是胃酸分泌的最终环节。西咪替丁只作用于胃酸分泌的分支环节，奥美拉唑作用于胃酸分泌的最终环节，因此，与西咪替丁相比，奥美拉唑的抑酸作用更强，抑酸时间更长。
在临床使用方面，奥美拉唑可抑制胃酸分泌，提高胃内PH值，增加抗生素的稳定性，提高胃内抗生素浓度，降低最小抑菌浓度，可杀灭幽门螺杆菌，在临床上可与抗生素联合，用于根除幽门螺杆菌，西咪替丁抑酸作用较弱，对幽门螺杆菌无效。此外，西咪替丁容易出现耐受性，而且经常发生，而奥美拉唑则很少出现耐受性，在临床上奥美拉唑使用更加广泛。西咪替丁可抑制夜间基础胃酸的分泌，夜间出现反酸、烧心、胃痛的患者，可以在晚上睡前服用西咪替丁。
在安全性方面，奥美拉唑常见腹泻、便秘、恶心、头痛等不良反应，长期用药可引起急性间质性肾炎、肺炎、艰难梭菌感染、自发性腹膜炎、痴呆、骨折、铁、镁、钙、维生素B12、维生素C等微量元素吸收障碍、胃肠道恶性肿瘤等严重不良反应。西咪替丁常见腹泻、皮疹、乏力、头晕、头痛、嗜睡等不良反应。西咪替丁可进入中枢，有一定神经毒性，表现为幻觉、忧虑、抑郁、精神紊乱等。西咪替丁有轻度抗雄激素作用，大剂量服用可引起男性性欲减退、阳痿、精子数减少、乳房发育等。 两种药物都不宜长期服用，西咪替丁的安全性相对较好。
在相互作用方面，奥美拉唑可抑制抗血小板药氯吡格雷活化，容易导致抗血小板作用下降，增加动脉粥样硬化血栓事件的风险，不推荐奥美拉唑和氯吡格雷联合使用。西咪替丁和氯吡格雷之间没有相互作用，可以联合使用。
总之，奥美拉唑和西咪替丁都是抑酸药，奥美拉唑抑酸作用更强，是临床上治疗酸相关性疾病的主要药物，西咪替丁可抑制基础胃酸的分泌，适用于夜间酸突破的患者，西咪替丁严重不良反应更少，安全性更高，奥美拉唑影响氯吡格雷的抗血小板作用，应避免联用。
