掃平外戚勢力之後，漢和帝劉肇終於得以臨朝親政。漢和帝重賞了平反有功的劉慶，賞給他大量錢糧，恩寵之深厚，一時沒有第二個皇親國戚可以與之相提並論。而另一位功臣鄭眾則是劉肇賞賜最為豐厚的另一個人。鄭眾前半生多鬱郁不得志，經過這次平叛，助皇帝奪回大權，自然能夠平步青雲。於是，鄭眾被任命為大長秋。大長秋一職，乍看之下名不見經傳，細細思量，才知道這一官職是則是皇帝近侍官首領，非皇帝親信不得充任，主要負責宣達旨意，管理宮中事務。
剛開始之時，皇帝劉肇還對宦官掌權有所顧忌，歷朝以來，宦官掌權，江山必亂。因此，並沒有給予鄭眾參與軍政大事的權力。鄭眾也對自己的處境很瞭解，因此，每次皇帝賞賜，他都推脫不要。其仁愛謙遜的態度便逐漸受到皇帝劉肇的喜愛和尊重，進而在遇到國家大事難以解決，而朝中重臣相繼死去的情況下，詔令鄭眾與之商議。至此，宦官之權柄得以擴大，並滲透到國家的大政方針之中。
在封賞功臣的同時，劉肇也開始大力革新國家政策，逐漸實踐著自己的政治抱負。永元四年，劉肇剛一上任就頒佈詔令減土地稅。後來，他又多次下詔，勸農權耕。通過這一舉動，劉肇勤政愛民的形象便被人民廣為傳誦。但是，皇帝劉肇畢個人精力有限。自己所依靠的幾個重臣相繼過世，永元五年，千乘王劉伉死去，永元五年，廣宗王劉萬歲死去;不久後太尉尹睦和司徒袁安等幾個國之棟樑也相繼去世，一時之間，朝堂可用之人變得越來越少為了解決這一問題，永元五年三月，劉肇特別頒佈了一紙詔令，責令選賢任能。
可以看出，和帝劉肇實在不失為一個年輕有為的英明聖主。他在平定竇氏亂朝之後，積極支持班超在西域的鬥爭，不久，班超大破焉耆，西域降附者五十餘國。同時派遣著名將領烏桓校尉任尚領兵東北，大破南單于，收復遼東。而他在小的時候，便深諳為政之要，對於百姓懷有一顆憐憫之心，給百姓減少了不少稅收。
漢和帝非常仁慈，以寬和的態度對待犯罪。即使他知道竇太后的所作所為，並能夠無所顧忌地懲處她時，劉肇也沒有采取行動，而是讓竇太后恩寵不減，直到她死後，依然力排眾議，以“恩不忍離、義不容虧”為由，將竇太后諡為章德皇后。此外，和帝還一直堅持以民為本、任人唯賢、注重道德教化左右，使得漢朝在他的治理下，整個國家與他的諡號“和”帝暗合，一時之間，大漢朝四海昇平、海晏河清。
