新型冠状病毒全基因组mNGS试剂盒重磅发布,助力疫情防控

自去年底以来,新型冠状病毒疫情成为中国乃至全世界的关注焦点,截至2月6日上午9点,全国已确诊感染患者28060例,疑似感染24702例,疫情形势十分严峻。

杰毅生物作为病原体分子检测整体解决方案的研发、生产和服务企业,积极承担社会责任,面对疫情快速响应。按照1月27日,国家卫生健康委员会办公厅、国家中医药管理局办公室发布《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第四版)》,RT-PCR和基因测序是新冠病例确诊标准。(相关报道点击链接)。

传统针对病毒基因测序检测(mNGS)是通过随机引物对于样本进行无差别的逆转录,然后将得到的DNA进行建库和测序。然而临床样本中,人源细胞背景高,同时病毒含量在不同样本中差别很大,当病毒载量较低时,基因组覆盖度往往较低,难以对病毒可能的变异进行全面的监控和溯源。对于此次新冠病毒,希望在鉴定病原体同时可以快速、低成本地最大限度获得病原体全基因组序列,这对于常规方式的mNGS来说挑战非常大。

鉴于此,杰毅生物的研发人员针对新型冠状病毒设计了全新的mNGS方案,在全面鉴定病原体的同时,特别设计了一系列新冠病毒特异性引物,并结合杰毅生物独特的PCR-free快速建库方法,推出了新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止测序法)。

新型冠状病毒全基因组mNGS试剂盒重磅发布,助力疫情防控

新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止测序法)

该试剂盒可以直接从临床样本开始操作,大大提高新冠病毒核酸富集效率,在和荧光定量CT<37确诊样本对比中,不仅阳性符合率比传统mNGS从87.5%提高到100%,基因组覆盖度更是最高达到99.8%

新型冠状病毒全基因组mNGS试剂盒重磅发布,助力疫情防控

本试剂盒与常规RNA-seq试剂盒“新冠病毒”高通量测序结果比较

除试剂盒外,该解决方案配备了Cubics™病原宏基因组一站式建库仪本地化数据分析软件,从临床样本至测序文库,全流程无人值守自动化,用时3.5小时。

新型冠状病毒全基因组mNGS试剂盒重磅发布,助力疫情防控

杰毅生物的新型冠状病毒全基因组mNGS解决方案

有以下特点

自动化

Cubics™一站式建库仪,具有4个独立反应通道,可放置在生物安全柜内无人值守地完成核酸提取、建库和纯化的全流程。样本进,文库出,有效杜绝样本间交叉污染和实验人员的感染风险;

速度快

从临床样本(咽拭子、痰液、肺泡灌洗液)至文库耗时3.5小时,从核酸至文库耗时3小时,显著提升“新冠病毒”高通量测序的时效性(常规方法建库耗时9-11小时)。测序数据分析在本地自动化运行,耗时1小时左右;

成本低

在每个样本测序20M(两千万条)序列,75bp读长的条件下,“新冠病毒”基因组覆盖度最高可达99.8%,显著提高测序仪利用率,降低测序成本;

覆盖广

除“新冠病毒”外,可同时检测样本中16000余种DNA病原体(细菌、DNA病毒、真菌、寄生虫等),对临床重症患者提供精准和全面的感染诊断。

拥有这一最新利器组合,临床工作者可以在18小时内完成病原宏基因组检测,并高效地获取新型冠状病毒的基因组序列信息,对研究分析病毒的进化来源、致病病理机制、病毒变异的情况以及人与人之间传染的能力评估是至关重要的。

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