中成藥的內服外用各有章法，一般情況下外用藥物不適於內服，尤其是有毒之品，如鵝掌風藥水、正骨水、九一散等都切忌入口，以免中毒而腐蝕口腔黏膜。也有少數例外，如錫類散等，但須在有經驗的醫生指導下使用。
內服藥中，大粒蜜丸應掰開或切成小塊吞服；對於神志不清的病人，可將成藥用開水調化後經鼻飼管或口腔灌服；對嬰幼兒，可將成藥用乳汁、蜂蜜水或粥湯調成糊狀後服用。但是，腸溶片劑或膠囊必須整粒吞服，故小兒及不能吞嚥者勿用；散劑一般也宜調成糊狀後服用，不要直接倒入口中用水送服，以免嗆入氣管。
外用中成藥用法也不盡相同：①外塗，先將患處洗淨，將油膏、藥液在患處塗一薄層；②撒佈，將散劑直接均勻撒於患處，再以紗布等敷料固定；③調敷，將散劑用適當的液體(茶水、酒、醋、麻油等)調成糊狀，敷於患處，再用敷料包紮；④吹布，取紙捲成細紙筒，一端挑少許藥粉，一端放入口中將藥粉吹入患處；⑥貼用，將膏藥加熱烘軟，待其溫度適宜，貼於患處或規定部位。
服用劑量不能馬虎，應按規定劑量服用，不宜隨意增減。尤其是藥性峻烈或者組成中含有毒藥物的更應慎重，如蟾酥丸、六神丸、黑錫丹等。即使作用平和的或補益類中成藥，由於藥物都有偏性，盲目多用，也會影響人體的生理平衡。
服藥時間也要巧安排。一般的內服成藥，大多每日服用2～3次，於早、晚或早、中、晚各服1次。
宜飯後服用者：如無特殊規定，大部分藥物均可在飯後30分鐘～1小時服用。尤其是①對胃有刺激的藥物，如昆明山海棠片、雷公藤多苷片、骨仙片等；②消食導滯的成藥，如大山楂丸、開胸順氣丸等，宜飯後立即服用。
宜飯前用者：①滋補強壯藥，如左歸丸、右歸丸、雙龍補膏等。這些藥清晨或臨睡前空腹服用，有利於吸收；②祛痰藥，飯前服可使藥物刺激胃黏膜，間接促進支氣管分泌增加，從而稀釋痰液，有利排痰；③此外，峻下逐水藥宜清晨空腹服，潤腸通便藥宜空腹或半空腹服，驅蟲藥宜清晨空腹或晚上睡前服用，制胃酸的和幫助開胃的藥也宜飯前服。
宜睡前服用者：鎮靜安眠的中成藥，如天王補心丹、硃砂安神丸、養血安神糖漿等，宜睡前1～2小時服用。
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