關鍵詞:新型冠狀病毒病;流感;複查;Hanson解讀
3月2日,我們曾發佈了美國病毒科學家Trevor Bedford博士通過推特發出的警告:美國已經發生了為期六週的隱秘傳播(見:隱秘傳播)。實際上,Trevor Bedford所在的西雅圖流感研究所(Seattle Flu Study)是最早發現美國華盛頓州社區傳播並提出警告的研究中心;而其一連串的吹哨過程,同樣無比艱難。
近日,為了回覆關於新冠肺炎傳播的謠言,Trevor Bedford博士在推特上公佈了其研究結果,用充分的證據否定了“美國2019年秋天即已經爆發新冠病毒蔓延”的這一說法,並捋清了美國新冠病毒的播散史。
(來源:https://twitter.com/trvrb/)
該研究的關鍵方法
上面這部分推特內容直接說清楚了,
目的:
驗證關於新冠肺炎於2019年即在美國傳播開的說法是否是準確。
樣本:
西雅圖流感研究所保存的樣本,時間從2020年1月到3月10日。所有樣本均來自於有流感樣症狀的患者。其中2020年1月有3600份,2月有3308份。
方法:
通過新型冠狀病毒核酸檢測所得生物遺傳學,尋找新冠肺炎感染的證據,及尋找檢測到病毒之間的遺傳學關係。
主要結果
如下圖,該研究所樣本庫中發現的首例樣本是2020年2月21日。
(來源:https://twitter.com/trvrb/)
1),2020年1月所有3600個樣品中,沒有任何患者感染新型冠狀病毒。
2),2020年2月3308個樣本中,有10名流感樣症狀患者新型冠狀病毒核酸陽性,最早患者樣品為2月21日。
(來源:https://twitter.com/trvrb/)
3),這些患者還合併其他呼吸道病毒感染,如包括流感,RSV,鼻病毒,偏肺病毒和季節性冠狀病毒(季節性冠狀病毒通常是引起30%普通感冒的原因)(如上圖)。
(來源:https://twitter.com/trvrb/)
4),對病毒之間的遺傳學關係研究發現了其遺傳學變化及突變鏈。如下所示
(來源:https://twitter.com/trvrb/)
目前已經查到了數百種病毒變異,在美國最早新冠病毒出現在一月;同時,使用病毒譜系中觀察到的遺傳變化的數量也可以推測其共同祖先的日期。
5),同時可以看到,在美國檢測到的病毒的來源有多種途徑,1月下旬來自於中國,2月份則多來自於歐洲。
(來源:https://twitter.com/trvrb/)
結論
總結Trevor Bedford得出的主要結論,
1),西雅圖流感並非新冠病毒所致,西雅圖地區新冠肺炎社區廣泛傳播可追回到了2月份。
2),在美國最早新冠病毒出現在一月。
3)在美國檢測到的病毒的來源有多種途徑,1月下旬來自於中國,2月份則多來自於歐洲。
西雅圖流感研究所艱辛吹哨史
早在2020年1月底,獲知美國首例確診冠狀病毒出現在美國西雅圖(美國首例新型)之後。西雅圖流感研究所的傳染病專家,西雅圖流感研究所負責人海倫·Y·朱(Helen Y. Chu,華裔)博士憑著自己職業敏感性,即提出疑問“這個人感染了其他人嗎?致命病毒是否已經潛伏在其他社區並在傳播?”
當時他們通過自己的技術和研究生保存用於做流感研究的樣本,檢測到了一例未曾被報道的COVID-19患者。
但聯邦和州官員說,
由於沒有得到研究對象的明確許可,實驗室也未獲得臨床工作認證,該流感研究不能被再做任何COVID-19研究。
這個片段是否似曾相識?
儘管研究所認為,在關乎眾多生命的緊急情況下,應該有更大的靈活性。
但在後面的週一晚上,州監管機構要求他們完全停止測試。
海倫·朱博士不斷上交申請,要求獲得批准,使研究所能夠監測新冠病毒。包括在此期間,前疾控中心高級官員斯科特·道威爾(Scott F. Dowell)博士也向疾控中心負責應對冠狀病毒的主管尋求幫助。
答案仍然是:No.
2月24日,隨著新的病例開始在美國出現,美國CDC提供的試劑盒出現了嚴重質量問題;但類似西雅圖流感研究所這樣的科研機構仍然無法獲得檢測授權。
海倫·朱博士及其同事無法等下去,他們繼續做了檢測,並且再次發現一例確診病例。然而卻面臨著艱難的選擇:如果報告,意味著研究所的違規檢測曝光,可能對於之前已經被警告過的研究所是災難性的。
他們還是第一時間報告了當地的衛生官員。
得到的結果是,聯邦政府的信息直截了當要求,“住手,不要再這麼幹了,”“停止測試”。
隨後,美國新冠肺炎失控了。
3月2日,這種情況下,華盛頓大學(University of Washington)西雅圖流感研究所審查委員會認定,在公共衛生緊急情況下,研究人員如果不進行檢測並報告結果,是不道德的。
從那時起,西雅圖流感研究所發現並報告了許多其他病例,所有病例均已得到確認。
海倫·朱說,現在回想起來,她能理解為什麼過去幾周有那些阻礙疫情研究的規定。“這些保護措施的存在是有原因的,”她說。“你想保護實驗對象。你想以合乎倫理的方式做事。”
她說,令人沮喪的是,在一場可能在華盛頓州暴發,並在許多其他地區蔓延的疫情中,人們花了許多時間才得以突破繁文縟節去挽救生命。
“我想那時候人們不知道,”她說。
“我們現在知道了。”
資料來源:
https://twitter.com/trvrb/
https://www.nytimes.com/2020/03/10/us/coronavirus-testing-delays.html