東晉由司馬睿衣冠南渡後，於公元317年在建康重建晉室王朝，至公元420年劉裕建立劉宋滅亡。國祚103年。
晉元帝
司馬睿：司馬懿曾孫，司馬覲之子。襲父琅琊王爵位，討伐成都王司馬穎，失敗後回到封地，晉懷帝時期封安東將軍，督揚州軍事，後在王導建議下，南渡建康，後拜丞相，永嘉之亂，西晉滅亡後，衣冠南渡，於公元317年稱晉王，318年稱帝。司馬睿由於聲望不夠，皇位不穩，便重用王導，任命王導為宰相，執掌朝政，時謂“王與馬，共天下”。由此王氏權盛，更是引發“王敦之亂”，導致朝政被王敦把控，司馬睿因此於公元323年憂憤去世，時年四十七歲。
司馬懿：司馬睿曾祖父，晉宣帝。
伏夫人：司馬懿寵姬，司馬睿曾祖母。
司馬伷：司馬睿祖父，琅琊武王。
諸葛氏：司馬伷之妻，司馬睿祖母，諸葛誕之女。
司馬覲：司馬睿之父，琅琊恭王。
夏侯光姬：司馬覲的王妃，司馬睿之母，夏侯淵曾孫女，夏侯莊之女。
武陵王司馬澹、東安王司馬繇、淮陵王司馬漼皆為司馬睿叔父，司馬覲之弟。
司馬渾：司馬覲之子，司馬睿兄弟，東安王。
虞孟母：司馬睿結髮妻，無子，撫養晉明帝和司馬裒。後追封為元敬皇后。
荀氏：王府宮人，晉明帝和司馬裒生母，後被譴出改嫁，明帝時，封建安君。成帝時，追贈豫章君。
鄭阿春：司馬睿妃子，晉簡文帝和司馬煥生母，先嫁田氏，後守寡，司馬睿為丞相時納之，稱帝后封為夫人。明帝時，稱建平園夫人，追封會稽太妃。晉孝武帝時，追封簡文宣太后。
石婕妤：司馬睿妃子，司馬衝之母。
王才人：司馬睿妃子，司馬晞之母。
司馬睿有子：晉明帝司馬紹、琅邪孝王司馬裒、東海哀王司馬衝、武陵威王司馬晞、琅邪悼王司馬煥、晉簡文帝司馬昱。有女：尋陽公主，母為鄭阿春，嫁與荀羨。
晉明帝
司馬紹：司馬睿長子，司馬睿亡故後即位，制衡權臣世家，穩定社會發展。後平定“王敦之亂”，不追究其黨羽，重用王導，做好“王敦之亂”的善後工作，使東晉王朝趨於穩定。公元325年病逝，時年二十七歲。
庾文君：司馬紹皇后，明穆皇后，庾琛之女，庾亮之妹，晉成帝、晉康帝之母。
司馬紹有子：晉成帝司馬衍、晉康帝司馬嶽。有女：南康公主司馬興男，嫁桓溫。廬陵公主司馬南弟，嫁劉惔。南郡悼公主，嫁羊賁。
晉成帝
司馬衍：司馬紹長子，司馬衍五歲即位，由皇太后臨朝稱制，王導與庾亮共同輔政，皇太后去世後，外戚庾亮執權，肆意殺害重要官員，引起蘇峻和祖約叛亂，建康被攻陷，宮城遷入石頭城，叛亂平定後才遷回，並重新重用王導，使東晉轉危為安。司馬衍在位時，勤儉節約，舉賢納良，重視農桑，使政權趨於穩定。公元342年，司馬衍病重，退位給其弟司馬嶽，不久就病亡，時年22歲。
杜陵陽：司馬衍皇后，成恭皇后，杜預曾孫女。
周貴人：司馬衍妃子，晉哀帝司馬丕和晉廢帝司馬奕的生母，但因其家室貧微而未被尊為皇太后。
司馬衍有子：晉哀帝司馬丕、晉廢帝司馬奕。有女：尋陽公主，嫁王禕之。南平公主，嫁劉赤松。
晉康帝
司馬嶽：司馬紹次子，司馬衍之弟。司馬衍病重時，在庾冰等人建議下，放棄年幼的二子，立其弟為皇位繼承人，並讓司馬晞、司馬昱、庾冰、何充、諸葛恢一起輔政。公元344年，司馬嶽亡故，時年二十三歲，在位僅三年，沒什麼大的政績貢獻。
褚蒜子：司馬嶽皇后，康獻皇后，褚裒之女，曾三度臨朝稱制，扶立六位皇帝。
司馬嶽有子：晉穆帝司馬聃。
晉穆帝
司馬聃：司馬嶽之子，二歲時即位，其母褚蒜子臨朝稱制，朝政先後由何充、蔡謨、司馬昱輔佐。15歲時，太后還政，公元361年，年僅十九歲的司馬聃病逝。司馬聃在位時期有過數次北伐，版圖雖有所擴張，但也與之前大體相當。
何法倪：司馬聃皇后，穆章皇后，何準之女，何充侄女。
晉哀帝
司馬丕：司馬聃去世之後，因無子，褚太后便令司馬丕即位，司馬丕喜好長生不老術，斷谷服食丹藥，結果中毒發病不能聽政，於是褚太后被請出臨朝聽政，公元365年，司馬丕病亡，時間二十五歲。司馬丕在位時期，桓溫當國，數次北伐，國家戰亂，開始衰敗，而桓溫擁兵自重亦暴露出其狼子野心。
司馬衍：司馬丕之父，晉成帝。
周貴人：晉成帝妃嬪，司馬丕生母，後尊為皇太妃。
王穆之：司馬丕皇后，哀靖皇后，王濛之女。
司馬丕有一子，無記載，司馬丕亡故後為其弟即位，可知此子應早夭。《晉書》“癸亥，以皇子生，大赦”。
晉廢帝
司馬奕：司馬衍之子，司馬丕之弟。公元365年，司馬丕亡故無子，褚太后令其即位，司馬奕在位期間，朝政大權全在桓溫手中，司馬奕如同傀儡，而桓溫亦有自立為帝的野心，公元371年，桓溫逼褚太后下詔廢黜司馬奕，降為東海王，後又貶為海西公。而後司馬奕深居簡出，小心謹慎，避免殺身之禍，於公元386年亡故，時年四十五歲。
司馬衍：司馬奕之父，晉成帝。
周貴人：晉成帝妃嬪，司馬奕生母，後尊為皇太妃。
庾道憐：司馬奕的皇后，庾冰之女。司馬奕被廢后，也被追貶為海西公夫人。
田氏、孟氏：司馬奕妃子，皆封美人。
司馬奕有三子，為田氏、孟氏所生。《晉書》“而二美人田氏、孟氏生三男”
晉簡文帝
司馬昱：司馬睿幼子，桓溫廢司馬奕後，改立司馬昱為帝，司馬昱在位期間，受桓溫所制，在位僅八個月便憂憤抱病而亡，時年五十三歲。
司馬睿：司馬昱之父，晉元帝。
鄭阿春：司馬昱之母，簡文宣太后。
王簡姬：司馬昱王妃，王遐之女，後被追封為簡文順皇后。
胡淑儀、王淑儀、李陵容、徐淑儀：皆為司馬昱的妃子。
司馬昱有子：會稽王世子司馬道生、司馬俞生（母皆為王簡姬）、臨川獻王司馬鬱、司馬朱生（母皆為胡淑儀）、司馬天流（母為王淑儀）、晉孝武帝司馬曜、會稽文孝王司馬道子（母皆為李陵容）。
司馬昱有女：鄱陽公主，母為李陵容，嫁王熙。新安公主司馬道福，先嫁桓濟，後改嫁王獻之。武昌公主，嫁桓脩。
晉孝武帝
司馬曜：司馬昱亡故後，年僅十一歲即位，初由桓溫輔政，公元373年桓溫亡故，褚太后被請出臨朝聽政，公元376年太后還政，謝安掌權，擊敗前秦大軍，贏得淝水之戰的勝利，保全了東晉。司馬曜在位期間，利用其弟司馬道子代替謝安執政，使皇權歸於司馬氏手中，但司馬曜卻貪圖享樂，沉迷酒色，與其弟司馬道子爭權，導致朝廷昏聵，而後因與寵妃張貴人的酒後戲言，被張貴人派人捂死，時年三十五歲。
王法慧：司馬曜的皇后，王蘊之女，孝武定皇后。
張貴人：司馬曜寵妃，因司馬曜酒後一句戲言說其年老色衰又無子，準備廢了她，導致張貴人憤怒，便遣心腹將醉酒的司馬曜捂死。
陳歸女：司馬曜妃子，封淑媛，晉安帝司馬德宗、晉恭帝司馬德文的生母，後追封為德皇太后。
司馬曜有子：晉安帝司馬德宗、晉恭帝司馬德文。有女：晉陵公主，嫁謝混。鄱陽公主，嫁王嘏。
晉安帝
司馬德宗：司馬曜長子，公元397年即位，司馬德宗愚笨，比晉惠帝司馬衷有過之而無不及，連四季的區別都分不出，其在位期間，朝政為司馬道子父子把控，朝外將領自立，不受君命，內亂頻頻發生，國勢日漸衰弱。公元404年，桓玄篡位，改國號為楚，貶晉安帝為平固王，而後劉裕異軍突起，誅殺桓玄，掃平諸多叛亂，封相國，宋公，獨掌東晉實權。公元419年，司馬德宗被劉裕所害，時年三十八歲。
王神愛：司馬德宗皇后，安僖皇后，王羲之孫女。
晉恭帝
司馬德文：司馬曜次子，司馬德宗之弟。司馬德宗被殺之後，劉裕立司馬德文為帝，公元420年，劉裕將擬好的禪位詔書逼迫司馬德文謄抄，司馬德文將其謄抄之後禪位於劉裕，東晉滅亡，而後司馬德文被劉裕派人所殺，時年三十六歲。
褚靈媛：司馬德文皇后，恭思皇后，褚爽之女。
司馬德文有子出生不久就被劉裕派人所殺。
司馬德文有女：富陽公主、海鹽公主司馬茂英，嫁與劉裕之子劉義符，劉義符被廢殺後降為營陽王妃。
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