《黄帝内经》云“夫自古通天者，生之本本于阴阳”，又云“阴阳者，天地之道也，万物之纲纪、变化之父母，生杀之本始，神明之府也，治病必求于本也”。意思是说：阴阳是天地一切事物的纲领，是事物运动变化的根源。当人体出现疾病伤痛，要从阴阳这个根本上确定原因。中医学理论八纲辩证中认为，阴与阳两纲是八纲之总纲。一切病症，均可归纳为阴阳两大类，即预测人体疾病就要从阴阳,也就是内外、上下、表里辩证分析，查找原因。
根据易学象、数、理的摹拟性，采用比类取象的方法，奇门遁甲以九宫八卦摹拟人体。
内外盘分别代表体内和体表，内盘为体内，代表脏腑、血液、神经、内分泌等等。外盘则为体表四肢、头、颈、肩、背、胸、腹等部位。
九宫代表的人体部位
离宫、巽宫、坤宫代表上部，包括头、肩、双耳；震、兑，中五宫代表中部，包括胸、背、腰、腹、肋部位，艮宫、坎宫、乾宫为下部包括左右、腿、脚、生殖器官、腹部。
依据八卦五行属性，奇门内外盘的结合，以离宫代表头部、眼睛、面部。离为火，主心脏血液、心脑血管，坤宫代表上右侧肢体。坤为土为肌肤、脾胃食道、胰脏等消化系统，
巽宫代表左上侧肢体，为耳朵、头发、肩。巽为风主伤风、中风、经络、气血，巽为木为胆，
震宫代表左肋、腰，震主动为脚足，震为木主肝，
兑宫代表右肋腰、胸部位，兑为金主肺、口舌、牙齿，体内为肺、气管。
艮为体表，代表左腿，艮为山在面部又为鼻子，艮为土又为肠胃消化系统结肠部位，
乾宫在体表为右腿，乾为天为首，代表头部，乾为金主胸、肺、脊髓、筋骨、大肠。
坎宫体表为腹部、生殖器，坎为水，在体内为膀胱、肾脏、内分泌系统。
十天干代表的人体部位
1、甲胆乙肝丙小肠 ，丁心戊胃己脾乡。庚是大肠辛是肺，壬是膀胱癸肾藏。
2、甲头乙肩丙为额，丁齿戊鼻己为面。庚筋辛肋壬为胫，癸为双足是真踪。
3、甲头乙项丙为肩，丁胸戊肚己为腹。庚为腰间辛为肋，壬为腹部癸四肢。
总的来说甲为首为头部（包括六甲值符）甲为木，为肝胆，同时六甲值符又各主其事，如甲子戊、甲戌己则主脾胃，甲申庚则为肠筋骨、肿块等，乙主肝胆、食道、脖项，乙的形象又代表神经、背部，乙为日奇居东方震宫，乙为花草之木故又代表中医、中药（因中药多为草木），依据乙奇落宫状态又有不同的判断思路，
如乙在离宫、巽宫一般为脖子、食道、颈椎，巽宫又多为肝胆部位。乙在震宫多主肝胆、足部，乙在坤宫又代表食道，乾宫又为脖子、颈椎，在坎宫又为男性生殖器，女性输卵管、阴道，也代表肝胆等。
丙在体表主额头、肩、背、嘴唇（因人体嘴唇红色）体内则为小肠，丙为太阳之火，主烧伤、烫伤、血光肿胀，测病多主病灶部位发炎红肿、血丝、伤口有血之象，如丙落离宫多主头部肿胀、眼睛有血丝，坎宫则主阴道、子宫发炎等现象发生，但一定要综合考虑。
丁为火主心脏、眼睛、牙齿，丁为阴火、星火也主炎症，但较丙火轻微一些。依形象而言，丁为手术刀、针灸，测病遇丁多主开刀手术治疗之象，或扎针灸，测病老年人多主心脏，特别落离、兑、乾宫，青年人则主眼睛、心脏，其它宫位多指病灶发炎，
戊在体表则为肌肤，皮肤病、鼻子、肚子，体内则主肠胃消化系统，戊为土主增生之象。例如，戊在离宫多主头部循环系统包括神经（临癸、腾 蛇 ）受阻出现脑血栓、偏瘫，临坎宫则主子宫肌肉增生，输卵管或尿道、阴道受阻，前列腺肥大，落中宫、震兑宫多主肠胃、腰椎增生、后背酸痛，临乾艮多主左右大腿、静脉曲张、压迫血液循环神经系统造成麻木、酸痛，左侧结肠等问题，妇女测病临壬，癸落中宫、兑宫、坎宫多主性生殖功能疾病，如输卵管堵塞造成不孕症。
己为面部，如临壬癸多主浓疮、粉刺，临离宫多主头上有浓疮、长疙瘩，在体内则主脾脏的问题，体表也代表口腔，
庚为大肠、筋骨，奇门遁甲中庚为阻隔之神，代表肿块，如庚临壬，癸落离宫多主血栓、脑瘤、血脂瘤，临坎宫多主腹部肿胀子宫肌瘤，庚临死门、伤门主癌症，如庚临死、伤落，乾离二宫多主脑癌、骨癌、血癌（临壬癸）临震巽多主肝癌，临艮宫则主结肠癌，坤宫则主食道癌，兑宫多主肺或支气管癌，中宫或兑宫又主腰椎增生，巽宫又主淋巴肿块或癌、脖子肿块，辛主肺部、支气管、腹部，
辛为金为骨骼，如辛在兑、乾、离宫多主支气管肺部的疾病，临中宫则主腰椎，临戊己多为骨刺或脊椎增生，临丙、丁多主肺炎、支气管发炎、肺结核等病，受伤部位则主胸、腹部。
壬为水主血液，主动脉、心脏、膀胱、泌尿系统又为眼睛、头发、腋下（因水主黑色）如壬临离宫多为心脑之疾，乾宫多为腿脑头部，坎宫则为生殖泌尿之疾，震、巽多为肝胆心脏、腿脚，特别壬落巽宫为六仪击刑必有腿脚之伤，看乾艮二宫那宫临伤门，白虎或景门凶格则必伤那条腿。特别男性、青年人，壬临坎宫则主糖尿病、膀胱、肾功能的问题，临坤宫则为食道、耳朵、脖子。
癸为水主肾、泌尿、输卵管、尿道、静脉、神经系统、足部、四肢、循环系统、中枢神经、性病，如临坎、兑宫多主生殖泌尿之疾，临离宫多主神经、脑血管，临巽宫则主腿脚伤灾（六仪击刑），坤宫主皮肤病。
八门
八门的落宫状态也是预测疾病时的重要参考因素。
开门主积极治疗宜到医院、外面去治不宜在家中，开门主开刀做手术治疗，开门为金落艮宫入墓则开刀治疗不理想。落乾兑吉，离宫凶，开门为病又代表肺痈、喉舌休门则主休息、静养，不宜四处跑动求医问药，
休门为病则主泻痢伤寒。
生门主愈合较好，治疗有望，有生机，不会死去，起死回生之意。生门为病则主痈毒、伤目。
伤门主伤灾、受伤部位，肿块、抽风、寒症、伤灾造成，比较难治，伤心过度。
杜门主阻隔、难度，治疗难度大，不顺利，堵塞之症。
景门则为血光之灾，受伤流血，心脑血管疾病，血压头晕等症。
死门主大凶，死亡，无药可救，治疗灰心，伤疤（死去的部位）、尸体腐烂的组织，肌肉坏死的部位。
惊门主心惊肉跳、心慌心律不齐，脉膊跳动不稳、失眠，多做恶梦惊醒，痨病，担心不能治疗等情况，大多反映病人心理状况。
八神
八神的落宫也能反映疾病的各种信息，例如：
病神临值符多得名医名院贵人、长辈、领导从中救治帮助，治疗环境好，医疗护理均为一流高档次的。
腾蛇主惊恐，病情变化不定时好时坏，疾病绕身，夜里多梦，遗精、中枢神经有问题，神经意识模糊。
太阴代表肺症、骨虚、无力之象，提不起精神，软弱无力等。
六合主综合症，多种病，扩散部位，麻疯症，多种疾病缠身，病变等。
白虎主伤病很重，主遭意外伤害，白虎亦代表受伤部位，如日时年命病神落宫乘白虎大多发生伤灾疾病或亲人去逝之事。如临伤门马星则主车祸引起，景门则主刀光血影或道路上发生，临开门则可能发生在工厂、企业、门面店铺之中，临死门则主身体易留下了伤疤或受灾之时又死了人。白虎落宫可能是受伤部位，例如白虎临乾宫可能头部受伤或脚上受伤，又可能为父亲去逝而戴孝。
玄武主暗疾，诊断不明却疾病困扰，病因不详，玄武代表头晕、昏迷、血液病，玄武又代表怪异之物作怪。玄武又代表呕吐，伤或死于路上。
九地为阴症，表示病情稳定，不扩散发展，但又有入地死亡之象，血压偏低、不精神、昏沉之象。
九天则主阳症，血压高，升天之象，病灶在上部，九天为失魂落魄，从高处摔伤之象。
格局组合
格局的克应变化，天地盘上下相加也反映病情病因。如：
天芮病神临乙十辛，龙逃走，丙十庚贼必去，虽为凶格，但要相对分析，说明病神即将离去。
而临辛十乙虎猖狂，丙十戊、鸟跌穴，戊十丙龙返首虽临吉格则好比人入坟墓之象，预示即将死去。
辛十乙虎猖狂，癸十丁，蛇天矫，辛十庚白虎出力，丙十癸，阴人害事，庚十丙贼必来，则说明病情将加重。
戊十丁，青龙转光，丁十丙，星随月转，辛十丁狱神得奇则预示病情即将好转。
戊十庚、庚十戊则疾病要扩散，需换医院医治，
戊十壬青龙入天牢，乙十己日奇入墓，乙十壬，日奇入地，丁十辛朱雀入狱，己十己地户逢鬼，己十辛游魂入墓，己十壬地网高张，己十癸地刑玄武，辛十戊困龙被伤，辛十癸天牢华盖，壬十辛腾蛇相缠，壬十壬蛇入地罗，癸十庚太白入网，癸十辛网盖天牢则主疾病缠绵不去，病情加重，久病不愈之象。而己十辛，己十己则预示旧病不去，新病又来，
乙十丙奇仪顺遂，乙十丁奇仪相佐，丙十乙日月并行，丁十丁星奇入太阴，庚十乙，太白逢星，壬十乙小蛇得势则说明病情向良好方向发展，
己十戊，犬遇青龙，壬十戊，小蛇化龙，辛十丁狱神得奇则有人帮助，得遇名师良药之象。
大格、小格均为病情不稳定。地遁其人必死，鬼遁五假人遁也非吉兆，三诈病情反复不定，玉女守门，久病不会治愈，三奇得使对病情有利，特别是丁奇、日奇为解救神，
朱雀投江丁十癸必死。癸十丁蛇天矫，易见鬼怪之象，伏干、飞干诊断不明而药不对症。飞宫、伏宫病人不安，家人惊恐，大格小格、胸闷而大小便不畅 。
刑格、悖格则肢体络相伤害，但年月日时临悖格则新旧病可治。
五不遇时人将逝，六仪击刑主大凶。特别是甲辰壬临巽四宫，甲寅癸临巽四宫必有伤残肢体脚、腿之灾。甲申庚临艮八宫则多主车祸、伤灾，甲子戊临震宫、甲午辛临离宫、甲戌己临坤宫一般主病痛之灾。
三刑如甲申庚十甲寅癸临巽宫，一般均主伤灾病痛。天网四张，网盖天牢，太白入网则主病难走，人临危。
新病逢空者生，久病逢空者死，
新病反吟则生，久病反吟则死，
另反吟又代表急性病，病情反复。
伏吟则为久病，慢性病，得病时间较长，短时期难以治愈。
用神
九星之中专以天芮星为测病之用神，看天芮星落宫结合本宫星门奇仪，内外格局判断各种病情病状，例如天芮为土宿，落离艮坤为得助则病情严重，落3、4宫则不药而愈，落坎宫则久病缠绵，但月令对病情发展，病人状态也极为重要，例如，辰月测病天芮病神临3、4宫，虽入宫受制但辰月土旺木衰，则病星惩凶，或日干年命临宫入死墓之地，又月令处死绝为死期或大凶不祥，月令也可做为应期。
另外，时干也代表病情病因，古歌云：“月干为人时干病，纳干之藏医药证，人克病兮可去瘥，病克人兮忧险应，医能克病始可投，病若伤人未可用。是说时干为病，日干为人；人克病则有望好转，病克人则凶险加重。
天心星，乙奇为医生医药，天心星为西医药，乙奇为中医药，如天心乙奇临开、体、生三吉门主药到病除之象。临死、惊、伤、杜则主医药均不理想，临值符则为高级药品，名医名院，值使同理。临腾蛇或玄武则多虚假不实，假医假药，腾蛇死门也主巫婆、神汉、仙姑之类，玄武多主假医假药，欺诈上当受骗。天心、乙奇临杜门，白虎则主医术一流，技术过硬。临太阴则主医生心理细腻，心细认真，临开门，丁奇则主手术开刀治疗。但不论庸医、良药，但能克病星所落之宫，医必有功。假如病星克天心星，乙奇所落宫位，虽名医良药，也不能治也。
附《奇门遁甲》占病古歌：
悬系一法少人知，问人年甲病先知
男从坎上顺数起，女向离宫逆点推
数到病人年甲上，看他因病预先知
子午卯酉定是死，寅申巳亥不开眉
辰戌丑末恐霍乱，此是神仙病应机
震巽相适手足麻，口中恶气眼生花
神天保愿来相助，若不相投气喘加
坤艮脾伤胸不开，心中结定滞凝怀
腹脐疼痛连腰腿，阴邪见怪有飞灾
乾兑多头痛，沉沉六脉微
冷积并冷气，其病在胸脾
坎离多呕逆，久治号难医
人虚常盗汗，饮食渐消除
总之测病时一定要多角度、多方面综合分析，充分采用象数理中的比类取象，思外揣内，由此及彼，内外相应的方法和原则，如测病时除选用神天芮落宫状态分析外，还要看日时落宫的星门奇仪，上下盘格局变化，旺相休囚状态，同时兼看本人年命，所在方向等因素，例如测父母，除看天芮落宫外，同时兼看年干、时干、乾坤二宫、父母年命宫、父母所在方位等，测兄弟姐妹、亲朋好友则要兼看月干、时干，测小弟还要兼看艮宫，则大姐则兼看巽宫，测小辈及儿女则要兼看时干等等，总之要灵活取用，才能一箭中的。
关于定应期的问题也要视情况而定，如测本人则要看日干及年命的状态，先看其旺相休囚，是否逢空，逢空者冲实填实为应期，六仪击刑逢冲者则以合为应期，入墓者出墓冲墓为应期，临马星者逢马星或冲动马星为应期，病星落内盘主近期为应，外盘则久远，远则断他年月，近断日时，反吟则合为应期，伏吟则冲为应期，以值使门断期限，例如值使临生门落兑宫主2.7之数，远断则7个月，200天，近断则2个月70天之内为应期，根据日干宫年命宫及用神所落位置综合评断应期。
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