在武昌起義之後，胡漢民等人認為，現在革命的目的都還沒有達到，現在讓全給袁世凱，前途尤多危險。但是大多數的領導層和活動分子都主張適應新的“共和”形勢。把同盟會從秘密的革命團體，改組為公開的議會政黨。
劉揆一率先提出，提倡共和民國政體，組織中華民國政黨為共同統一。章太炎也隨後拋出“革命軍起，革命黨消”的言論。在他們的影響下，宋教仁、張繼、景耀月、陳其美、譚人鳳等人都聲明“將選擇同盟會中穩健分子，集為政黨，變名更署，與同盟會分離”。甚至同盟會的機關報《民立報》鼓吹：只有解散同盟會，才能“救黨派分歧之中國”！
孫中山雖然同意同盟會改組為公開的會議政黨，但是不贊同馬上改組，孫中山認為同盟會“必先自結合”，完全實現民族、民權、民生三民主義。在民國成立，大局已定之後再開全體大會，改為最閎大之政黨。
孫中山認為現在中華民國立國之初，主要的重心應該為國事奔走，無暇顧及黨事。孫中山堅持保存同盟會的名義，暫時不改組為議會政黨。但是對同盟會還是做出了適當的整頓，使得宋教仁、張繼等人，放棄了“變名更署”的主張，繼續留在同盟會，以“保持革命精神”！但是還有多數的同盟會成員，沒有接受暫時不改組的的意願。陳其美等人不理睬孫中山維持同盟會名義的主張，擅自將同盟會改為“共和本黨”、“軍國黨”、“共和黨”等等名稱的政黨。在如此紛亂的環境下，同盟會本部不得不在1912年1月22日在南京召開大會，商議同盟會何去何從。
在大會上，贊成和反對兩派展開了激烈的爭論，最後贊成派佔多數，通過了改組政黨的決定，改選汪精衛為總理。雖然贊成派佔得上風，但是孫中山仍然不贊成改為政黨，汪精衛也不肯擔任總理的職務。這樣導致具體的改組工作並沒有進行下去。
隨著全國組黨的形勢日益高漲，對同盟會越來越不利。立憲派和舊官僚利用組黨的機會，聯合“非同盟當之力”，企圖摧陷同盟黨。同盟會內部自行設置會黨的現象也越來越嚴重，加上袁世凱又取得了臨時大總統的職務。這時候孫中山和黃興等人才感到同盟會有“重新團結之必要”！於是決定加大擴張，以實成民國之一最大政黨！責成居正等人開始籌備改組大會！
在3月3日，同盟會再南京再次召開大會，通過新總章，選族孫中山為總理，黃興、黎元洪為協理，宣佈正式改組為政黨！“不數月間，而會員增至十數萬人，支部遍佈於十八行省”！
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