2020年2月26日，韓國首爾，為防止感染冠狀病毒，一名婦女戴著口罩急匆匆地走過傳統市場，在她身後，一家消毒服務公司的員工正在消毒。
攝影：KIM HONG-JI, REUTERS
2020年的今天，全球正在遭受著，又一波恐怖的傳染病，而且在以驚人的速度，從中國，再到全球的蔓延，回想我們人類過去的幾萬年的發展歷程，從古代輕易就毀掉一個村的瘟疫，到後來的天花病毒，只是一個歐洲，就死了5億人！要知道，當時的世界總人口也就17億左右，這一下，都快死了三分之一的人了。
我們人類的歷史，一直說是一部侵略和被侵略的戰爭史，成王敗寇，就像中國的抗日戰爭，直接改變了中國和日本的關係和命運。但今天我想說的是，病毒同樣改變了人類的文明進程，有一個人因為戰爭而死，就會有兩個人因為患病而死。
今天，想從進化的角度，尤其是病毒進化的角度，來看看它對我們人類的影響和改變。
01
首先，還是要和大家再介紹一下病毒。
我還是最喜歡邴鍾興老師的比喻，它把病毒比喻成，我們日常的費列羅巧克力，別說，還真的很形象。
外面的花生仁就是病毒的蛋白質外殼，裡面咬開，會有一顆杏仁，就是病毒裡最重要的物質，遺傳物質，可以是DNA，可以是RNA，甚至有些病毒根本沒有遺傳物質，它只不過是一層蛋白質外殼，也可以幫助他們進行侵染。這就是病毒的構成。
以下這些都是不同形態的病毒。
那病毒的存在，和地球上所有的物種一樣，只有一個目的，存活下去。
因為我們前面說到，病毒結構其實超級簡單，它只有遺傳物質核酸（DNA或RNA），有些甚至都沒有，外面再加一個蛋白質衣殼，所以病毒是無法獨立進行代謝和生長，它只能利用由感染的機制，進入宿主，利用宿主的細胞系統進行自我複製。
同時，它也藉助宿主細胞代謝產生的能量才能生存和增殖，所以如果宿主死光了，病毒也就完蛋了。
病毒就是要通過這種方式老延續自己的基因，病毒和宿主的關係有些類似捕食者和獵物，前者依賴於後者存活。兩者的數量變化會呈現出先增先減、後增後減的模式，形成一個循環：
病毒出現→宿主減少→病毒減少→宿主增多→病毒增多，實現動態平衡。
而這個平衡一旦被打破，要不就是我們人類死亡，要不就是病毒被消滅。
比如：大名鼎鼎的天花病毒，就是這樣被滅掉的。愛德華·琴納醫生從擠奶工的身上得到啟發，發明的牛痘接種疫苗並大範圍普及，讓天花病毒，成為了首個被人類戰勝的病毒。
02
那麼，在病毒依賴宿主生活這樣的一個模式下，我們為什麼會死亡呢？
這就是我們人類，或者說是所有物種的一個自私的“自我保護機制”在起作用了。
每種生物的基因都希望自身永久延續，宿主不想把能量白給病毒用，更不能容忍病毒在細胞內增殖，就動用免疫系統對付病毒了，最常見的就是炎症。而病毒為了確保自己能安全借宿，也會表達一些毒蛋白對付宿主，使免疫機制不能正常運行，直至細胞裂解、凋亡。
宿主死於病毒感染，一部分是病毒表達的毒蛋白直接導致的，也有一部分是宿主過激的炎症造成的。
炎症非常厲害，不僅消滅病毒，也消滅被病毒感染的細胞，如果炎症反應以嚴重損害機體為代價仍沒有消滅病毒，那麼病毒捲土重來或者發生繼發性細菌感染，就能要了宿主的命。
而我們所說的野生動物，比如蝙蝠的免疫機制就比人類要聰明的多。
蝙蝠的炎症是被削弱的，它不指望徹底滅了病毒，只要抑制住病毒過度增殖就可以了。而且蝙蝠細胞內干擾素水平日常就非常高，即使病毒表達的毒蛋白破壞了一部分干擾素，剩下的也足夠抑制病毒了。
正因為如此，蝙蝠才能攜帶如此多的可怕病毒而不生病，有埃博拉病毒、馬爾堡病毒和多種冠狀病毒等。
蝙蝠並非百毒不侵，它只是經過長期演化已經適應了這些病毒而已，它感染外源性病毒也會生病的，比如狂犬病毒。
03
病毒的終極進化
《進化論》達爾文認為，生物之間存在著生存爭鬥，適應者生存下來，不適者則被淘汰，這就是自然的選擇。生物正是通過遺傳、變異和自然選擇，從低級到高級，從簡單到複雜，種類由少到多地進化著、發展著。以上三點，即是我們常聽到的"物競天擇，適者生存"，現代基因學的誕生，為此提供了重要的證據，事實上，物競天擇，競的是"基因"。
這次新型冠狀病毒肺炎，很多科學家培育毒株，來研製攻克病毒的疫苗，為了儘快結束這場災難。但是，病毒的變異速度太快了，尤其是像RNA病毒，可能疫苗剛做好，病毒就已經大面積轉移變異了。
當地時間3月2日，中國醫學科學院北京協和醫院、中國疾控中心、加州大學洛杉磯分校、匹茲堡大學、湖南大學五家合作單位的研究人員共同在生物科學預印本網站bioRxiv在線發表了一項針對新冠病毒演化過程中的突變、重組和插入的重磅研究（“Mutations, Recombination and Insertion in the Evolution of 2019-nCoV”）。
研究通過分析病毒的突變，解釋新冠病毒為何傳染性能顯著增強。
人類新冠病毒（2019-nCoV）和蝙蝠RaTG13病毒蛋白之間的差異在2005年至2012年之間已經開始出現點突變。同時新冠病毒，還在不停的發生重組。
結果表明，2019-nCoV的S蛋白可能從穿山甲冠狀病毒衍生出來，而不是蝙蝠冠狀病毒RaTG13。而在2019- nCoV的進化過程中，RaTG13樣冠狀病毒和穿山甲樣冠狀病毒病毒株之間可能發生了重組。
而這些證據，也許可以解釋新冠病毒相比SARS、MERS相關的β冠狀病毒傳染性顯著增加的原因。
就像之前有部電影《感染》裡的一樣，病毒發生重組，感染和死亡人數驚人。
經過幾千萬年的自然選擇，病毒與蝙蝠和平共處，這就是最終進化形態了嗎？還不是。
有一類病毒叫內源性病毒，它直接整合到宿主的基因組中去了，建立終身感染，隨著宿主基因複製而複製，並遺傳給子代。
這類病毒不會對宿主產生任何危害，宿主也完全接納它了。
內源性病毒是一類逆轉錄病毒。有細胞生物的遺傳物質都是DNA，DNA轉錄成RNA，再翻譯成蛋白質，參與代謝活動。內源性病毒的遺傳物質是RNA，它有兩個酶特別厲害，逆轉錄酶把RNA逆轉錄成雙鏈DNA，整合酶負責將雙鏈DNA整合到宿主基因組中，形成沉默的原病毒，潛伏在細胞中。
多數內源性病毒已經因基因突變而失活，無法再重新組裝成病毒了，事實上它們也不需要再組裝了。
有的內源性病毒甚至在宿主細胞內承擔一定功能，成為了轉座子。
轉座子是一類特殊的基因序列，又叫跳躍基因，可以單獨複製或斷裂成環，對後續基因表達起重要調控作用。
人類DNA有5~8%來自病毒
本質上，生物的繁殖演化，只是一些DNA排列組合不斷演變而已，其實 生物在利用病毒的DNA來幫助自己演化，這是很常見的事情。
比如說，這段基因導致這個生物死去，它就失敗了，但是其他留下來的生物，從進化論的角度，它獲得了更有利於繁殖後代的能力，同時也把改造過的基因傳遞下去。
所以，為什麼說病毒，推動了人類的進化進程。在人與病毒的幾萬年的糾葛中，我們隨時有可能會掛掉，我們人類一直都是在與病毒不斷博弈的過程中，不斷獲得新的認識。
我們知道的都是一些已知的病毒，我們見過它才能提供正確的治療方法去消滅它，但是遇到了未知的病毒，就像這次新型冠狀病毒，我們對它一無所知，雖然它很像是SARS，但它對 科學家、醫生的考驗非常強大。
怎麼樣在最短的時間裡研製出正確的解藥，如何在最短的時間內降低死亡率，這都是對醫生、對醫療體系一次嚴峻的考驗 。
生物進化雖然是有方向的，由自然選擇決定，但進化永遠不以生物體意志為轉移。
進化從來不是美妙的，這其中要有大量的不適者被淘汰，有可能就是我們人類。請問誰願意做這個被病毒淘汰的不適者？未來病毒會朝著什麼方向去進化？他的感染力和致病力又會怎樣？我們又將經歷什麼大型感染？我們無從得知。
因此，雖然病毒不想消滅我們，我們一定要消滅病毒。
這必將是一場持久戰，敬畏生命，敬畏病毒，加油，人類！
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