1998年克林頓訪問北京，在北大演講時說：“這個校園過去是美國傳教士創建的燕京大學的所在地。”但當年的國內紙媒在報道時迴避掉了燕京大學。2005年連戰訪問大陸，在北京大學演講，開篇就說，這裡是燕京大學的舊址，自己母親曾是燕京大學的學生。這一次，紙媒在報道中提到了燕京大學：“燕京大學與北京大學合併，新校址就設在燕京大學舊址上。”一所大學的歷史，化作一句話說明。
回望燕京大學，就不能不提司徒雷登，但是這位美國人給中國人最深刻的印象是毛澤東撰寫的《別了，司徒雷登》，他的形象被化作一個失敗的敵人，而真正的司徒雷登連同燕京大學一起消失了。青年學者陳遠通過探訪燕京老校友、查閱檔案，恢復了歷史上燕京大學的部分面貌，構成了其新作《燕京大學1919—1952》。儘管只存在了33年，但燕京大學卻是勘察中國現代史的一個生動標本。
1952，燕大之死
1951年2月12日，新政府接管燕京大學，國內的教會學校都開始和美國脫離關係，教育界掀起聲討美國文化侵略的高潮。思想改造就此開始。“三反”運動中，陸志韋首成靶子被鬥，清算從1月進行到3月，出面發言的包括教授、職員、學生、工役以及陸志韋的女兒，他們無一例外“徹底、無情地揭露陸志韋及其反動集團把持校政、忠實執行美帝國主義文化侵略的罪行”。國文系教師林燾撰文《沉重的回憶》稱：“到開全校師生員工揭發控訴大會時……發言顯然是經過精心安排的，上臺控訴的除我以外，還包括高名凱、吳興華和陸瑤華。高先生當時是國文繫系主任，是陸先生多年親手培養提拔的教授；吳興華是陸先生最為欣賞的才子型人才；陸瑤華則是陸先生的親女兒。安排這樣幾個人上臺控訴，目的顯然是讓陸先生感到已經‘眾叛親離’，無疑會對陸先生形成很大的精神壓力。”
由陸志韋開始，燕大的學者們一一接受思想改造，最有名的是張東蓀成了全國知識界的“反面標兵”。1952 年 3 月 13 日的中共中央《關於在高等學校中進行“三反”運動的指示》中強調 ：“在學校進行‘三反’運動，應該深入發動群眾，特別要依靠學生群眾推動教師。”學生被動員起來參加對教師的批判和鬥爭，監視教師日常舉動，揭發他們的私生活。
思想改造緊張的氣氛之後，黨中央和北京市委組織北大、清華、燕京三校的老師去青島休假，許多人很興奮。老師們回到北京，三校合併方案立刻公佈，燕京大學就此不復存在，資源被一分為八：機械系、土木系、化工系被調整到清華大學，教育系調整到北京師範大學，民族系調整到中央民族大學，勞動學系調整到中央勞動幹校，政治系調整到北京政法學院，經濟系調整到中央財經學院，音樂系調整到中央音樂學院，其餘各系調整到北京大學。而新北京大學的校址，便坐落在原燕京大學的校址上。當年的燕大校務委員會成員謝道淵告訴陳遠：“對於院系調整，由於剛剛經歷了思想改造運動， 燕京人倒是沒有表現出多少不同意見。”
司徒雷登回到美國後，被下了“禁言令”，晚年患了腦血栓，導致半身不遂和失語症，1962年9月19日在華盛頓病故。他的遺願是將骨灰埋在燕京大學校園內。燕大老校友蔣彥永說，傅涇波的兒子傅履仁想了很多辦法，才將司徒雷登骨灰空運到中國，原本要葬在燕大舊址的計劃已經獲批，後來又遭到反對而擱淺。2008年司徒雷登終被安葬在他的出生地杭州。司徒雷登在燕京大學期間，其夫人去世，被安葬在燕園的西南角，但那片地方解放後因為學校搞基礎建設而被剷平，夫人的墓地最終挪到什麼地方去了，至今無人知曉。
1、1922年，燕京大學女生在女子學院大門前合影留念
2、燕京大學女學生在聚餐。
3、1938年5月，燕京大學女子學院學生在進行舞蹈表演。
4、1941年，燕京大學女生在體育訓練。
5、燕京大學師生在野餐。
6、1931年，燕京大學女生在波逸德（Boyd）體育館裡上體育課。
7、1941年，燕京大學4名女生在宿舍裡看書。
8、1941年，燕京大學的女生在宿舍的公共休息室裡打乒乓球。
9、學習中的燕京大學女生。
10、1941年，燕京大學女生在體育測試。
11、1929年，北京市長何其鞏與司徒雷登同兩名燕京大學領導合影。
12、1941年，燕京大學女生在向外教報考體育測試。
13、1941年，走出宿舍樓的燕京大學的女學生。
14、宿舍內的信件欄。
15、宿舍內為學生專門設置的閱覽休息室。
16、當時的女生寢室。
17、燕京大學女生洗衣裳。
18、燕京大學女子籃球比賽。
19、燕京大學女子棒球隊。
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