科学研究发现，1型糖尿病、免疫性关节炎等疾病与免疫系统异常有关，甚至2型糖尿病也存在免疫细胞异常情况，造成长期低度炎症反应。为什么出现这些情况呢？美国加利福尼亚非营利性自身免疫研究基金会（ARF）的研究人员研究认为，在自身免疫性疾病中观察到的抗体（就是一种蛋白质）实际上是由于隐藏细菌对人类基因和基因产物的改变而产生的，与有害细菌有关。因此，改善身体的细菌有助于缓解与治疗这些疾病。
一、人体细胞与细菌的关系
过去十年中，DNA的发现促使NIH人类微生物组计划的发展。他们估计，人体中多达90％的细胞是细菌起源的。这些细菌中有许多尚未被命名和表征，与自身免疫性疾病的发展有关。
因此，我们必须研究细菌和人类基因之间的相互作用，以便充分了解与人类有关的任何过程，特别是因为这些途径中的一些是自身免疫疾病的发病机理。
二、所谓益生菌也是相对的
研究发现，单一基因ACE对心肌梗塞、肾小管发育不全、阿尔茨海默氏病、SARS、糖尿病和结节病发展有影响，但最近已证明ACE受常见细菌乳杆菌和双歧杆菌影响，而这两种肠道细菌通常认为是益生菌。没有人会认为这些物种不存在于人体中，但对这些“友好”物种如何影响疾病的研究还不足。
三、肠道菌群对健康的影响
人体的大部分细菌存在与肠道，大约有1-1.5公斤重，有几百种细菌。这些细菌的多样性、组成对于人体健康非常重要，他们如果进入血液系统，或者释放有害代谢产物，都会危害健康。研究也发现，糖尿病人的肝脏、肾脏等器官发现很多基于肠道细菌，就是对此的一个显著证据。
四、自身免疫系统攻击的抗体可能来自细菌
研究团队认为：对身体本身产生的自身抗体，现在可以理解为针对隐藏细菌的抗体。在自身免疫性疾病中，免疫系统不会自我攻击。这些异常抗体实际来自细菌，包括1型糖尿病的成因，也可能如此。
五、怎么来减少细菌对人体伤害？
1、保护肠道黏膜与其他皮肤黏膜，减少细菌、病毒进入人体机会；
2、益生菌是相对的，肠道菌群平衡更重要，不要过度补充益生菌；
3、多补充膳食纤维益生元，调节肠道内环境，减少有害菌；
4、少喝酒，少吃油炸腌制等垃圾食品，少喝糖饮料（特别是果糖），减少肠漏，减少细菌入血；
5、多吃蔬菜少吃肉，减少有害菌生长环境；
6、注意个人卫生，少接触有害菌。
