以臨床熱點問題為導向
據WHO人口規劃署報告：世界範圍內不孕不育率高達10%；我國不孕不育夫婦超過1000萬對，自然流產率高達15%，出生缺陷發生率達5.6%，每年新增缺陷患兒約90萬。人類生殖健康問題已經面臨嚴峻挑戰！
為了解決諸多難題，北醫三院採用多學科交叉融合的方式，為生殖健康問題搭建了一個創新體系平臺。以六個大型研究中心（健康醫療大數據研究中心、醫學交叉學科研究院、分子影像學中心、智能醫學研究中心、屠呦呦創新藥物研究院、精準醫療研究院）為先導，北醫三院集中整合了北京大學醫學部、大數據研究院、信息科技技術學院、生科院、工學院、分子醫學研究所等幾十個研究學院的優勢資源，僅2009年至2015年，就完成了兩個北京大學985跨學科項目，一個科技部973計劃以及一個國家自然科學基金等跨學科重點項目。在這個過程中，北醫三院還建立了生殖生物學與生殖遺傳學平臺、人類生殖資源庫與雌性生育力維持及相關技術平臺等多個輔助生殖相關研究平臺，進一步保障了北醫三院生殖醫學中心的學術體系的完善性。
面對生殖細胞發育調控機制不清這樣的國際難題，中心率先系統開展人胚胎髮育調控的研究，研發植入前胚胎遺傳學診斷新方法，併成功實現臨床轉化。建立國際上首個女性個人遺傳圖譜，繪製人卵母細胞和植入前胚胎髮育過程轉錄組、DNA甲基化全景圖，全面解析卵母細胞和胚胎髮育調控網絡，為疑難病例診治提供科學依據。
由於全球生殖健康的嚴峻趨勢，中心建立了女性生育力維持和生殖準備研究平臺，提出生育力保護保存新策略，推動實施“凍存囊胚移植”的新策略，建立腫瘤病人卵巢組織保存庫，優化卵巢組織冷凍保存和移植技術，並制定生育力保護與生殖儲備的全國性戰略部署。
以科研平臺發展為基礎
科研服務平臺建設是科技取得重大發展的重要保障。
數據顯示，北醫三院生殖中心重點實驗室現有建築面積4000平方米，儀器設備總價值在人民幣5000萬元以上，共建立了七個研究平臺：女性生育力保護平臺、遺傳診斷分析平臺、生殖內分泌檢測分析平臺、輔助生殖技術平臺、不孕症相關疾病流行病學調查分析統計平臺、實驗動物操作平臺、幹細胞研究平臺，具備開展多方面實驗研究的資源和技術。
實驗室同時還建立了管理的電子化系統，對經費、儀器等實施統一管理，規範各種科研行為，提高工作效率。實驗室建立了規範的、一定規模的生殖資源標本庫，為生殖領域的多家合作單位共享，目前整體設施和研究條件已達到國際先進水平。
以人才隊伍建設為核心
對於一個成功的人才隊伍的建設，北醫三院的成功秘訣有以下幾點：
1.制定穩定和吸引優秀高水平人才的具體措施，引進學科頂尖人才，加快中堅力量培養，培養本學科中堅力量，培養學科帶頭人後備人選與青年骨幹。
2.通過輸送青年科技人員出國進修、合作、考察、訪問或參加國際會議，使科技人員開闊視野、提高業務能力。
3.開展與國際著名學術機構或知名學者合作交流，為青年學術骨幹進入國際前沿研究領域、提高學術水平創造條件。
4.建立相關培養機制，資助一批有潛力的青年學者到世界一流大學一流實驗室工作、培訓。
中心的學科團隊呈金字塔模型，其中科研PI8人，後備力量8人，青年學術骨幹15人，技術人員11人，管理人員5人，碩士研究生、博士研究生、博士後共40人。其中，有喬傑院士帶領團隊建立生殖內分泌及胚胎早期發育機制及遺傳學診斷，也有劉平教授帶領團隊進行輔助生殖技術的建立與應用，還有馬彩虹教授帶領團隊進行生殖障礙性疾病與生育力保護的研究。
以體制機制改革為動力
科技創新體系管理制度需要不斷革新，才能適應日新月異的科學技術發展需求。
北醫三院生殖醫學中心在對人才的管理上，著重引進高素質、多學科的複合型人才，建立具有吸引力的人才培育和激勵制度。在體系建設上，鼓勵解決臨床實際需要的科學研究，建立科研人員與臨床醫生協同創新機制。對於科研成果，則建立規範合理的獎勵制度，激勵科研人員創新積極性，得以確保醫學新成果、新技術的不斷轉化。
此外，北醫三院生殖醫學中心還把學科的發展安全管理視為重中之重，以便在體系中形成層次分明、責任明確的質量安全監控體系獎懲制度，消除科研及相關醫療安全的隱患。
同時，建立符合科技創新體系發展的評價標準，也是體制機制改革的重點內容。在這方面，北醫三院生殖醫學中心採用了應用態勢分析進行體系管理，避免既往常規評價體系的定量指標與定性指標分佈不均的問題，強調以水平和質量取勝，並且注重過程評價。
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