甲馬營村現為甲馬營鎮政府駐地，西靠衛運河。村舊址原在鎮駐地以北。一九七二年,為了不影響次年進行的衛運河拓寬取直計劃，村莊南遷三百米，於鎮政府駐地南側重建新村。甲馬營村的歷史可以追溯到一千多年前，隋唐大運河時期和京杭大運河時期，它都是重要碼頭。相傳，宋太祖曾在此巡視兵營，這些都使這座千年古鎮充滿了神秘色彩。
明朝，朝廷為了進一步發揮運河的漕運作用，在甲馬營建起了水驛、漕運所、巡檢司，清朝雍正年間，又在甲馬營建造了墩臺，武城縣境內的運河岸上共建造了六處墩臺。每處墩臺撥兵五名，配備槍支五支，以保護運河漕運的安全。據史料記載，康熙六次下江南，乾隆六次下江南，都是路經此地。當時，甲馬營村北有一處大桃園，三月桃花盛開之時，好多遊客前來觀景遊玩。當時的武城縣有八大美景，甲馬營的“桃園春色”即是其中之一。
民國以前，甲馬營鎮有好多寺廟，如：大王廟、娘娘廟、觀音廟、關公廟、一山廟。鎮上每年立有兩會，一是二月會，一是十月會。每到會期，就搭臺唱大戲，還有說書的、演雜技的。沿河兩岸，方圓百里趕會的人成群結隊，紛至沓來。甲馬營村裡橫豎三條街上有三、四十家特色小吃，吃燻蒸燒烤肉食找張家，吃大餡肉餅找常家，吃細絲燜餅找李家，吃喝有館，住宿有店。甲馬營鎮優越的地理位置和經濟環境，吸引了好多商戶來此經商，山西的大富商王明就在甲馬營開了大染坊，並建起了“山西會館”。農曆“一、六”是甲馬營的傳統集日，方圓十里遠近的人們都到這裡來趕集。這些都給甲馬營帶來了經濟的繁榮和文化的積澱。
運河給甲馬營帶來了富裕，但在解放以前，由於社會生產力低下、吏治腐敗等原因，河道失修、水災旱災也給當地民眾帶來了深重的災難。據武城縣水文資料記載：從一八四零年至清末的七十一年間有二十五年發生洪災，其中一年決口兩次的有四個年份，同時多處決口的年份有兩個。民國時期三十八年間，運河發生洪災的年份就有二十一年。其中一九一七年和一九一八年，甲馬營鎮的西沙河東淹地分別為七十二萬畝和四十萬畝；一九二三年到一九二六年武城縣均遭洪災，其中一九二三年七月祝官屯處決口，淹村七十九個，淹地二十點七萬畝，西沙河東淹恩縣窪，八月夏津又決口，水淹武城縣的老城、楊莊、祝官屯三鄉鎮及恩縣窪。
一九三七年至一九三九年武城縣連續三年遭遇洪水。其中一九三七年鬧水災，全村千畝良田也全被淹，莊稼顆粒不收，村民大都是“冬無禦寒衣，家無隔夜糧。”一九四一年至一九四二年，當地又遭遇歷史罕見的特大幹旱，莊稼全部枯死，人們把草根、樹皮挖盡剝光，用以充飢。草挖盡了，樹皮剝光了，只好背井離鄉，逃往東北。當時，甲馬營村有七百零一口人，死的死，逃的逃，最後只剩下了300餘人。一九四三年至一九四四年運河又連續決口，淹地毀莊，歷經苦難的人們掙扎在死亡線上。
除了水旱災荒，戰亂也多次殃及甲馬營。金滅北宋，當地人淪為亡國奴；元滅南宋，當地人被奴役；明朝前期，燕王朱棣與其侄爭奪皇位，雙方軍隊形成拉鋸戰，當地居民被殺戮殆盡，十室九空
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