聽香水榭軒
首先需要澄清，在黑暗戰役中，最先攻擊自然選擇號等戰艦的不是藍色空間號，而是終極規律號，它向其他四艘戰艦發射了十二枚次聲波氫彈。藍色空間號應該算是自衛反擊，根據書中描述，它提前做了應對措施，內部抽成真空，所有人員都穿上了航天服。真空條件下不可能產生次聲波，所以終極規律號的攻擊沒有造成藍色空間號的人員傷亡，只是使艦體受到輕微損傷。
之後，藍色空間號迅速反擊，先是用高能伽馬射線激光擊中終極規律號，使艦體被灼出大洞、內部迅速起火併爆炸的終極規律號失去了作戰能力，然後用氫彈和電磁動能彈連續攻擊，最終全滅終極規律號，終極規律號上的人員無一生還。
同樣的結果也發生在自然選擇號、企業號、深空號三艘戰艦上。具體過程書裡沒有詳寫，但可以分析出來，它們應該都是被終極規律號的次聲波氫彈一招斃命的。因為書裡寫了終極規律號一開始就同時向四艘戰艦發動進攻（向距離更遠的自然選擇號發射的氫彈更早一些，因為要確保四艘戰艦同時爆炸），但沒有說除了藍色空間號還有哪艘戰艦也提前抽成了真空，所以另外三艘戰艦應該是被終極規律號成功滅掉。
戰爭結束後，除了已經在爆炸中解體的終極規律號，其餘三艘戰艦的燃料都被藍色空間號收集起來，各種部件則被拆卸下來，由藍色空間號攜帶著繼續太空遠行。那些部件相當多，以致藍色空間號內部放不下，只能在船體上再弄幾個外部存儲艙。三艘戰艦剩下的艦體呢，則被用來搭建了太空陵墓。
可見那三艘戰艦的艦體並無太大損害，物件都保存得挺齊整，這也證明了它們是被次聲波氫彈滅掉的。因為書中有寫，這種武器的特點就是可以殺死飛船內的一切宏觀生命，同時不損壞飛行設備。
總之，那三艘戰艦一開始就被終極規律號滅掉了，只有藍色空間號反過來滅掉了終極規律號。所以，雖說藍色空間號是最後的勝利者，是真正從黑暗中孕育出來的太空新人類，但由於不是第一個動手，而是“自衛反擊”，感覺上似乎罪孽也就輕了一點。
當然，這其實也是錯覺。按照書裡的描寫，當時應該是幾艘戰艦都同時領悟到黑暗森林法則了，就看誰先下手。企業號和深空號的情況，書裡沒寫。但自然選擇號是準備下手的，章北海都拆掉氫彈戰鬥部的第二道保險鎖了，就比終極規律號晚了一點，致使這位無數讀者喜歡的英雄提前領了盒飯。只能說藍色空間號更聰明，不但猜到大家都會下手，而且猜到大家都會選擇次聲波氫彈，所以提前做好防範，躲過次聲波後反戈一擊，不但成為最後的贏家，而且手上染的血只來自“自衛反擊”。至於另外幾艘犧牲的戰艦，賬得算到終極規律號身上，不算藍色空間號的罪孽，因為不是藍色空間號攻擊它們的。
這麼縝密的思維，難怪很多人覺得藍色空間號的艦長褚巖才是真正的鋼印族，算是得到章北海衣缽真傳——雖然兩人之前實際上沒有太多交集。不管褚巖是不是鋼印族，後來青銅時代號返航後被暗算，藍色空間號安然無恙，還成功策動萬有引力號發射了引力波，種種敘寫，雖然簡略，也足夠說明褚巖這個人物足以擔當太空新人類的領袖了。
藍色空間號和褚巖給人好感，是因為這艘戰艦在這位艦長的帶領下，種種表現算是在人類推崇的人性、道義和太空新人類所需要的理性新法則之間，找到了最佳平衡。
所以前面有答主說，獲勝後的藍色空間號不忍心佔用被滅掉的同類之前所擁有的戰艦，似乎也不無道理。
不過在我看來，更實在的理由是沒必要佔用自然選擇號。
誠然，作為人類太空艦隊後期發展的新型戰艦、亞洲艦隊第三分艦隊的旗艦，自然選擇號在噸位和性能上都是首屈一指的。具體有多厲害就不多說了，書裡有詳細描寫。
但是，藍色空間號是追擊自然選擇號的戰艦之一，自然不可能比自然選擇號落後，否則怎麼完成追擊任務？我想，至少在性能上應該是不相上下的，最多是噸位有所區別。
書中有寫，自然選擇號上的人員有兩千多名。黑暗戰役結束後，倖存的藍色空間號總有一千二百七十三人，可見藍色空間號的規模也不小，至少抵得上半個自然選擇號有餘。
黑暗戰役中總共有四千二百四十七名死者，分屬被消滅的四艘戰艦。其中自然選擇號就有兩千多名了，那麼終極規律號、企業號、深空號加起來也就最多兩千名出頭，也就是這三艘戰艦加起來的體量才抵得上一個自然選擇號。由此可見，這幾艘戰艦中，除了自然選擇號，很可能體量最大的就是藍色空間號了。
換言之，藍色空間號自己就是第二位了，沒必要非得佔據第一位的飛船。與其費時費力地搬遷到自然選擇號上，還不如把它拆了帶走。畢竟，就算搬過去了，那不還得把原來的母艦藍色空間號拆掉帶走？何必多此一舉呢。
以上是頭條號“海闊天空詩酒花”的回答。歡迎在今日頭條APP關注“海闊天空詩酒花”，圖文、問答、視頻，海闊天空隨便聊。
海闊天空詩酒花
去，問艦長去！！！
隔壁的那個人兒
這個問題，我只能說我自己的看法。
第一，當時處於生死存亡的時刻，資源即是一切，任何對資源存在損耗的東西都必須掃清，為了人類的延續。所以如果選擇自然選擇號，那麼會有一個人遷徙的步驟，然後再來拆藍色空間號，比起直接拆自然選擇號，這中間就存在資源的損耗。
第二，儘管為了全人類的存在，當時藍色空間號才先動手攻擊了自然選擇號。這就像是你舉著大義的旗幟揮刀殺掉了你的袍澤，親人，摯友。你覺得在他們生活過的家裡，你還能心安理得的活著嗎.
Severus林茂
自然選擇號是被打壞了才失敗的，壞了就是不能用了，有一個現成可用的藍色空間號，和一個不知道能不能修復的自然選擇號，在減少能源和物料損失的要求下，你猜猜聰明人會如何選？
沭水小霸王
因為被打擊了啊，肯定有損壞嘛，未來長路漫漫，不可能用有隱患的飛船來長征吧
