1、黴菌毒素能引起法氏囊、胸腺和脾臟等免疫器官萎縮，誘發免疫抑制。引起新城疫、流感等免疫失敗。
2、黴菌毒素會造成經常性的拉稀，腸道病久治不愈，飼料便頻繁發生，採食量大大減少，體重大大下降。
3、黴菌毒素具有極強的腐蝕性，對消化道的破壞相當嚴重，同時可抑制多種維生素的利用。能引起口腔潰瘍，嗉囊的炎症以及病情後期的假膜，潰瘍性以及增生性腺炎，腺胃與肌胃交界處形成潰瘍，肌胃角質膜易剝離。角質膜增厚以及角質膜下形成出血潰瘍，腸道脆性增大，腸粘膜脫落、壞死。影響機體對營養物質的消化和吸收，飼料利用率和轉化率降低。
4、黴菌毒素中毒可導致肝臟多灶性肝細胞壞死，肝細胞增生以及發病前期由於充血而呈暗紅色，後期由於脂肪聚集呈黃色，但不管發病前期與後期都為橡皮肝的感覺。膽囊黏膜由於膽小管的增生和壞死而發炎，出現膽囊脆性增大的現象。
5、黴菌毒素會造成種雞產蛋下降、蛋殼質量下降、受精率和孵化率下降，孵化中胚胎死亡多見；黴菌毒素通過減少肝臟卵黃前體的合成和轉運而對蛋雞產蛋造成影響，採食量的下降以及料價比的不合理是母雞性成熟延遲。
6、黴菌毒素對腎臟的損害表現為腎小管發生變性而阻塞，產生尿酸鹽沉積，從而導致痛風症的發生，不明病因腿病增多。
7、黴菌毒素對血管壁的損傷使血壓上升，增加了心臟的負擔，使腹水症多發。
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