作者丨小柯
美國霍華德休斯醫學研究所Zhe Liu、加州大學伯克利分校Robert Tjian等研究人員合作，開發了用於可及性基因組超分辨成像的新型顯微鏡。
這一研究成果於2020年3月16日在線發表在《自然—方法學》上。
為了在納米尺度上對可及性基因組進行原位成像，研究人員開發了轉座酶可及性染色質光激活定位顯微鏡（3D ATAC-PALM），其將轉座酶可及性染色質測定與可視化、PALM超分辨率成像以及晶格光片顯微鏡整合在一起。
3D ATAC-PALM與oligopaint DNA-熒光原位雜交（FISH）、RNA-FISH和蛋白質熒光多路複用，連接了顯微鏡和基因組數據，從而揭示了空間分隔的可及染色質域（ACD），其中包含活性染色質和轉錄的基因。
使用這些方法來分析遺傳擾動的細胞，研究人員證明了基因組結構蛋白CTCF可以防止可及性染色質過度聚集並破壞ACD。
這些結果突顯出3D ATAC-PALM是一種有用的工具，可探測基因組的結構和組織機制。
https://www.nature.com/articles/s41592-020-0775-2
小柯報道：
http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/2020/3/202031813261027655456.shtm
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