多年磨一劍!
興農豐華數字育種雲平臺
隆重發布!
興農豐華經過多年一線調研、研發、試用反覆打磨的「 」(點擊藍字瞭解詳情)上線啦!
本文重點給大家介紹一下平臺的一個創新功能模塊:
現代工程化育種制勝加速器--分子輔助育種系統!
一、分子育種現狀
- 玉米新品種選育需要經歷多年,從幾萬甚至幾十萬個個體中進行篩選,數據信息的採集、管理和分析工作量巨大;
- 分子育種數據呈爆炸式增長;
- 缺少適應我國玉米育種流程,能夠整合利用分子標記的輔助育種系統,因此,需要一整套、成系列、易兼容的工具才能支撐大規模且高效的新品種選育。
二、興農豐華分子輔助育種系統簡介
確定育種目標如高產,通過訓練群體估計分子標記遺傳效應建立模型,然後將模型應用在育種群體中,估計出育種值,最終做出組配選擇。
1. 數據補全
MAF控制:無效位點的剔除
singRate:無效樣本的剔除
Imputation:缺失數據的填補
2. 簡單分析標記篩選
3. 預測育種值
數據:50972*278
整體的70%為訓練樣本
整體的30%為驗證樣本
準確率r=0.71
4. 組配分析
↑↑↑主成分分析
↓↓↓遺傳距離分析
聚類分析
三、服務優勢
- 預測準確率高,可實現對育種中產量、株高、花期等重要農藝性狀進行預測。
- 節約企業成本,隨著育種分子數據增加,高效利用閒置的數據,有效縮小育種規模。
- 提高育種效率,傳統育種通過自交系選組,組合測配代代篩選,利用分子輔助育種可在數小時內對品種進行篩選,大大提高育種效率。
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