羊只近親交配存在“兩降一高”的弊端。即：羊只繁殖性能下降，品種退化，發育不良，生長遲緩，產肉、產毛量降低50%。繁殖率下降，怪胎、流產、化胎、死胎不斷出現。羊只抗病カ差死亡率高。這些問題必須引起養羊戶的高度重視，採取措施認真加以解決。
以下具體措施可以有效避免近親繁殖
①適當調換種公羊
一個羊群配種2年後，要找同類品種種公羊配種，防治近親繁殖。
②公母分舍飼養
到了配種時期，需要血緣遠的進行配種。
③建立羊群檔案庫
檔案局主要功能，①建立配種登記表②羔羊身份信息表(配種的父母)③後代測定記錄表(身體性能、繁殖能力等)
記錄了基因可以有效防治近親繁殖，可以科學計劃選種選配
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