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《源氏物语》中光源氏的婚姻状况是当时日本社会的真实写照。
在日本古代，由于社会发展落后，更由于人类学知识的欠缺，不仅没有同姓通婚的禁忌，而且近亲通婚也是非常流行的习惯。尤其在皇族和贵族社会内，近亲通婚的现象更为普遍。除了同父同母子女间的婚姻之外，所有的近亲婚都为社会所承认。
在现实中，皇室的婚姻是最典型的近亲婚。如：
天皇与姑姑：履中、雄略
天皇与远房姑姑：安闲、宣化
天皇与同父异母妹：敏达、用明
天皇与堂妹：允恭、安康、孝德
天皇与侄女：钦明、舒明、天智、天武
天皇与远房妹：仁贤、继体
所以，在这种环境下，同父异母兄妹通婚和不同辈分近亲通婚都存在。
关于婚姻中的乱辈份，非日本独有。
古代中国北方民族有一个传统，就是收续婚。就是当一个家族的男性甲死了之后，家族中其他男性（哥哥、弟弟、侄子）之类，会继承甲的妻子。隋炀帝杨广会继承他老爸文帝杨坚的陈夫人，唐高宗李治会继承太宗的才人武氏，而唐玄宗会直接夺取儿子寿王李瑁的妃子杨贵妃，都与杨隋、李唐的帝室有游牧民族血缘有关。
那么，上述这些例子是收续婚，那么，直接乱辈的有没有？有！写就《长恨歌》“在天愿为比翼鸟，在地愿为连理枝，天长地久有时尽，此恨绵绵无绝期”的大诗人白居易，一直有件难以启齿的事，那就是按照父亲辈份而论，他母亲是他表姐。白居易的父亲白季庚是母亲陈氏的舅舅。
元和拾一年
若要回答该问题，需要把《源氏物语》放到日本平安时期的婚姻习俗中加以考察。
在日本平安时代，贵族的婚姻制度是“招婿婚”，就是男女双方在婚后并不生活在一起，男方到女方家短期居住或暮合朝离，即晚上潜入女方家，次日天亮之前离开，这非常类似于我国云南摩梭族的“走婚”习俗。
在这样一种婚姻制度下，男方有多名妻子或与多名女子发生关系都是极其正常的事情。“好色”是作为男性魅力来加以赞美的，这也是日本人对《源氏物语》中的“好色”持肯定态度的原因。
而且当时在日本，存在着亲生兄妹姐弟之间通婚的现象，特别是在皇室、贵族之间，这种现象尤甚。以当时的伦理道德考量，这并非乱伦，所以《源氏物语》中的光源氏与三公主、与自己父亲的妃子、与自己的婶婶之间有两性关系并非为了吸引读者眼球，而是真实体现了当时贵族的生活。
日新录
古代的婚配观念和现在不同。封建时代的文明大多视直系亲属通婚为绝对禁忌，伦理约束严格一些的文化对名义上的直系亲属通婚也有限制——比如继父母继子女，对其他亲属结婚则少有硬性限制。
古代中国自周朝起的规矩是“同姓不婚”，算是比较严格的，所以题主所说的这种叔伯娶侄女的事在中国极少发生，但是舅父娶外甥女则是允许的，比如三国时期吴国的孙休就和他姐姐的女儿朱夫人结为夫妇。另外，皇室贵族掌握至高权力，一方面为了强化政权合法性有近亲婚配的政治需要，另一方面他们违背婚姻伦理也没人能施以制裁，因此各国都不乏“贵”圈真乱系列正史野史和文学作品。
即使非常看重家庭伦理的古代中国，遇到不讲究的唐高宗，立庶母武才人为皇后这种事不也就那么发生了么。
因为那个年代不讲究这些。如果亲兄妹或者父女、母子之间的话是不可以结婚的，算乱伦（源氏和继母藤壶中宫也算）。而有夫之妇也不得和其他男子发生关系，算私通，不过在走访婚（即去女方家留宿，天明离开）的背景下，实际上这方面的道德感是很稀薄的，而且寡妇不作限制（如六条御息所，只不过她身份过于高贵，可能在乎别人的眼光）。
在《源氏物语》中，源氏和即将入内的胧月夜发生过关系，但朱雀帝并未因此迁怒二人；柏木和三公主私通，但源氏依旧和柏木之父交好，可见这方面实际上相当开放，只不过当事人会有较强的负罪感。
《源氏物语》作于平安朝藤原氏权力顶峰之时，朝中宫中之人几乎都为藤原氏后代（包括紫式部本人），或多或少都有亲缘关系，因此也不可能做太过强硬的限制。藤原道长让好几个自己的女儿入内，实际上她们和天皇之间都是近亲。
