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3月7日我們對癲癇耐藥性相關的一篇Meta分析文獻進行了復刻,這一篇我來帶你一步步實現它!
1.下載安裝R語言和Rstudio
R是用於統計分析、繪圖的語言和操作環境。R是屬於GNU系統的一個自由、免費、源代碼開放的軟件,它是一個用於統計計算和統計製圖的優秀工具。
RStudio是一款R語言的IDE,R自帶的環境操作起來可能不是方便,而Rstudio很好地解決了這個問題,而且它還具有調試、可視化等功能,支持純R腳本、Rmarkdown (腳本文檔混排)、Bookdown (腳本文檔混排成書)、Shiny (交互式網絡應用)等。
by:簡書YUENFUNGDATA
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R下載地址:https://www.r-project.org/
Rstudio: https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
2.相關包的安裝
<code>library(meta)/<code>
3.數據導入
提前在Excel中整理好數據,保存為csv格式!設置文件路徑(文件夾目錄)。
利用read.csv函數讀入已整理數據!
<code>setwd("C:/Users/")##設置文件路徑/<code><code>read.data "meta-data.csv")#打開csv文件/<code>
4.具體分析
<code>meta.2 <- metabin(AG.Events,AG.n,AA.Events,AA.n,/<code><code> data=read.data,sm="OR",studlab = Study)/<code>
讀取文獻得知,文獻中用的是OR的隨機模型。設置sm為OR。
5.繪圖
分別用forest()函數和funnel()繪製森林圖和漏斗圖
<code>forest(meta.2)/<code><code>funnel(meta.2)/<code>
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森林圖
漏斗圖
結束!累吐血了,我的腦細胞啊啊~~~
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