二戰時，日本佔領印尼後。蘇哈托就登上了歷史的舞臺，起初他僅僅是警局的一個普通警察。後出任陸軍參謀助理，不久又坐上了戰備後備司令的極高官銜。並在1965年依靠印尼混亂的局勢渾水摸魚般的成為了印尼總統。由此開始了他罪惡的人生。其家族佔有當時印尼全國的大量財富，印尼僅是其財富的儲存地。
在1963年印尼由於領土問題同時與蘇聯美國交惡並於不久退出聯合國。時任印尼總統蘇加諾為穩定當前局勢決意與中共交好，並挫敗了一場政變，而這恰恰是蘇哈托髮際的開始。時候蘇哈托以共產黨牟圖推翻印尼政府的謠言控制蘇加諾，並開始反共清洗運動。背後有著明顯的西方勢力的介入。美國加拿大等國家為其提供了極大地輿論支持以及經濟援助至少6400萬美元。並將此次屠殺渲染成反抗東方的“鐵幕”行為。為其合法性找藉口。當海牙法庭的判決下達後，西方勢力拒絕承認共謀指控，印尼官方也矢口否認。至今任何一方都為承擔任何懲處。
蘇哈托拿著美國給他的所謂共黨名單大肆殺伐，由於印尼多為穆斯林對於不信教的中國人具有天生的敵意加之西方邪惡勢力的慫恿，華人被屠殺已經是不爭的事實。
而之前在萬隆會議上中方“和平共處五項原則”是中方獲得了廣泛的影響力。與此同時，中印雙方還簽署了一項條約，由於中國人自古就有人去印謀生，當時擁有兩國國籍的人數量相當之多。條約簽訂以後，這些擁有對方國籍的人就被視為對方國籍，中國由於“五原則”的束縛無法保護印尼華人。而印尼華人世代生活居住在印尼，也不願回國因此選擇印尼國籍。更可怕的是，中國在此之前一直資助當地的共產黨反政府武裝。蘇哈托上臺後對中國展開了瘋狂的報復。50萬華人慘遭屠戮。
對於當年的屠殺，印尼人不以為恥反以為榮。以屠殺共產黨為一件神聖的事，是保衛印尼民主的偉大勝利。至今印尼的學校教科書中對於此事依然認為是光榮的。在2008年1月29日下午，外交部發言人姜瑜舉行例行記者會答問時表示，中方對蘇哈托先生的逝世表示哀悼。 有記者問：印尼前總統蘇哈托近日去世。中方對此有何評論？姜瑜說，蘇哈托先生為中印尼復交及兩國關係發展作出了貢獻。中方對他的逝世表示哀悼。
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