1971年10月29日出生于广东省汕头市潮南区成田镇家美社区家一村。
童年时，当时马化腾的父母在东方县工作，1984年13岁正在读初二时马化腾随家人从海南迁至深圳 。随后拥有了第一台自己的个人电脑。
随后就读于读于深圳大学计算机系计算机专业。马化腾最喜欢的是用天文望远镜遥望星空。
1993年从计算机专业毕业后，马化腾进入深圳润迅通讯发展有限公司，开始做编程工程师，专注于寻呼机软件的开发，至升任开发部主管。该段经历使马化腾明确了开发软件的意义就在于实用，而不是写作者的自娱自乐。润讯提升了马化腾的视野，以及给马化腾在管理上必要的启蒙。
1998年，实用软件概念不仅培养了马化腾敏锐的软件市场感觉，也使他从中盈利不菲。马化腾是风靡一时的股霸卡的作者之一，他和朋友合作开发的股霸卡在赛格电子市场一直卖得不错。马化腾还不断为朋友的公司解决软件问题。这使他不仅在圈内小有名气，而且也有了相当的原始积累。
1998年马化腾与他的同学张志东“合资”注册了深圳腾讯计算机系统有限公司。之后又吸纳了三位股东：曾李青、许晨晔、陈一丹。作为一家没有风险资金介入就成立的软件公司，初期的每一笔支出都让马化腾和他的同伴心惊。
在决定做OICQ的时候，当时国内已经有了两家公司先做，产品比腾讯更有市场名气。马化腾没有想得更多，除了因为这个产品可以和公司的主项发展业务移动局、寻呼台、无线寻呼方案和项目相互促进外，也因为当时飞华、中华网等许多公司有意向做即时通讯项目，市场显得很有发展前景。
初期发展过程中，腾讯经过一个很重要的赔偿官司：在1999-2000年左右，仿照ICQ开发的OICQ抢了很多ICQ的用户群，尤其是中国大陆用户，后来ICQ公司通过法律途径，最终判定腾讯败诉，停止使用OICQ这个名称，并归还OICQ域名给ICQ公司，同时赔偿了一定金额的费用，自此腾讯便使用了QQ这个名称。
1999年2月，腾讯开发出第一个“中国风味”的ICQ，即OICQ后，受到用户欢迎，注册人数疯长，很短时间内就增加到几万人。人数增加就要不断扩充服务器，而那时一两千元的服务器托管费对公司都不堪重负。
2000年，第一次网络泡沫席卷了整个中国互联网，腾讯进入了最为困难的时期，在面临资金困难时，曾险些把开发出的ICQ软件以60万元的价格卖给深圳电信数据局，但终因价格原因告吹。
软件卖不掉，但用户增长却很快，运营QQ所需的投入越来越大，马化腾只好四处去筹钱，马化腾拿着改了6个版本、20多页的商业计划书开始寻找国外风险投资，最后碰到了IDG和盈科数码，获得了第一笔投资。腾讯的发展逐渐步入了正轨。
2004年6月16日，马化腾带领腾讯在香港交易所主板挂牌上市
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