康熙帝借三藩之亂進一步削弱了開國諸王的實力。與此同時，他重用直系皇族，皇子勢力空前膨脹，產生了九子奪嫡的局面，延續著雍正、乾隆時期。
一、康熙抑制開國諸王后裔
康熙十二年，吳三桂等漢族異姓王起兵造反。康熙帝令多位宗室為大將軍，率軍平亂，康熙帝對參戰的王公做出了以懲罰為主的評價。“勞師糜餉，誤國病民，情罪重大，在他人尚不可原，況王貝勒等國家同休慼之人乎？”簡親王喇布（濟爾哈朗孫）、順承郡王勒爾錦（薩哈璘孫）、貝勒尚善（舒爾哈齊孫）、察尼（多鐸子）、董額（多鐸子）、貝子彰泰（阿巴泰孫）、溫齊（舒爾哈齊曾孫）、鎮國公蘭布（尼堪）等王公皆被削爵。立下戰功的康親王傑書（代善孫）、安親王嶽樂（阿巴泰子）卻沒有得到任何封賞。大批開國諸王的後裔遭到嚴厲處罰，從政權的決議圈子中淡出。
同時，康熙帝控制了議政王大臣會議，議政王大臣會議一度是清廷的決策機構，由宗室諸王組成，能夠影響汗王（皇帝）的決議。康熙帝將爵位高的宗室擠出決策機構，刻意降低宗室的影響力。三藩之亂前，議政王共有親王、郡王五人，分別是安親王嶽樂、康親王傑書、順承郡王勒爾錦與福全、常寧，後兩人是康熙的兄弟，勒爾錦、嶽樂先後被罷議政，傑書去世後，康熙再也沒有遞補一位親王、郡王進入議政處，該機構名存實亡。
二、九子奪嫡
在打壓開國諸王后裔的同時，康熙帝重用近支皇族，皇子勢力膨脹，釀成儲位之爭。康熙帝的三個兄弟福全、常寧、隆禧都被冊封為親王；隆禧早逝，福全、常寧兩人能力平平，但是沒有權力慾，康熙帝刻意提升他們的地位壓制開國諸王后裔。諸子中，唯一的嫡子胤礽，週歲時立為皇太子。康熙出征時，太子臨時監國，“各部院奏章，聽太子處理；事重要，諸大臣議定，啟太子。”皇長子胤禔曾作為副帥討伐噶爾丹，皇十四子胤禵為撫遠大將軍出征西北，胤祐、胤俄（礻字旁）、胤祹分管旗務，胤禩、胤祹曾署內務府總管事。
康熙帝對太子的溺愛引發惡果，儲君權力極度膨脹，部分朝臣依附於太子，期望成為擁立功臣。皇長子胤禔年齡居長，也對皇位有非分之想。康熙其他兒子也牽涉到了皇位爭奪之中，分別是三阿哥胤祉、四阿哥胤禛、八阿哥胤禩、九阿哥胤禟、十阿哥胤俄、十三阿哥胤祥、十四阿哥胤禵。
一廢太子引發的儲君之爭。康熙晚年，胤礽權力慾望惡性膨脹，曾說“古今天下，豈有四十年之太子乎”，與康熙帝矛盾日益加劇激化。康熙四十二年，康熙帝囚禁處死了太子黨重臣索額圖，對太子進行警告，皇權與儲權矛盾徹底爆發，太子並沒有有所收斂，康熙四十七年第一次將太子廢黜。
大阿哥胤禔錯誤的判斷了形勢，認為“有嫡傳嫡，無嫡傳長”，認為胤礽被廢黜後儲君應該由自己擔任，積極謀求，被康熙拒絕胤禔轉而支持擁立同母所撫養的皇八子胤禩為嗣，並請求誅殺廢太子，康熙帝大感心寒。不久胤禔鎮魘皇太子之事被皇三子胤祉揭發，康熙帝將胤禔“著革去王爵，即幽禁於其府內”。胤禔政治生涯從此終結。同時，康熙帝將皇八子胤禩囚禁革爵，不久將其釋放，令諸大臣推薦新太子人選，試探諸皇子在朝臣中的影響力，結果多數大臣推薦胤禩。康熙自食其言，稱“允禩獲罪於朕、身攖縲紲。且其母家微賤。豈可使為皇太子”。諸皇子結黨令康熙帝大為震驚，他又想到了太子的種種優點，對廢太子心存幻想，認為其能改過自新，復立胤礽為太子。太子胤礽廢黜後復立，威信銳減；皇長子胤禔急於爭奪儲位，被囚禁至死；皇八子胤禩在群臣中展現出的名望令康熙帝不滿，基本無緣皇位。
二廢太子後的儲君之爭。康熙五十一年，太子再次被廢黜，被圈禁至死。與廢太子關係密切的皇三子胤祉，洞察到了政治鬥爭的殘酷性，不再謀求儲位；皇八子胤禩因死鷹事件激怒康熙帝，無緣儲位。“自此朕與允禩、父子之恩絕矣……此人之險、實百倍於二阿哥也。”
同母所生的四阿哥胤禛與十四阿哥胤禵是皇位最有力的爭奪者，十三阿哥胤祥是胤禛的支持者，八阿哥胤禩、九阿哥胤禟、十阿哥胤俄、十四阿哥胤禵是八爺黨的成員，隨著胤禩的失勢，轉而支持胤禵爭奪皇位。康熙五十七年，胤禵迎來了人生的巔峰，率軍出征西北，康熙去世後卻是皇四子胤禛稱帝，成為九子奪嫡的最後勝利者。胤禛與先祖皇太極一樣，在不被看好的情況下登上皇（汗）位，宗室中會掀起新一輪的血雨腥風。
三、雍正時期清廷宗室鬥爭
雍正與皇太極一樣對政敵刻薄至極。即位伊始，雍正冊封胤禩、胤祥為親王，拉攏政敵、親信以鞏固政權，並將將胤禵召回解除兵權。胤禩被封為親王，他和福晉（其嫡福晉是安親王嶽樂的外孫女）卻有清醒的認識，其福晉稱“有何喜可賀？恐不能保此首領耳！”胤禩也認為“皇上今日加恩，焉知未伏明日誅戮之意！其目下施恩，皆不可信。”夫妻倆都認為雍正帝對其進爵另有目的。胤禩夫婦的預感在不久後得到了印證，雍正帝從胤禩嫡福晉家族下手，將安親王嶽樂之孫吳爾佔、色亨圖、經希及其子移居盛京，除屬籍，後又以吳爾佔等怨望，不準承襲安郡王，安親王一派徹底沒落。隨後，雍正帝開始清理八爺黨成員。胤禩被削王爵，革除宗籍，胤禩死於宗人府。胤禟削宗籍，死於保定直隸總督署；十阿哥胤俄、十四阿哥胤禵被革爵囚禁。支持擁立胤禩爭儲的宗室都遭到不同程度的迫害，裕親王福全曾在康熙帝面前誇獎胤禩有才有德，其子保泰、孫廣寧都被雍正帝革除爵位；褚英長子杜度的後裔貝子蘇努被削爵黜宗室；豪格的後裔延信被幽禁；順承郡王錫保（曾晉封順承親王）由於包庇延信被奪親王俸祿，停郡王俸三年。三阿哥胤祉主動退出了皇位爭奪，也不是八爺黨成員，依然被雍正帝迫害致死。其子弘晟被削世子，囚禁在宗人府。雍正八年，怡親王胤祥去世，雍正帝以胤祉表現不夠悲傷將其奪爵囚禁。雍正帝還廢黜了其長子弘時（三阿哥，當時為最年長的皇子）的宗籍，清史對此諱莫如深，弘時“以年少放縱，行事不謹削宗籍死”。弘時被廢黜的真正原因是與胤禩交往過密，甚至支持胤禩的政治主張，不被其父容忍，“弘時為人斷不可留於宮廷，是以令為允禩之子。今允禩緣罪撤去黃帶，玉牒內已經除其名，弘時豈可不撤去黃帶，著計撤其黃帶，交與允祹，令其約束”。
與此同時，雍正擢升幼弟，既是為了洗刷屠戮兄弟的罵名，也是為了深化中央集權。胤祥是雍正帝的最有力的支持者，被委以重任，胤祥先後總理戶部與治理京畿水利，封為怡親王，世襲罔替。胤祿承襲莊親王爵位，莊親王由皇太極第五子碩塞系轉為康熙十六子胤祿系，胤禮被封為果親王，先後分管理藩院、工部、總理戶部三庫、戶部，是胤祥之後最受信任的宗室。雍正去世時，胤祿、胤禮受遺詔輔政。
四、弘晳案
乾隆四年，發生弘晳謀逆案，乾隆帝快迅速結案，結束了康熙以來儲位的鬥爭。弘晳是廢太子胤礽的嫡長子，是康熙帝的嫡長孫，對父親爭儲失敗耿耿於懷，得到了諸多宗室的同情。莊親王胤祿、弘昇（康熙第五子恆親王胤祺長子）、弘昌（怡親王胤祥長子）、弘晈（莊親王胤祿長子，本為次子，長子殤）、弘普（怡親王胤祥嫡長子）牽涉其中，這些弘字輩的宗室大多為長子或嫡子，支持皇位“傳長傳嫡”，對雍正、乾隆父子嗣位多有不滿。弘晳案是康熙晚年諸子爭位的餘波，乾隆只嚴懲弘晳本人，對其他宗室寬大處理，康雍乾儲位之爭告一段落。
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