抗菌药物替代的途径和方式较多。比如，如何通过减少猪腹泻来降低抗菌药物的使用。一方面要重点改善养殖环境，另一方面创新饲料加工工艺。通过饲料膨化，将淀粉等营养物质降解以后再喂猪，有助于消化，减少腹泻。
还有一种途径是发酵，发酵饲料里面本身就有益生菌，还有乳酸菌、芽孢杆菌、酵母菌等。
添加以后可以消除抗营养因子，或产生次生代谢物，也是一种功能性的物质，能在猪肠道内产生非反式脂肪酸，从而起到抑菌的作用。
以饲料添加剂添加来减少抗生素使用的途径也非常多。酶制剂、酸化剂和中草药提取物均是有效方式。
用益生菌替代抗生素的方式也较常见，猪场、饲料厂、药厂可以根据自己的条件来选择抗生素的替代品。
比如，由光合菌、酵母菌、乳酸菌、放线菌和芽孢杆菌等5类菌类组成的益生菌，添加以后，对植物性原料豆粕里面的抗营养因子有降解作用，还会产生一些次生代谢物，对动物的生长有好处：
① 对猪肉品质的影响。从试验组和对照组的数据可以看出，喂了上述5类益生菌以后，无论是猪肉的色彩、黏度、弹性、气味以及煮出来的肉汤，都明显好于对照组。
它的作用机理：5类益生菌添加以后可以产生非反式脂肪酸，产生乳酸，这些对肉质都有明显的直接作用。
② 对腹泻的影响。这五种混合的益生菌添加以后，显著降低猪的腹泻率。而且，加了益生菌以后，料肉比降低。
还有一些功能性饲料添加剂，如牛磺酸。牛磺酸具有调节免疫系统，稳定细胞膜和抗氧化等功能。在畜禽养殖中，牛磺酸具有改善生长、繁殖性能，改善免疫力等作用。
过去由于牛磺酸合成成本较高，畜牧生产中的应用受到限制。现在随着合成技术的进步，成本降低了很多。每吨饲料里面，添加300—600克牛磺酸，成本只需20块钱。因此，它在替代抗生素方面具有较好的应用前景。
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