1、深翻土壤，增施充分腐熟的有機肥
對土壤進行深翻是消除土壤板結、增加活土層的基礎。在深翻的同時，大量施入充分腐熟的有機肥，不僅可以給芸豆提供長效多元素的營養，同時還可以改良土壤結構，提高土壤理化性能，為芸豆的生長提供具有良好通透性和緩衝能力的土壤條件。
2、培育多根苗和護好幼苗根系
芸豆的基本根系是在育苗期形成的。育苗期間，培育根系發達的秧苗，並在育苗過程和移栽時，保護好這些根群，不僅可提高成活率，縮短緩苗期，也為早熟高產奠定良好的基礎。從護根的角度來看，因為芸豆根系木質化程度高，發生木質化時間早，傷根後難以再生，所以採用穴盤、營養缽、塑料筒或紙袋等容器育苗是非常必要的。同時，芸豆莖基部有生不定根的能力，尤其是幼苗，生不定根的能力強，不定根有助於吸收肥水， 因此，栽培上常有“點水誘根”之說，在栽培過程中，莖基部經常形成一些根原基，採取有效措施，創造適宜誘根的環境，促其根原基發育成不定根，有助於植株生長髮育。育苗期間的“煉苗”、 定植後的“蹲苗”都可以誘發新根的產生和深扎。
3、採用科學配方施肥技術
不同的肥料對根系的發生與發展作用是不一樣的。如腐殖酸影響根系的體積和下扎的深度；鈣直接影響根尖分生組織的成長；鋅決定根尖的生長速度；磷能促進根系細胞的分裂、增殖和伸展。
因此在苗床、栽培地施肥時都要注意施用優質可溶的有機營養嘉美紅利、腦白金。
4、注意保護好根系
根系在其生命過程中會因低溫、高溫、積鹽、肥燒和機械損傷等而受到傷害。低地溫時根系會發生寒根和漚根，可用嘉美紅利緩解；高地溫會使根系過快地衰老；土壤的高溶液濃度會使根尖和根毛受到損傷和抑制，使根系的吸收能力大大降低，可用嘉美紅利螯合吸附；施肥不當或不適宜的中耕鬆土可能會直接使根系受到損傷，可用螯合態有機活化營養套餐肥紅利、海力寶、贏利來等，活化土壤，保護根系，促進根系生長髮育。因此棚室芸豆的生產中，在深翻土壤、增施腐熟的有機肥的基礎上，適時播種、適期嫁接、定植、適時覆蓋和揭除地膜、採用科學配方施肥技術和中耕鬆土等，都是保護根系的重要措施。
5、及時促進受害根系的恢復
在棚室芸豆的栽培中，芸豆的根系一旦受到傷害，要儘快採取措施促使其恢復。要針對發生的病害種類選用適宜的藥劑進行灌根處理，同時加入海精靈生物刺激劑根施型促發新根。另外，在日常管理過程中可以使用惡黴靈或惡甲霜靈等預防病害的發生。
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