微波武器是利用高能量的電磁波脈衝毀傷目標的新概念武器。由於微波束武器不是像常規武器那樣靠化學能驅動的彈頭或碎片打擊目標，而是靠以光速傳播的射頻電磁波能量打擊目標，因而它被稱為“射頻武器”。
微波的波長範圍在1mm-1m之間，絕大多數的雷達、通訊、導航信號都在這個波段，沒有這些電子設備，人類戰爭將倒退至少100年。
米格25的“狐火”雷達可以看作原始的微波武器，它有600千瓦的峰值功率
微波武器對目標造成的毀傷程度主要取決於後者所接受到的微波能量， 微波武器按能量密度可以把殺傷效果分為三個層次：干擾、滲透、毀傷，現分別加以闡述：
一是干擾。微波功率較小時，可以干擾相應波段的雷達、通訊等需收發信號的設備工作，這些設備雖然可能有外罩保護，但為了收發信號，罩體必須做成透波的，這就為微波攻擊提供了窗口。根據實驗，微波能量密度達到0.01微瓦/平方釐米到1微瓦/平方釐米時，可使相應波段雷達癱瘓，但對這個能量密度，金屬罩體仍可以有效屏蔽，因此後端的顯示、處理等設備仍可運作。
二是滲透。當微波武器的能量密度提高到10瓦/平方釐米到100瓦/平方釐米時。金屬罩子都不管用了，根據麥克斯韋電磁場理論，凡是處在強微波輻射形成的瞬變電磁場中的任何金屬物體，都會在其表面產生感應電流，其可通過天線、線纜和小於微波波長的縫隙進入設備內部，就像水一樣無孔不入，造成破壞。當感應電流較低時，會使電路功能混亂。如出現誤碼、抹掉記憶或邏輯混亂等情況；當感應電流較高時，還會造成電子系統內的某些敏感器件永久性損傷。且其高劑量的電磁輻射還可干擾人的神經系統，造成紊亂。
微波在這個能量密度產生的熱效應還可以無視防禦和裝甲直接燒傷內部的工作人員， 當功率密度為20W/cm2時照射2s，可造成三度燒傷；當功率密度為80W/cm2時，僅1s就可使人喪命。
微波爐的機理就是將微波能轉換為熱能
三是直接的物理毀傷。功率極高時，可以用微波的熱效應對目標產生直接殺傷效果，使目標受熱而變形、毀壞，引爆導彈的戰鬥部甚至燃料，但這種效應需要巨大的能量，只有核爆炸的電磁脈衝才能滿足要求。
微波武器又可分為微波波束定向能武器和電磁脈衝彈兩種，前者需要高增益定向天線，可以重複使用。後者利用了爆炸時的電磁脈衝效應，僅能一次性使用。
尤其是電磁脈衝導彈的應用前景很廣。它是在導彈的戰鬥部中安裝上高能電磁脈衝發射器以及輻射天線，利用高能炸藥爆炸壓縮磁通量的方法瞬間釋放高能電磁脈衝，這種將導彈與微波武器合而為一的電磁脈衝導彈，使新概念武器與傳統武器有機結合，各取所長，將會是微波武器的主要形式。
微波武器與導彈，是互補而非競爭
F22的APG77有源相控陣雷達就具備電子干擾能力
微波武器所用頻率比激光武器高，根據波粒二象性，前者趨向于波，後者趨向於粒，微波衍射和繞射效果更明顯，並且是新概念武器中少有的非直射武器，可以繞過障礙物進行殺傷，這在一定程度上減小了能量損耗。
微波武器與激光武器相比，其波束寬得多，不必像激光、粒子束武器那樣精確跟蹤、瞄準，可以打擊更大範圍的目標。受氣候影響更小，能量衰減更慢，作用距離更遠。這些特點決定了它比激光武器的難度低得多，更容易實用化，極有可能率先進入戰場。
另外，當代隱形飛機的隱形機理都是將吸收的微波能量轉換為熱能再加以冷卻，但微波武器發出的高能電磁波已經遠遠超過了隱形飛機的這種“吞吐能力”，機體會由於過量吸收微波能量而產生高溫，輕則因瞬間加熱而使機體變形，重則整架飛機都會被燒燬、熔化。微波武器簡直是隱形飛機的天然剋星。
只有微波武器能夠從原理上剋制隱形飛機
微波武器是信息戰時代的大殺器，誰先在這個領域獲得突破，誰就能取得制信息權，使戰場對自己單向透明。而且以核爆炸驅動的戰略電磁脈衝武器，可對更大範圍內的一切電子設備造成破壞，使對手瞬間癱瘓，威力巨大，從這個意義上說，微波武器才是名副其實的殺手鐧。
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