從深秋（10月中旬前後）至春季及初夏（2-5月份），甲魚都會冬眠。甲魚的最適宜生長水溫是24～30℃，當水溫降至18℃時，甲魚基本不吃食物，還有活動。當水溫降至15℃以下時，就基本冬眠。有的養殖戶誤認為甲魚不吃不動就不用管理了，這樣往往會造成很大損失，因此，還必須掌握甲魚冬季工作重點。防凍有些小甲魚、特別是甲魚崽會選擇草叢中或池塘邊的坡上鬆軟處越冬，一旦嚴冬天氣來到，這些草叢和池塘邊的坡都會結冰，這樣，在此越冬的小甲魚和甲魚崽都會被凍死。
所以，甲魚冬眠前一定要清除池塘的一切草及其他植物，池塘要用混凝土護坡。防病在春季及初夏時節，有的甲魚養殖戶會發現甲魚大量死亡。
其原因有三：
一是甲魚在上年夏季吃了大量死魚、蛆、變質飼料等含有細菌、真菌、病毒、寄生蟲的食物。當時，甲魚正當正常生長時期，生命力強，抵抗力強，因而沒有患病。但大量細菌、真菌、病毒、寄生蟲儲藏在甲魚體內了。這些細菌、真菌、病毒、寄生蟲在寒冷季節活動能力弱，也不會致甲魚患病。但到了春季及初夏天氣回暖，甲魚體中的細菌、真菌、病毒、寄生蟲就開始活躍起來，大量繁殖，吞噬甲魚的內臟。
而此時的甲魚尚未正常活動，免疫力和抵抗力尚未恢復，所以大量病亡。
二是水質差。春季及初夏天氣溫暖，適合各類細菌、真菌、病毒、寄生蟲繁殖生長，水中有大量細菌、真菌、病毒、寄生蟲使甲魚感染致病。也可能水中缺氧，或含有毒物質，不宜甲魚生存使其致病。
三是春季及初夏氣候異常，氣溫變化大，甲魚不能適應。防病的對策是：不可餵給蛆、死魚、變質飼料等含有細菌、真菌、病毒、寄生蟲的食物。定期對魚塘的水進行細心觀察或檢測，酌情消毒。
當年出殼的甲魚崽特別是最後一批出殼的甲魚崽，要餵給精飼料，最好還要在秋季採用溫室飼養一段時間，使其足夠強壯能順利越冬。小甲魚池特別是甲魚崽池，最好用農膜等物蓋起來，既可延長甲魚崽的生長期，又能防甲魚崽在嚴冬被凍死。防盜甲魚價格昂貴，小偷對甲魚養殖戶的危害極大。
炎熱季節甲魚活動旺盛時期，他們用捕魚的絲網在精養魚塘幾十分鐘就可捕獲數百千克甲魚。寒冷季節甲魚冬眠期間，他們穿著“下水褲”（防水褲）在精養魚塘踩探到甲魚，然後用鐵鉤勾起，一會兒功夫也能偷去幾十千克甲魚。有的甲魚養殖戶以為養條狼狗就可以防盜，萬事大吉。其實不然，偷盜者用根肉骨頭就可制服狗，有的偷盜者其實就是熟人。所以，一定要有專人看守。防貓在甲魚的冬眠期，如果是大晴天，氣溫較高，水溫可能達到攝氏15℃以上。
這時，甲魚會有些活動。但由於天氣還不正常，甲魚還未能正常進食，反應遲鈍，活動緩慢，對天敵的抵禦能力很弱。特別是150克以下的小甲魚及甲魚崽的處境十分危險，貓會光顧精養甲魚塘，在塘邊輕易地大量捕食小甲魚。所以，一定要嚴防貓進入甲魚塘。防鳥到了冬季，我們會發現魚塘有鳥光顧，它們可能是北方來的侯鳥，來魚塘是為了覓食。它們能從空中發起突然襲擊，捕食到水面遊動的小魚小蝦。甲魚崽一旦露出水面，就難逃厄運。所以，要設法驅趕鳥，最好是用網把小甲魚池特別是甲魚崽池蓋上。防鼠老鼠也會捕食小甲魚和甲魚崽，要做好滅鼠工作。
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