根據非洲疾病控制與預防中心的數據，截至4月6日，共有51個國家報告新冠肺炎確診病例9198例,其中死亡病例414例，治癒病例813例。非洲大陸僅有科摩羅、萊索托以及聖多美和普林西比3國尚未出現確診病例。
據《法國西部報》報道，到目前為止，非洲受疫情影響程度比中國，南歐和美國要更輕，但與這些國家的貿易聯繫仍然導致非洲遭受了重大的經濟影響。
2020年3月19日， 一位馬裡研究人員在巴馬科臨床研究中心對新型冠狀病毒進行了相關測試，4月6日星期一，非洲聯盟根據測試結果發佈的一項研究表明，新型冠狀病毒的傳播可能在非洲造成災難性後果，例如失去2000萬個工作崗位或增加債務，而如果這種情況持續下去，在非洲的各部門中，將有近2000萬個工作崗位損失的威脅，尤其是在經濟嚴重依賴旅遊業或旅遊業的國家，其石油生產也會受到威脅，隨著病毒的傳播，石油價格的下跌將對尼日利亞或安哥拉等國產生深遠的影響。
非盟組織這份長達35頁的研究報告提出了兩種可能情況。一種預測較為樂觀，它預計疫情將持續到7月，而非洲並不會受到太大影響；而另一種預測是疫情可能持續到8月，並且使非洲大陸遭受更大的打擊。但無論何種推測，在這兩種情況下，非洲的經濟增長均為負數，分別為-0.8％和-1.1％，而與之相比的是，在病毒尚未蔓延到非洲大陸之前，非洲開發銀行預計2020年非洲總體經濟將增長3.4％。
塞內加爾總統發言人近期曾表示：隨著收入的下降，非洲各國政府別無選擇，只能轉向國際市場，這可能會導致債務飆升，同時非洲大陸的進出口可能會下降35％，即約2700億美元（2590億歐元）。另外一些非洲領導人也預見到了這一困難，埃塞俄比亞總理阿比·艾哈邁德3月份曾提出呼籲，要求20國集團減輕非洲國家的債務，並制定一項1500億美元的緊急財政援助計劃。他呼籲非洲聯盟委員會領導這項談判，以取消或者減輕非洲的外債總額（計為2360億美元）。
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