3.免疫防治 虽然消灭蚊虫是控制乙脑的有力措施，但要完全消除蚊虫的滋生是不可能的，破坏蚊这种节肢动物传播性疾病的感染循环，这是有利于管理的好办法，但乙脑病毒可在多种蚊体内繁殖，并且感染形式随地方生态而变化，想控制这种昆虫很不实际。因此，唯有大规模地接种高质量的乙脑疫苗，才是最有效的预防和控制措施、只有这样才能最大限度地降低乙脑发病率。乙脑病毒的抗原性十分稳定，尚未发现在免疫原性方面明显不同的型或亚型，这为乙脑的特异性预防提供了坚实的基础。目前乙脑疫苗主要有三类：灭活疫苗、弱毒活疫苗和基因工程疫苗。乙脑基因工程疫苗主要有亚单位疫苗、核酸疫苗和活病毒载体疫苗三种。
疫苗预防：在蚊虫活动前1～2个月，即每年的3～4月份防控接种疫苗时间最佳，对后备和生产种公猪及种母猪用乙型脑炎弱毒疫苗或油乳剂灭活苗进行免疫接种，第一年以两周的间隔时间注射两次，以后每年注射一次。
4.防止继发感染 病猪一般无特效疗法，用抗菌类药物防止继发感染可提高自愈率。但在治疗的同时要做好工作人员的防护工作。
治疗原则：降低颅内压、调节大脑机能、解毒、防脱水、镇静、退热镇痛和抗生素治疗等综合治疗措施。此病主要造成种猪繁殖障碍，以疫苗预防为主，治疗为辅。
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