傳統中醫理論認為板藍根有清熱解毒、涼血利咽的功效，因此可以用於肺胃熱盛所致的咽喉腫痛、口咽乾燥等多種病症。目前研究表明板藍根含有多種有效成分，可發揮以下作用：
1、抗菌、抗病毒
體外試驗表明，板藍根抗菌譜很廣，對金黃色葡萄球菌、甲型鏈球菌、肺炎雙球菌、流感桿菌、痢疾桿菌等常見致病菌均有不同程度的抑制作用。因此板藍根能抑制引起急性扁桃體炎的葡萄球菌、肺炎雙球菌等致病菌。
2、 抗內毒素
鱟試驗法抗內毒素作用強度比較試驗證明，板藍根水煎液（100%，0.5ml）有抗大腸桿菌內毒素的作用。
3、抗炎
板藍根對致炎劑所致炎症反應有抑制作用，因此可針對多種急性炎症發揮療效，如急性扁桃體炎。
4、 增強免疫功能
板藍根中含有種類較多的多糖，這些多糖對特異性和非特異性免疫功能均有明顯促進作用。如提高白細胞數及淋巴細胞數，可對抗氫化可的松所引起的免疫抑制作用。
由此可見，板藍根適用於急性扁桃體炎，但扁桃體炎容易與咽白喉、猩紅熱等疾病相混淆，需及時就醫檢查確診後對症用藥，不宜自行用藥。
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