因“初步發現中成藥雙黃連口服液可抑制新型冠狀病毒”，中國科學院上海藥物研究所（下稱“上海藥物所”）陷入輿論風波。
上海藥物所長期從事抗病毒藥物研究。2003年非典來襲，《首都醫藥》雜誌等信息發佈渠道曾發文稱，上海藥物研究所研究證實，“潔爾陰洗液具有抗SARS冠狀病毒作用”。
此次新型冠狀病毒感染的肺炎疫情發生後，上海藥物所成立了應急攻關團隊，公佈了30個可能的抗2019-nCoV冠狀病毒老藥和中藥，並與前沿生物藥業針對抗2019-nCoV新藥開發達成了合作。
2月1日，中央指導小組醫療小組專家、中國工程院院士張伯禮在接受央視新聞採訪時表示，雙黃連口服液只能起到調節體內狀態的作用，對（新型冠狀）病毒並不具有針對性。
當晚，中科院上海藥物研究所在官網發表聲明稱，由中科院上海藥物所、武漢病毒所1月31日向媒體提供的《上海藥物所、武漢病毒所聯合發現中成藥雙黃連口服液可抑制新型冠狀病毒》一文，內容準確無誤。上海藥物研究所新聞發言人表示，“這一結論是基於實驗室體外研究的結果。研究團隊通過實驗室體外試驗證明，雙黃連有抑制新型冠狀病毒作用，下一步還需通過進一步臨床研究來證實。我所提供的稿件中也提到目前正在開展臨床研究”。
曾稱“潔爾陰”能抗SARS病毒活性
據官網介紹，中科院上海藥物研究所前身是國立北平研究院藥物研究所，創建於1932年，次年遷至上海，2003年搬遷至浦東張江高科技園區，是國內歷史最悠久的綜合性創新藥物研究機構。
作為一家長期從事抗病毒藥物研究的研究所，在17年前的非典疫情中，上海藥物所曾表示“潔爾陰”也具有抗SARS冠狀病毒作用。
《首都醫藥》雜誌2003年第12期《潔爾陰洗液在抗SARS方面的研究成果》一文就提到，“潔爾陰洗液抗擊SARS病毒作用，經中國科學院上海藥物研究所國家新藥篩選中心最新研究證實：其體外在1:100濃度下即具有抗SARS病毒活性”。
資料顯示，《首都醫藥》是北京市藥品監督管理局機關刊物，是北京市藥品監督管理、醫藥衛生工作的指導性刊物。
公開資料顯示，“潔爾陰”主治清熱燥溼，殺蟲止癢。目前，“潔爾陰”洗液的廠商成都恩威集團官網上仍保留著該篇報道。
在此次新型冠狀病毒感染的肺炎疫情發生後，上海藥物所也沒缺席，組建了應急攻關團隊，利用前期抗SARS藥物研究積累的經驗，公佈了30個可能的抗2019-nCoV冠狀病毒老藥和中藥。此外，據前沿生物藥業（南京）股份有限公司1月30日消息，該公司與上海藥物所針對抗2019-nCoV新藥開發達成了項目合作。根據協議，前沿生物取得抗冠狀病毒候選新藥DC系列在中國大陸地區臨床開發、生產、製造及商業化的獨家權利。
1月31日晚，有媒體報道，中國科學院上海藥物所和武漢病毒所聯合研究初步發現，中成藥雙黃連口服液可抑制新型冠狀病毒。
不過，該發現隨後遭到質疑。2月1日，人民日報官博表示，抑制並不等於預防和治療，提醒“請勿搶購自行服用雙黃連口服液”。
同日，中央指導小組醫療小組專家、中國工程院院士張伯禮接受央視新聞採訪時表示，雙黃連口服液就是一種普通的中成藥，主要成分是金銀花、黃芩、連翹三味中藥，這些中成藥只能起到調節體內狀態的作用，對（新型冠狀）病毒並不具有針對性。
上海藥物所在接受媒體採訪時亦表示，僅做了一個初步驗證，對病人是否有效還需要做大量實驗。
除了從事研究工作，上海藥物所也對外投資公司。
天眼查數據顯示，上海藥物所曾先後投資了10家公司，涉及中藥製造、醫學諮詢、保健產品、生物科技等領域。
目前，多家公司處於已註銷的狀態，經營狀態為存續和在業的公司分別是上海創藥投資有限公司和北京華世天富生物醫藥科技有限公司，上海藥物所的投資比例分別為100%和9.4%。
合作企業曾涉嫌發佈虛假廣告
官網顯示，上海藥物所一直以來與藥企都有開展項目合作。
其長期合作伙伴之一的上海綠谷製藥有限公司曾飽受質疑。綠谷製藥官網顯示，綠谷製藥成立於1997年，與上海藥物研究所關係緊密。上海藥物研究所是綠谷製藥長期的核心戰略合作伙伴，綠谷製藥在上海藥物研究所設立了“綠谷創新基金”，用於支持新藥研發。此外，綠谷製藥的科學決策委員會包括上海藥物所第六任所長（2004年至2013年）丁健和學術委員會副主任耿美玉。天眼查顯示，目前丁健為綠谷製藥的副董事長，耿美玉在2015年4月至2018年9月期間擔任綠谷製藥的董事。
也有證據表明，兩者不僅是合作伙伴的關係。
上海藥物所官網2015年和2017年刊登的兩篇媒體報道指出，綠谷製藥是上海藥物所與綠谷集團合辦的合資製藥企業。天眼查顯示，上海藥物研究所在2018年6月20日退出了綠谷製藥的投資人行列，目前綠谷製藥由綠谷集團100%持股。
公開資料顯示，綠谷集團以售賣保健品發家，由綠谷製藥的董事長呂松濤於1997年成立，其一款主打的保健品曾涉嫌違規宣傳。
2008年1月，中央電視臺曾播出了揭秘“綠谷”騙局的報道。報道稱，從1996年開始，綠谷集團先後推出了三代所謂的抗癌產品，分別是中華靈芝寶、雙靈固本散和綠谷靈芝寶。綠谷集團10餘年不斷變換名稱虛假宣傳，且在沒有審批的情況下擅自發布產品廣告，成為彼時近十年來全國最典型的系列虛假廣告宣傳案之一。
報道稱，經藥監部門查實，在綠谷集團一系列的抗癌產品廣告中，引用了大量的科研機構、專家學者等對先後三代產品的所謂抗癌效果進行宣傳。其中在宣傳綠谷靈芝寶時，廣告中曾提到“中國科學院上海藥物研究所通過體外實驗證實，綠谷靈芝寶對人體實體瘤和白血病、淋巴瘤細胞具有明顯的抑制作用”。
被央視曝光的次年，解放日報一篇報道指出，綠谷製藥就與上海藥物所簽訂了總金額數千萬美元的合同，獲得“GV-971”的全球開發許可權，而那時綠谷製藥的年銷售收入只有1000萬元。
這一研究歷經10年，2019年11月初，國家藥品監督管理局有條件批准了綠谷製藥治療阿爾茨海默病新藥——九期一?（甘露特鈉，代號：GV-971）的上市申請，主要發明人是耿美玉團隊。
2019年11月29日，一篇署名為“饒毅”寫給國家自然科學基金委員會主任李靜海的信函流出，指出耿美玉有關藥物GV-971的論文涉嫌造假。隨後，饒毅向媒體表示“沒有發出，有過草稿”。國家自然科學基金委則向媒體表示，正在調查核實此事。
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