在人类的肠道中生活着大约100万亿个细菌，这些细菌可以阻止我们的消化，抵御病原体，产生维生素并刺激免疫系统。细菌的总体称为肠道菌群或微生物群。完整的肠道菌群对整个身体的健康很重要。有各种各样的食物可以帮助你建立健康的肠道菌群。
乳制品，如酸奶、酸牛奶和酪乳、含有乳酸菌，可以保持肠道菌群自然健康。乳制品主要是增加益生菌。益生菌是对肠道有益的活微生物。它们包含“好”细菌菌株，如双歧杆菌或乳酸菌（乳杆菌）。
酸菜或泡菜等食物也含有在发酵过程中产生的乳酸菌。因此，它们也有助于建立健康的肠道菌群。
纤维是“好”肠道细菌的食物，并提供富含物种的微生物组。除了全谷物产品外，亚麻籽和燕麦片也富含纤维，更容易消化。
苹果含有果胶，一种促进肠道微生物增殖的益生元物质。吃苹果的果皮很重要，因为它含有果胶。益生元不是微生物，而是膳食纤维，为“好”的肠道细菌提供高质量的食物，如双歧杆菌。可以说，它们是益生菌的浓缩饲料。
酵母是益生菌之一。其中含有的真菌是有益的，因为它们取代了可引起疾病的其他真菌菌株。所以只有这样的真菌在肠道中生长，才对肠道活动有积极影响。
蔬菜含有丰富的纤维，是“好”肠道细菌的食物。这类蔬菜，如菊苣、菊芋、朝鲜蓟、婆罗门参、洋葱和大蒜、还含有菊粉，他们能刺激有益的双歧杆菌的生长。
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