商代隸定國，稱桃林。周代為畿內地，錄虢國(北虢)，稱“渭汭”。春秋時稱桃林塞，隸晉。晉侯使詹嘉處暇守此防秦。戰國，秦厲共公二十四年(前453)隸魏。 秦惠文王六年(前332)，設寧秦縣， 屬寧秦縣轄地。漢高祖五年(前202)，設船司空衙門，專管黃、渭河水運、船庫。後以船司空官名為縣名，隸京兆尹。新莽始建國元年(9)，改船司空縣為船利縣，隸後承烈郡。 東漢複名船司空縣， 隸司隸校尉部。 建安十八年(213)，船司空縣併入華陰，隸京兆尹。後經三國、魏、晉275年均屬華陰縣。北魏永熙三年(534)，屬定城縣(治所在今公莊村北之定)，隸華州華山郡。西魏時定城縣併入敷西縣，直至北周。
隋開皇三年(583)，屬敷西縣隸華州。大業三年(607)改隸京兆郡。五年(609)改敷西縣為華陰縣，潼關屬之。唐垂拱元年(685)，華陰縣改稱仙掌縣，天授二年(691)分仙掌縣東部(潼關)設潼津縣，隸虢卅。聖歷二年(699) 三月，改屬太州(治所在今華縣)。長安二年(702)撤潼津縣，併入仙掌縣。
神龍二年(706)複名華陰縣，本縣屬之。 後經五代、宋、金、元約670餘年，均屬華陰縣。明洪武七年(1374)設潼關守禦千戶所，屬陝西都司。九年(1376)，設潼關衛，屬河南都司(明顧祖禹著《讀史方輿紀要》說洪武三年設潼關衛)。永樂六年(1408)，屬中軍都督府。
清雍正二年(1724)撤潼關衛，五年(1727)，設潼關縣。乾隆十三年(1748) 改設潼關廳，屬陝西潼商道同州府。 民國二年(1913)廢廳，設潼關縣，屬陝西省關中道。二十二年(1933)， 屬陝西省。二十八年(1939)屬陝西省第八區行政督察專員公署(治所在大荔 縣)。三十六年(1947)屬陝西省第二區行政督察專員公署(治所在華縣)，直至解放。
1949年5月29日潼關解放，本縣屬渭南專員公署，隸陝甘寧邊區政府。1950年5月，屬渭南專員公署，隸陝西省人民政府。1956年10月，渭南專員公署撤銷後，直屬陝西省人民政府，1958年12月本縣與渭南縣合併後，設潼關人民公社， 屬渭南縣，隸陝西省人民政府。1961年8月15日恢復潼關縣制，屬渭南專員公署(1979年改稱渭南地區行政公署)，隸陝西省人民政府，至今。
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