椰子油具有很好的保健功效與它包含的脂肪酸鏈長度有關。椰子油是由中等長度脂肪鏈構成，有時也稱之為中鏈甘油三酯。這種脂肪酸可以比長鏈更快穿透細胞膜，並且不需要特殊酶的幫助。
中鏈脂肪酸不像其他脂肪一樣需要通過血流循環，而是直接被送到肝臟。在這裡，它們被立即轉變成能量，而不是儲存在身體脂肪裡。這種處理方式使椰子油有更多的健康益處，包括增加新陳代謝和降低體重等。
椰子油其他的保健功效還與它含有大量月桂酸有關。這種酸在體內被轉變成單元月桂酸甘油脂。單元月桂酸甘油脂是一種免疫系統抗病毒抗菌單甘酯，被身體用於摧毀皰疹，流行性感冒病毒，以及人體免疫缺陷病毒。此外，椰子油的用途還包括經常用於治療獲得性免疫缺陷綜合症（AIDS）。
椰子油的保健作用在最近幾年引起了很多醫療科研組織的關注。2004年，一項發表在臨床生物化學雜誌的報告指出，椰子油用於實驗室動物身上，已經證實可以有效降低它們體內的膽固醇和甘油三酸脂水平。
椰子油可以降低膽固醇水平是因為它有刺激甲狀腺的作用。當體內甲狀腺數量充足的時候，膽固醇通過酶轉變成激素。這些激素包括孕酮，脫氫表雄酮和孕烯醇酮。它們是防止心臟疾病，肥胖，癌症和其他一些退化性疾病所必需的元素。
椰子油其他一些用途和好處還包括皮膚和頭髮護理。由於分子重量較輕，椰子油很容易滲透進入頭髮。因此它可以用於深度保養頭髮，並降低蛋白質損失。它的抗氧化特性有助於抵禦自由基對皮膚的損傷。自由基導致皺紋，老年斑，和皮膚下垂等過早衰老問題。外部施用椰子油可以減少自由基的產生，起到保護皮膚，延緩衰老的作用。
椰子油還用於促進傷口癒合。這種油用在感染部位可以產生一層化學保護膜，防止灰塵和細菌侵入。已知它還有加快修復受損細胞和組織的功效。
只有選擇使用高質量椰子油才可以獲得它所有的保健功效。經過精製，漂白和氫化的椰子油沒有太多好處。因為化學加工過程會剝離椰子油的自然營養物質。
