1260年秋，阿里不哥率領大軍南下討伐忽必烈，但弟弟就是不如吃過漢文化墨水的哥哥，在忽必烈的精心部署下，阿里不哥的軍隊被打得大敗。 為了有喘息的機會，阿里不哥立即派使者去向哥哥“求饒”。使者對忽必烈說：“大汗，您弟弟知道自己錯了，他願意推戴您做大蒙古帝國的大汗，只求您能撤兵南歸！”
忽必烈聽後，沉默了一會說：“他是我的弟弟，只要他不沒事找事，我怎麼忍心置他於死地？你回去告訴他，南宋還沒有滅，大家應該齊心協力。只要他老實做自己的王爺，過去的事一筆勾銷。”於是，忽必烈留下一員大將留守，自己南歸。 但第二年的秋天，緩過氣的阿里不哥又率領大軍南下攻打忽必烈。這次，由於忽必烈方面準備不足，雙方進入相持階段。
但過了一段時間，阿里不哥方面糧草欠缺，而他的運糧隊又被西面的一個王爺給襲擊了。很是氣惱的阿里不哥決定要出兵西邊。 臨走時，阿里不哥知道自己走後，大本營肯定守不住。於是，他深情地對留守的人說：“我走後，這城你們肯定守不住。我哥來後，你們就投降吧。他看在大家都是自己人的份上，不會為難你們的。”阿里不哥帶兵西進後，忽必烈果然不戰而勝拿下了弟弟的大本營。 1262年冬，阿里不哥雖然打敗了西邊的那個王爺，但自己也大傷元氣。
後來，又發生了大饑荒，阿里不哥的部眾紛紛出走。走投無路的阿里不哥只好向自己的哥哥忽必烈舉起了雙手。長達數年的汗位之爭結束了。哈拉和林 哈拉和林簡稱和林，為窩闊臺所建，位於今蒙古國烏蘭巴托西面，是大蒙古帝國的首都和大本營，同時也是是當時世界上最著名最繁盛的大都會。忽必烈建元大都（今北京部分城區）後，哈拉和林成為和林行中書省治所。1368年，大都被明軍攻克後，為北元政權的首都。1370年，明軍攻克並燒燬了和林，蒙古諸部由此走向分崩離析，對明朝的威脅消失了。
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