中國各族穆斯林歷來有愛國主義的光榮傳統。他們反對民族分裂，反對外來侵略，為保衛祖國的完整和統一做出過巨大貢獻。
在大小和卓叛亂及其以後和卓後裔勾結外來侵略勢力進行分裂祖國的歷次活動中，各族廣大穆斯林群眾都堅決站在祖國一邊，參加平叛大軍。如在討平張格爾叛亂時，維吾爾族人民衝鋒陷陣，英勇殺敵，探查敵情，傳送情報，運輸軍需物資，修路架橋，為清軍充當嚮導。在遭叛匪俘獲時，他們痛斥敵人暴行，寧死不屈；在叛匪收買引誘時，他們立場堅定。忠於祖國。在和田、葉爾羌，他們曾活捉張格爾的親信，殺死叛軍；在喀什噶爾，曾多次發生謀殺張格爾事件，在張格爾潰逃出卡時，維吾爾、塔吉克、哈薩克、柯爾克孜人民英勇出擊，協同清軍追捕叛匪，為活捉張格爾，徹底平叛做出了卓越貢獻。
浩罕挾持玉素甫和卓入侵失敗後，曾劫掠1200餘群眾。途中，英吉沙的69名維族穆斯林，半夜砍殺侵略者，逃出虎口，回到祖國。
道光十六年(1836年)十一月，浩罕再次入侵色勒庫爾。當地塔吉克人民在其領袖庫爾察克,、吐爾阿沙等先後領導下，奮勇抵抗，偷襲敵營，狠狠打擊了侵略者的氣焰。
咸豐五年(1855年)，沙俄駐塔城領事殘害我雅爾噶圖金礦人民200餘名，塔城回族人民與漢族一起在徐天蕘、安玉賢領導下，舉行了焚燒沙俄貿易圈的鬥爭.
同治初，沙俄全面入侵我國西北地區。強迫清政府簽訂了不平等的《中俄勘分西北界約記》，引起新疆穆斯林一系列抗俄鬥爭。
阿古柏匪幫統治時期，初期有色勒庫爾塔吉克人民起義，柯爾克孜人民起義；中期有吐魯番農民反對徵收“種子稅”起義，烏魯木齊回漢人民反侵略、反屠殺的起義；後期有南疆各地維、回、柯爾克孜等族人民普遍掀起的武裝鬥爭。
光緒二十年（1894年），回族穆斯林將領左寶貴奉命進援朝鮮，抗擊日寇，保衛祖國安全。他在平壤力疾血戰，奮不顧身，身負重傷仍堅守炮臺督隊，直至中彈犧牲。
光緒二十六年(1900年)，八國聯軍進襲北京。從天津至北京，一支主要由回族、東鄉族穆斯林組成的中國部隊進行了英勇頑強的抗擊，使侵略者傷亡慘重。正陽門保衛戰中，穆斯林將領馬福祿援兵登城。謀奪回城樓，破敵卡七道，不幸中彈。英勇捐軀，名標青史。
中國各族穆斯林這種愛國主義傳統。在1937—1945年偉大的抗日戰爭中，得到更好的繼承和發展，湧現了數以萬計的抗日英雄。著名的冀中國民支隊司令員馬本齋及其母，被朱德總司令譽為“大節不死，母子兩代英雄”。他所領導的回民支隊及張風亭領導的渤海回民支隊、白雲義領導的安徽定遠縣二龍鄉清真營，都是令日寇膽寒的人民子弟兵。中國穆斯林與其他民族人民一起，用血肉之軀築成一道偉大中國的“新的長城”，在這場神聖的反法西斯戰爭中，保衛了祖國，打擊了日寇，貢獻了自己的一切。
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