1480年春賈尼別克汗病逝，由克烈汗長子穆倫德克汗繼任為哈薩克汗國第三任可汗（1480-1510），哈薩克汗國本營在阿拉套山.爭奪錫爾河地區,突厥斯坦地區的血戰開始了.。
穆倫德克為哈薩克汗國的可汗時，鬥爭尤為激烈。十五世紀七十年代初，昔班尼在帖木兒汗國穆罕默德.艾彌爾.木薩米爾讚的支持下，攻佔阿爾奎克和錫戛那克城。隨後，穆倫德克汗和馬合木提蘇丹率領哈薩克軍堅決反擊穆罕默德.昔班尼軍，並在卡臘套山腳大敗其軍隊，收復了錫戛那克城。昔班尼逃往曼格什勒克城，錫爾河流域諸城市又重歸哈薩克汗國。
1486年的錫爾河戰役哈薩克汗國重創昔班尼汗,將其趕到花剌子模。十五世紀八十年代，帖木兒汗國阿合買提.米爾贊蘇丹和東察合臺汗國可汗蘇丹馬合木提發生戰爭。昔班尼出兵援助東察合臺汗國，隨後又藉助東察合臺汗國的力量又重新攻佔了阿爾奎克和錫戛那克城。哈薩克汗國穆倫德克汗徵集大軍，圍攻錫戛那克城。該城百姓為穆倫德克汗打開城門，哈薩克軍攻入城中，於是錫戛那克城又歸屬哈薩克汗國。
1500—1510年穆罕默德.昔班尼在哈薩克汗國攻擊下，被迫遷到河中地區。在河中重新建立了他自己的王朝《烏茲別克汗國》。
昔班尼於1500、1501年攻佔了布哈拉及撒馬爾汗城，打敗了曾經幫助他的東察合臺汗國塔什干君主馬哈木汗及前來援助馬哈木汗的弟弟吐魯番汗王阿黑麻汗，打敗驅逐了巴布爾（後來印度莫臥爾帝國的創建者），逐步開始佔領原屬帖木爾汗國的河中地。而各地哈薩克部落紛紛歸附哈薩克汗國，使哈薩克汗國得以穩定和壯大。這是中亞歷史上的重大事件。哈薩克族成為七河流域和克普恰克的總名稱，而烏孜別克一詞成為穆罕默德.昔班尼遷入河中地區之後的各部落的總名稱；已為史學家廣泛使用。
烏茲別克人
為防止哈薩克汗國佔領河中地區，烏茲別克國統治者採取種種措施禁止哈薩克人與烏孜別克人交往，禁止哈薩克人到昔班尼汗王地區貿易，並搶劫哈薩克商人。穆罕默德.昔班尼對哈薩克人採取的種種措施，主要目的是不讓哈薩克人瞭解河中境內的情況。因為烏孜別克人居住的河中地區土地肥沃，人民生活富裕。昔班尼汗王擔心哈薩克人認為河中地是富裕之地後，會發兵佔領河中地區，引起戰爭，並危及自己的統治。所以穆罕默德.昔班尼采取了閉關鎖國政策，禁止與哈薩克人的一切交往。穆罕默德.昔班尼對哈薩克汗國實行經濟封鎖的同時，又對哈薩克汗國進行了所謂“聖戰”。昔班尼在其統治地區發佈詔令，宣佈哈薩克人為“非穆斯林”，宣揚“哈薩克人違背了真主的意願”、“所有針對哈薩克人的討伐都是無罪的”等等，號召花剌子模，烏茲別克人對哈薩克發起聖戰。
烏茲別克汗國積極準備向哈薩克汗國發動聖戰的時候，哈薩克汗國汗庭出現矛盾裂痕，賈尼別克汗之子哈斯木蘇丹起初作為臣屬效忠於穆倫德克汗，但後來哈斯木蘇丹取得了實際統治權。當他們的矛盾難以調和後，哈斯木汗就敬而遠之到了七河駐牧，而穆倫德克汗則住在札依克河（烏拉爾河）的薩萊楚克，哈薩克汗國處於分裂狀態。這給了昔班尼汗很好的機會。
烏茲別克汗國士兵
1503—1504年昔班尼率大軍攻入哈薩克汗國突厥斯坦地區，大肆搶掠。1505—1506年昔班尼又率領大軍從撒馬爾罕出發，繞過錫戛那克城侵入錫爾河流域的哈薩克各牧場，搶劫該地哈薩克人民的牲畜和財物。 當時錫爾河流域及其城市屬於賈尼別克汗之子賈尼什蘇丹。這次穆罕默德.昔班尼搶劫的哈薩克牧民全是賈尼什蘇丹的屬民。1508年賈尼什蘇丹三子阿合買提蘇丹為報復昔班尼汗王搶掠之仇，率五萬大軍進攻河中地，猛攻昔班尼汗王的首府撒馬爾罕城和布哈拉城。掠奪了許多財物和俘虜。
1509年阿合買提蘇丹率哈薩克人搶掠昔班尼汗王之後，穆罕默德.昔班尼大怒，於元月率徵召的10萬狂熱“聖戰”大軍征伐居住在錫爾河流域冬牧場的哈薩克人。當時賈尼什蘇丹也正在冬牧場，擁有部屬十萬人，兵三萬名。但由於賈尼什蘇丹毫無準備，在穆罕默德.昔班尼的突然襲擊下，分散居住在冬牧場的哈薩克人一時未能集中起來抗擊，因而損失慘重。賈尼什蘇丹三子阿合買提也在此次戰爭中被俘，後來被殺。
1510年昔班尼汗為徹底征服哈薩克汗國，開始了他的第四次“聖戰”遠征。他將主力指向哈薩克汗國的薩拉爾卡、烏魯套地區。這次哈薩克汗國有充分準備。在昔班尼率軍抵達烏魯套後，哈斯木蘇丹麾下名將“倔強的”哈森率領的先鋒部隊對其給予了迎頭痛擊，就在昔班尼勉強穩住陣線時，鐵木爾蘇丹、烏拜杜拉蘇丹又從側翼向昔班尼大軍發起了衝擊，昔班尼陣列頓時潰散，其軍隊大部被擊破或被殲，損失了全部輜重及給養的昔班尼只得後撤。在混亂地潰退至錫爾河畔的克斯葉涅附近時，昔班尼試圖收攏亂軍，重整軍陣，企圖發動反攻。但哈斯木蘇丹突然出現在其後方，而哈森的追兵也銜尾而至。陷入包圍的昔班尼大軍徹底崩潰，多數將領陣亡，昔班尼僅率數十騎突圍。昔班尼被逐出哈薩克境內。此戰，昔班尼汗實力受到巨大打擊。大約半年後，昔班尼便在與呼羅珊地區崛起的波斯“紅髮”沙赫.伊斯邁爾一世的戰爭中陣亡，顯赫一時的昔班尼-烏茲別克汗國幾乎瀕臨崩潰，繼任者被迫請求與哈薩克汗國停戰合談，使哈薩克汗國完全佔領河中地區和塔什干等重要城市。
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