之前我們介紹了微生物菌群可間接影響結直腸癌發生，目前的研究發現，腸道微生物菌群與免疫相關，有可能直接影響腫瘤的免疫治療。腸道微生物群不僅與腸道免疫的關係密切，而且影響了全身免疫系統。近年的研究顯示，腸道微生物群可以影響免疫治療療效。雖然PD-1/PD-L1、腫瘤突變負荷（TMB）和微衛星高度不穩定性（MSI-H）已經在臨床上用於預測免疫治療療效，但是它們都不盡完美。近年來，關於腸道微生物群的研究如火如荼，並且初步認為它有望成為一個潛在的預測免疫治療療效的生物標誌物。
每個機體內的腸道微生物群相對固定，但又因為遺傳學背景、飲食、環境、用藥史、吸菸等原因在個體之間存在一定的差異。
人體腸道微生物群大約重 1000 g，約有 30 個種屬，300～500 多種，數量達到了 1014 個，是人體細胞總數的 10 倍。腸道微生物群主要包括細菌群、真菌群、病毒群、原蟲、古細菌群等，其中細菌群數量最多。
腸道微生物群對機體免疫的影響超出了腸道本身而影響了全身免疫系統。主要表現在兩個方面：（1）促進宿主免疫系統的發育。（2）調節機體免疫系統。除了細菌的直接調節作用外，細菌的代謝產物也可以從腸腔轉位到腸黏膜固有層中，影響宿主免疫相關基因的表達。這些產物包括短鏈脂肪酸、膽汁酸、維生素、多胺、脂質、組胺等。他們涉及到的腸道細菌各不相同，所產生的免疫調節作用也各不相同。
對腸道微生物群的研究無疑已經給預測免疫治療療效一個新的切入點。不過，企圖只靠一個生物標誌物來預測免疫治療療效是不切實際的。如果將腸道微生物群組成與腫瘤基因組學、生殖細胞遺傳學整合到一個多參數模型中，有望實現對免疫治療的精準預測。
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