奇門遁甲因其極度隱秘性，自古以來鮮為人知，其民間流傳部份很片面，真正的奇門遁甲全部書籍和資料目前還沒有，這導致現今民間的奇門遁甲學術的不完全和欠研究。
傳說上古先皇皇帝軒轅氏在家鹿這個地方與蚩尤進行大會戰，廝殺多年，戰事都未能結束。有一天，他偶爾做了一個夢，夢見天神向他傳咒，得到符咒之後。他命令風后根據“阿圖”和“洛書”椎演成種法術， 這就是奇門造甲，於是他就登上祭壇，祭祀天神，恭敬而真城地進行修練。
“河圖”是神龍從落水出來之後才發現的，“洛書”是綵鳳從碧雲之中降臨人間才得到的。 大禹命風后演成《奇門道甲》1書之後， 專門道甲術就創立了
風后構擬局數共計一千零八十個，後來傳到姜太公，他刪繁就簡，將一千零八十局簡化為七十二局。到了漢代，劉邦的謀區張良又進一步簡化，成十八局，即風道九局，用道九局。
還有傳說中，最早的奇門遁甲，就是一隻元龜巨鰲送給人類的。軒轅黃帝和蚩尤在涿鹿大戰，無法取得勝利，夢見天神，欲傳授符訣，於是築壇祭祀。水中浮現一隻元龜巨鰲，嘴裡銜著一冊書，似皮非皮，似綢非綢，文字是血寫的。黃帝根據它，排兵佈陣，最後打敗了蚩尤。這就是《奇門遁甲》了
中華人文始祖黃帝宰相程姓始祖風后的嫡系後裔，風后，伏羲之後裔，黃帝臣三公之一也，風后是奇門遁甲的最先創始人之一，風后用奇門遁甲輔佐黃帝統一中原，匡扶天下。
奇門遁甲傳至商末時，姜子牙得奇門遁甲真傳輔佐周氏一統天下，奇門遁甲傳至春秋戰國時，蘇秦張儀得奇門遁甲真傳，留下了中華謀略史上的神話，奇門遁甲傳至秦末時張良得奇門遁甲真傳，輔佐劉邦統一天下創立大漢朝，張良成為運用奇門遁甲的不朽人物之一，奇門遁甲傳至漢末群雄並起，四海兵戈，天下分裂。
諸葛亮得奇門遁甲真傳輔佐劉備，創立了三分天下的歷史格局，諸葛亮對於奇門遁甲在兵法上的運用是非常值得肯定的。奇門遁甲傳至隋唐之際，李靖得奇門遁甲真傳，輔佐李氏一統天下建立唐朝的盛世。奇門遁甲傳至宋朝時趙普得奇門遁甲真傳，輔佐趙氏安定天下出謀劃策，奇門遁甲傳至元末時劉伯溫得奇門遁甲真傳，輔佐朱元璋一統天下建立大明王朝。
在歷吏事件中無法找到法術奇門存在的證句，就連孔眀借東風的赤壁亦被吏學家懷疑，更何況比三國更久遠的歷史呢。
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