蒙醫不同於中原中醫，尤其是脈診，不過脈診在蒙醫中佔有極重要的地位。分辨三元、寒熱、以及藏象變化氣血盛衰等均以脈象為主。
蒙醫脈診部位為腕關節掌面橈動脈搏動處，將這一段動脈分為 寸、甘、查各三部，橈骨莖突水平為寸，寸上為甘，甘上為查。診脈時食指在寸，中指在甘，無名指在查。指間隙麥粒大小。切脈時需要用不同指力仔細侯測，寸觸皮，甘按肉，查按骨。
寸、甘、查各三部分別診查不同臟腑的病症，且左右不同，左手寸部候肺、大腸，甘部候肝、膽，查部候右腎、膀胱，右手寸部候心、小腸，甘部候脾胃，查部候左腎女子胞。如果患者是女性，則左手寸部候心、小腸，右手寸部候肺、大腸，其它同上。
對脈象的特點可從脈位高低，脈搏頻率、節律、強弱、大小、勢態等方面來作為依據，正常脈象一呼一吸跳動4-5次，一分鐘70-80次，不浮不沉，不大不小，往來均勻，節律一致。但這是相對的。由於人的體型、性別、年齡不同，以及機體體質內外環境的影響，可出現一些生理變動。
關於臨床常見病脈，歷代蒙醫積累了豐富的經驗，並形成了一個較完整的體系，一般以十二種脈象為基礎，其中細分四十七種脈象，又歸納為寒熱兩類，作為臨床診斷的一個重要方面。例如 赫易病 脈象洪而中空，按之既絕，希日病之脈象細、數而有力，巴達幹病之脈象沉緩無力。此外還有絕脈，怪脈以及對脈象的論述等內容。
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