成立之初
20世紀伊始，有意在華髮展醫學教育的耶魯畢業生在美國康州成立了雅禮會（Yale-in-china），選定長沙興醫辦學。
1906年，E.H.Hume受邀在長沙市開辦了雅禮醫院。
1914年，湖南育群學會和美國雅禮會聯合在長沙創辦一所新型的西式醫科大學——湘雅醫學專門學校，並得到北洋政府各部門批准。從此，在中國教育史上，開拓了中美合作辦高等醫學教育之先河。
1915年，雅禮會醫院更名為湘雅醫院；雅禮護病學校則更名為湘雅護士學校。湘雅醫學專門學校、湘雅醫院和湘雅護士學校統歸湘雅醫學會的管理。
湖南育群學會呈請湖南省政府撥款購地，在湘雅醫院東部籌備建築及校舍。
美國雅禮會亦通過募捐，在與校區毗鄰的西部購地建築新醫院——湘雅醫院，美國約翰·霍普金斯大學的威爾遜教授主持了奠基典禮。
1921年，美國教育考察團確認湘雅醫學專門學校與北京協和醫學院是全國最好的醫學院校。
從此醫學和醫學教育界便有了“北協和，南湘雅”之譽。
1925年，湘雅醫學專門學校更名為湘雅醫科大學，由中方管理；湘雅醫院仍由湖南育群學會和美國雅禮會雙方共同管理。
孫中山為湘雅畢業生題贈
1931年，學校更名為私立湘雅醫學院。
抗戰時期，湘雅西遷
1937年，為不讓湘雅醫學院落入敵手，校方決定西遷。但雅禮會認為，即使長沙淪陷，湘雅也可由美國星條旗保護。但校方和師生仍堅持西遷。
初定遷至桂林，但條件是抗戰勝利後須留在桂林，不再返湘。校方難以接受，遂決定西遷貴陽。
1940年，國民政府同意更名為國立湘雅醫學院。
1944年，日軍進逼長沙，湘雅醫院醫護職工和家屬被迫逃亡，湘雅建築群則化為斷壁殘垣。
1944年，因戰事遷校重慶楊公橋。
1945年-1946年，分批先後回到長沙。
新中國
1949年，長沙市軍事管制委員會接管國立湘雅醫學院。
1953年，湘雅醫學院更名為湖南醫學院。
1979年，與美國“中華醫學基金會”等組織取得聯繫，經院批准與美國雅禮協會恢復合作關係。
1996年，湖南醫科大學通過立項審核進入國家“211工程”重點建設行列，由衛生部和湖南省共建。
2000年，原中南工業大學，長沙鐵道學院與原湖南醫科大學合併為中南大學，並組建中南大學湘雅醫學院。
學院史無前例的五連冠。
中國第一所中外合辦的醫學院，
南湘雅、北協和。
五次醫學院校聯考五連冠。
湘雅人寫就了半部中國西醫史，
成立以來培養了20多位兩院院士。
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