作者丨小文
2020年2月22日,瑞士伯爾尼大學病毒與免疫研究所的研究人員在預印本網站biRxiv發表了題為“Rapid reconstruction of SARS-CoV-2 using a synthetic genomicsplatform”的研究論文。
他們開發了一個合成基因組學平臺,並利用新冠病毒的核酸序列快速重組出具有活性的病毒。
需要注意的是,這是一項根據已知病毒基因組進行病毒重建的基礎研究工作,與“新冠病毒是人工合成的”這樣的謠言不是一回事。
(注意:預印本網站bioRxiv的所有論文未經同行評議)
反向遺傳學已經成為必不可少的研究工具,它徹底改變了人們對病毒發病機理和疫苗開發的認知。
大型RNA病毒基因組(例如冠狀病毒),由於大小和不穩定性,很難在大腸桿菌中克隆和操縱。
因此,開發一個快速而強大的反向遺傳學平臺用於RNA病毒研究將使學界受益。
研究人員報道了一個基於酵母的合成基因組學平臺,其可用於多種RNA病毒的基因重建,包括冠狀病毒科、黃病毒科和副粘病毒科家族。
病毒分離物、克隆的病毒DNA、臨床樣品或合成DNA可用於生成病毒亞基因組片段。
然後,使用轉化相關重組(TAR)克隆技術將基因組維持為酵母人工染色體(YAC),從而在釀酒酵母中實現一步重組。
T7-RNA聚合酶被用於產生病毒RNA,進而可以產生活病毒。
基於該平臺,研究人員在拿到合成DNA片段後一週內,對最近流行的新冠病毒(SARS-CoV-2)進行了工程改造和復活。
新冠病毒的感染仍在全世界蔓延,病毒在人群中的可能出現序列變異以及疾病表型的改變。
研究人員報道的這一技術可對病毒爆發做出快速響應,從而實時產生不斷變化的RNA病毒變體並對其功能進行表徵。
論文鏈接:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.21.959817v1
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