- “雙一流”建設學科
東南大學（11個）：材料科學與工程、電子科學與技術、信息與通信工程、控制科學與工程、計算機科學與技術、建築學、土木工程、交通運輸工程、生物醫學工程、風景園林學、藝術學理論。
同濟大學（7個）：建築學、土木工程、測繪科學與技術、環境科學與工程、城鄉規劃學、風景園林學、藝術與設計。
- 一級國家重點學科
東南大學（5個）：電子科學與技術、信息與通信工程、建築學、交通運輸工程、生物醫學工程。
同濟大學（3個）：建築學、土木工程、交通運輸工程。
- 二級國家重點學科
東南大學（5個）：藝術學，熱能工程，控制理論與控制工程，計算機應用技術，結構工程。
同濟大學（7個）：海洋地質、工程力學、機械設計及理論、材料學、控制理論與控制工程、大地測量學與測量工程、環境工程。
- 國家重點（培育）學科
東南大學（1個）：機械製造及其自動化。
同濟大學（3個）：基礎數學、凝聚態物理、車輛工程。
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