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深入研究分析表明，雜交後代群體羽色分化由單個基因決定，完全符合孟德爾遺傳定律。正是由於一個6.6 kb的大片段序列插入到MITF基因中，導致其負責黑色素合成的轉錄本被完全抑制表達，黑色素合成途徑被關閉，從而形成了北京鴨潔白的羽毛。更重要的是，該研究鑑定出導致北京鴨體格變大的主效基因IGF2BP1，在相同飼養時間內，該突變型可以多增加15%的體重，同時飼料轉化率提高6%。該基因原來是在胚胎期發揮促進生長作用，而北京鴨在被選育過程中，其遠程增強子上產生了一個自然突變，致使該基因在北京鴨出殼後仍持續表達，飼料利用效率的提高致使其體格變大。
研究表明，IGF2BP1這一調控體格大小的通路和方式在各類畜禽中廣泛存在，可將這一遠程變異調控IGF2BP1持續表達的機制引入其它品種乃至其他畜禽，為進行其他畜禽品種改良提供了可能性。此項研究從方法論角度為系統解析動植物品種改良機制提供了經典範例，併為畜禽分子育種提供了理論基礎 。
值得一提的是，2013年中國農業大學、愛丁堡大學與華大基因組成的聯合研究團隊在Nature Genetics上發佈了鴨基因組測序工程，並揭示其多項對禽流感產生免疫反應的遺傳機制【1】。
據悉，中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所周正奎副研究員、西北農林科技大學博士生李鳴、程紅、北京畜牧獸醫研究所博士生凡文磊、北京林業大學袁崢嶸副教授為共同第一作者，西北農林科技大學姜雨教授和北京畜牧獸醫研究所侯水生研究員為共同通訊作者。
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