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這個問題乍一看似乎沒毛病，但仔細一想好像不太對。
該問題本身就有問題，“為什麼有些以城市命名的大學比以省命名的大學強許多？”
但是山東大學比濟南大學好，四川大學比成都學院好一樣可以舉反例。
那不如來看看全國範圍內的對比，一較高下。
全國34個省級行政區，北京上海重慶天津直轄市及港澳臺不列入，還剩下27個省級行政區。
27省市自治區對比（勝者加粗加下劃線）
黑龍江大學VS哈爾濱學院
吉林大學VS長春大學
遼寧大學VS瀋陽大學
河北大學VS石家莊學院
山東大學VS濟南大學
山西大學VS太原學院
內蒙古大學VS無
新疆大學VS無
青海大學VS無
西藏大學VS無
無VS蘭州大學
寧夏大學VS無
陝西均無
四川大學VS成都學院
湖北大學VS武漢大學
湖南大學VS長沙學院
河南大學VS鄭州大學
江蘇大學VS南京大學
安徽大學VS合肥學院
無VS南昌大學
浙江大學VS無
無VS福州大學
無VS廣州大學
海南大學 VS無
廣西大學VS南寧學院
貴州大學VS貴陽學院
雲南大學VS昆明學院
通過上述院校數據得出，以省命名的高校勝出有19個，以市命名的高校勝出有7個，陝西均無。
這樣看來結果已經很明顯了。
題目還可以換一個角度問題再問：“為什麼以省命名的高校比以市命名的高校強...”
強弱與否，都是經過漫長時間的合併、拆分，最後演變成現狀。題主所舉的例子也不恰當，武漢大學在民國時就名聲在外；而南京大學在民國時是“國立中央大學”；52年院系調整後，江蘇大學也脫胎於中央大學。
而且以省命名的大學在中西部地區大多是211院校，特別在邊疆地區基本都是，少數例外。
老馬談社會
先給出結論：目前僅有3所以省名命名的江蘇大學、湖北大學、河南大學實力不如以省會城市命名的南京大學、武漢大學、鄭州大學，其餘以省命名的大學均強於以省會城市命名的大學。具體詳情請看我細細道來：
中國共有34個省級政區，除了4個直轄市和2個特別行政區外，共有28個省及自治區。
在這28個省份中，有廣東、福建、江西、陝西、甘肅等5個省份沒有以省名命名的大學。具體緣由如下：
原陝西大學堂等5所學堂已於1912年合併組建並更名為西北大學；
原國立廣東大學已於1926年更名為國立中山大學；
原國立甘肅學院（前身為甘肅大學）已於1946年更名為國立蘭州大學；
原福建大學已於1951年併入原福州大學；
原江西大學與江西工業大學已於1993年合併組建並更名為南昌大學。
在剩下的23個省份中，均有以省名命名的大學，這些大學大多數源於清朝末期的1901-1902年按清廷御令成立的以省命名的大學堂，均是所在省份的最高學府，其實力和水平一般都高於以省會城市或省內其它城市命名的大學。
但是，目前有3所以省名命名的大學是例外，不如以省會城市命名的大學，它們分別是江蘇大學、湖北大學、河南大學，不如以省會城市命名的南京大學、武漢大學、鄭州大學。其主要原因如下：
一、南京大學與江蘇大學。南京大學的前身是國立中央大學，國立中央大學是當時中華民國的最高學府，1949年南京解放，南京當時為直轄市，所以將國立中央大學更名為南京大學，而不是江蘇大學。2001年，地處鎮江的原江蘇理工大學等三校合併組建為江蘇大學（鎮江市曾為中華民國江蘇省會），雖然江蘇大學的淵源可追溯到原國立中央大學的機械系，但其實力無法與南京大學相比。
二、武漢大學與湖北大學。武昌是辛亥革命的發源地，民國時期的武昌知名度遠高於湖北。1927年，國民政府將武昌、漢口、漢陽三鎮合為京兆區，定名“武漢”，作為中華民國臨時首都，國民政府在漢口開始辦公。1928年，將國立第二中山大學更名為國立武漢大學，成為民國時期最為著名的五所國立大學之一。1984年，原武漢師範學院改建為湖北大學，其實力無法與武漢大學相比。
三、鄭州大學與河南大學。地處開封市的國立河南大學是民國時期的46所國立大學之一，其實力在河南省位居首位，但在上世紀五十年代的院系大調整中，河南大學被肢解，實力被大大削弱。1954年，河南省政府從開封市遷至鄭州市，同時教育部在鄭州市組建了鄭州大學，經過幾十年的大力扶持，鄭州大學獲得了快速發展，其實力逐漸超過了河南大學。
其餘20個以省名命名的大學：包括河北大學、山西大學、內蒙古大學、遼寧大學、吉林大學、黑龍江大學、山東大學、安徽大學、浙江大學、臺灣大學、湖南大學、海南大學、廣西大學、四川大學、貴州大學、雲南大學、西藏大學、寧夏大學、青海大學、新疆大學等均比本省以城市命名的大學實力和水平都要強。
但是，還有一些以城市命名的行業性專科性大學的實力要強於以省名命名的大學，如哈爾濱工業大學強於黑龍江大學、大連理工大學強於遼寧大學、太原理工大學強於山西大學、合肥工業大學強於安徽大學，等等。其主要原因是這些以城市命名的行業性專科性大學大多是隸屬於教育部或其它部委的，得到了國家層面的強力支持，獲得了較好的發展；而那些以省名命名的大學隸屬於所在省，無法與它們相比。
和語濤聲
比較有意思的一個問題，國內不少院校是以省份命名的但是其綜合實力要比本省省份命名的院校實力要強很多。歸根結底其原因無非就是學校的發展比較好一些，建校時間較早、教育資源的支持力度大。搜尋了一部分我所知道的城市命名院校實力高於省份命名的大學：
像鄭州大學的實力遠高於河南大學的實力；
南京理工大學的實力遠高於江蘇理工大學；
南京大學的實力遠高於江蘇大學；
南京師範大學的實力遠高於江蘇師範大學；
蘇州大學的實力遠高於江蘇大學；
武漢大學的實力遠高於湖北大學的實力；
另外還有一些實力強勁的城市命名的院校：上海大學、廈門大學、蘭州大學、深圳大學等高校的綜合實力都是相當的不錯的。
考研字D
沒什麼可奇怪的。
省命名學校，大部分是省辦的。
省會城市命名，很多是中央部委辦的，所以會在城市與大學之間加上工業，科技等等。
當然也有例外：山東大學，四川大學，傳統繼承。
jack200351227
也有例外，浙大比原來的杭大好，山東大學遠強過濟南大學。不過一般以省命名的大學不是當地最好的大學，而當地最好的大學往往以市或大區乃至國字號命名。真實原因不清楚，只能揣測:南京大學僅僅是坐落於南京的大學，不是南京市大學。而江蘇大學就是江蘇省的大學，教育部直屬大學不太以省命名。
ben0791
你這小編，真有意思，大學命名和大學實力有必然聯繫嗎，照你這理論，現北京大學應該叫中國大學，清華大學應該叫華夏大學，叫北京大學還可以，起碼是首都，清華大學叫就慘了，清華這名字連個縣、鄉鎮都不是，豈不是民辦的了？！無知無畏
