位于陕西省延安市子长县（原安定县）中山街盐务局院内。
1935年2月以前，陕北存在着地域隔绝的两个苏区、两个党组织和两支红军：陕甘边苏区设有陕甘边特委，归中共陕西省委领导，拥有红26军；陕北苏区设有陕北特委，归中共中央驻北方代表及河北省委领导，拥有红27军。1935年2月5日，双方经过协商，在安定周家硷成立中共西北工作委员会（书记惠子俊）和西北军事委员会（主席谢子长），实现了两个苏区党组织和两支红军的统一领导。谢子长逝世后，在刘志丹的指挥下，西北红军彻底粉碎了国民党反动派对陕北苏区的第二次“围剿”，解放了安定、延川、延长、安塞、保安、靖边六座县城，两个苏区连成一片，面积扩大到3万多平方公里，人口90万，建立了20多个县的苏维埃政权。
1935年7月，中共中央驻北方代表及上海临时中央局先后派原中共河北省委副书记朱理治、原中共中央秘书聂鸿钧进入陕北革命根据地，组成中共中央北方局驻西北代表团，领导西北地区党政军工作，负责处理党内的“右倾”问题。
代表团认为陕甘党内存在着严重的“右倾取消主义”和“右派”活动，认为陕北形势和全国一样，正处在“伟大阶级决斗的前夜”，革命力量已超过反革命力量，要求陕北红军“全线出击”，“不让敌人蹂躏苏区一寸土地”。
1935年9月7日，红25军到达陕北革命根据地的保安豹子川。9月18日，到达延川县永坪镇，程子华被吸收为中共中央北方局驻西北代表团成员。代表团下令取消西北工委，成立陕甘晋省委，改组西北军委，将刘志丹等陕甘、陕北红军负责人排挤出主要领导岗位。
正值国民党军队对陕北革命根据地发动第三次“围剿”的紧急时刻，王明“左”倾主义者主观武断地认为陕甘红军和根据地的领导者是“右派”、“反革命”，开始了错误肃反。9月21日，陕甘晋省委发出“更加猛烈地反对反革命的右倾取消主义”指示，决定建立政治保卫系统，颁布赤色戒严令，并派人分别到前方和陕甘边逮捕干部。
1935年10月初，劳山战役刚结束，西北代表团以指挥北线作战名义调刘志丹回瓦窑堡。刘志丹行至安塞真武洞时，路遇赴前线传达命令的通讯员，从陕甘晋省委给前线的指示信里看到逮捕红26军和陕甘边领导人名单，他亦名列其中。为了使陕北革命根据地不致丧失，他原样将信件封好，嘱咐通讯员送往前线，自己星夜驰至瓦窑堡，希望说服省委停止肃反。10月6日凌晨，刘志丹刚进入省委大院，即遭保卫局逮捕。前线遂将高岗、习仲勋、杨森、杨琪、刘景范、马文瑞等高级干部秘密逮捕押至瓦窑堡保卫局，并红26军营以上、陕甘边苏维埃政府区以上领导干部及国统区过来的青年知识分子200余人杀害。
刘志丹等60余人关押西北保卫局（原汇川通商号，今子长县副食公司院）。保卫人员给他戴以重镣，爬宽不盈尺砖壕，用灌辣椒水、做老虎凳等手段昼夜审讯，索取口供。
大规模的捕杀使陕北苏区陷入人人自危的恐慌之中，引发了陕甘、陕北红军与25军间的误解，陕北革命根据地面临严重危机。
中央红军到达吴起镇后，毛泽东获悉陕北正在肃反，且处于步步升级之中，立即派罗迈、贾拓夫带一部无线电台作为先遣队找寻陕北红军和刘志丹。罗迈等在下寺湾遇到前来迎接中央红军的郭洪涛、程子华，得知刘志丹等关押瓦窑堡，随即通过电台向中央作了汇报。党中央下令：停止逮捕，停止审查，停止杀人，一切听候中央来解决。并指示王首道（中央保卫局长）、贾拓夫（中央军委总政破坏部部长）、刘向山等先行到瓦窑堡接管西北保卫局，防止事态发展恶化。10月13日，王首道一行到达瓦窑堡，传达了中央命令，接管了西北保卫局。11月7日，中央机关进驻瓦窑堡，并于当天下午首批释放了刘志丹、高岗、杨森、杨琪、张秀山、习仲勋、刘景范、高景纯、赵启明、胡彦英、黄罗斌、郭宝珊、高朗亭、任浪花、孔令甫、朱奎、王聚德、王家娃（刘志丹警卫员）等18人。
西北中央局组成党务委员会审查错误肃反，董必武任主任，王首道、张云逸、罗迈、郭洪涛为委员。委员会审查了戴季英（西北保卫局局长）提供的案卷并进行了广泛调查，认为刘志丹等不是“右派”、“反革命”，强加的罪状不能成立。11月26日，中央组织部在瓦窑堡第二高小召开平反大会，洛甫主持，博古、邓发、张浩、朱理治、聂鸿钧、戴季英及党务委员成员和陕北部分干部参加。王首道宣读《西北中央局审查肃反工作的决定》，指出：刘志丹等人是无罪的，应予以平反，重新分配工作。刘志丹在会上发言：这次肃反是错误的，同志们受了委屈，我们相信中央会弄清是非，正确处理的；也相信犯错误的同志会认识错误，改正错误，更希望受委屈的同志顾全大局，团结一致，共同对敌。会上由王首道宣读中央《关于戴季英、聂鸿钧二同志在陕甘区域肃反工作中所犯错误的处分决议》，决定给戴季英以最后警告、聂鸿钧以严重警告处分。
毛泽东、周恩来到达瓦窑堡后，听取了王首道处理肃反事件的汇报，严肃指出：“逮捕刘志丹同志是完全错误的，是 ‘疯狂病’应立即予以释放。”12月中旬，关押人员全部释放。
关押刘志丹旧址，位于子长县盐务局院内，院内现存旧砖窑13孔，其中东有一排坐东向西的窑洞3孔，北有一排坐北向南的窑洞6孔，西有一排坐西向东的窑洞4孔。南面有一栋大楼。进入东北角上的巷道，内有一孔小窑洞，该窑洞宽1.6米，高1.8米，为关押刘志丹的地方。
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