中央電視臺播出的“反臺灣間諜報道”，在島內引發強烈關注。雖然臺灣當局極力否認，但不少島內媒體都回顧了臺當局在大陸滲透的歷史，認為反臺諜內幕的曝光意味著兩岸關係進一步惡化。大陸國臺辦發言人安峰山16日表示，大陸方面要求臺灣有關方面立即停止對大陸的滲透破壞活動，避免對日益複雜嚴峻的兩岸關係造成進一步傷害。
不少臺媒都對央視的臺諜報道進行了轉述。臺灣《旺報》16日稱，央視提到已破獲100多起臺諜案，並詳細介紹了3個案例，包括在臺陸生被臺灣間諜色誘等，同時公佈被破獲的臺灣“軍情局”人員姓名及照片，片頭寫道“這是看不清的迷霧，逃不掉的陷阱”。3起案件都發生在2011年至2014年之間，“選在此時報道，頗具針對性”。
臺灣陸委會15日對上述報道極力否認，稱當局開放陸生來臺，為促進兩岸青年認識與瞭解，大陸是在通過媒體宣傳“胡亂進行指控”。16日，臺“國防部”稱，陸媒報道的內容“子虛烏有”，外界毋須隨之起舞。臺灣地區領導人蔡英文還在造勢活動上稱，年底選戰激烈，這次選舉有很多來路不明的“假消息”，某些甚至來自對岸，造成臺灣社會對立，更激化臺灣選舉。
臺灣《聯合報》評論稱，民進黨上下一口咬定“假消息來自對岸”，也算是不可思議。這可能是蔡當局策略性的“反守為攻”，既然許多政策遭反彈，就將錯誤推給“假新聞”。文章說，民進黨的對策若只剩下推給“假消息”這一條路，除了與民眾期待有落差外，也只會讓惡性循環更激烈而已。
對於臺當局“推得一乾二淨”，島內並不信服。《聯合報》16日回顧稱，兩岸諜報你來我往，最早要追溯到上世紀30年代的國共鬥爭，雙方鬥智鬥勇的故事即使到現在也是電視劇的精彩劇目。到了上世紀50年代初，兩岸各自清除隱藏在內部的間諜;近年來，最為人所知的是臺當局策反解放軍少將劉連昆，大陸也成功吸收臺軍少將羅賢哲，他們各自提供重要情報給對方;2008年之後，兩岸展開全面交流，大陸學生大量來臺，臺灣學生也到大陸求學，更增添情報部門做工作的機會，即使在馬英九當政時期，雙方的情報工作也不曾停止，只是著眼於來之不易的良好氣氛，雙方都不願大肆宣揚，也不願撕破臉，私下解決。文章認為，自民進黨當局上臺以來，兩岸關係急轉直下，肅清間諜的消息越來越多，大陸央視的播報用語更嚴厲，“藉此提醒大陸赴臺學生小心防範，一方面也在警告臺灣當局”。
兩岸諜報戰引發島內憂慮。國民黨政策會前執行長蔡正元擔心，兩岸的“間諜逮捕戰”行動如果失控，將是武力戰爭的前哨戰。他認為，大陸“2018—雷霆行動”宣稱逮捕百餘起臺灣間諜，應是針對蔡英文當局逮捕所謂“陸生共諜”周泓旭、搜查新黨發言人王炳忠的回馬槍。國民黨“立委”賴士葆稱，最近臺灣炒作美國在臺協會新館要派美軍陸戰隊，蔡英文又稱“選舉充斥假消息，甚至來自對岸”，暗指大陸干涉臺灣選舉，大陸自然會有回應。他認為，兩邊現在都在“以牙還牙”：“外交”上，臺灣聲稱與美國或其他地區的關係出現突破，大陸就以造成臺“斷交”響應;綠營聲稱大陸介入臺灣選舉，大陸現在就順勢揭露臺灣的情搜工作。“立委”曾銘宗稱，其實不管哪些國家或地區之間，都一定各有情報人員工作，只是理應極為低調，若真被發現，也儘量低調處理，“現在卻大肆宣傳，顯示兩岸關係進一步惡化，意味著大陸要把臺諜事件作為重大象徵，特別傳達某些政治信息”。
“諜戰刻意曝光，兩岸角力升級。”《旺報》評論稱，過去兩岸鬥爭幾乎都集中在政治、“外交”乃至經濟民生等層面上，但央視等罕見曝光反臺諜內幕，凸顯兩岸角力全面升級，預示著兩岸關係進一步惡化，“眼下兩岸恐怕正在上演一場檯面下的鬥爭戲碼”。文章說，大陸此舉“事出有因”，蔡英文當局近期刻意操作並曝光新黨王炳忠等案，已讓北京忍無可忍。既然蔡當局已打破過去兩岸的默契，北京自然覺得無須再手軟。但間諜問題“可大可小”，就看雙方如何認定，從央視曝光的具體情節來看，大陸對涉臺諜情況將一律“從嚴認定”，“未來一段時間內，相關涉臺諜案件，恐怕只會多不會少”。
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