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定好了大方針路線之後，鄧禹就帶領軍隊北上了，這一路之上也不是很太平，遇到了很多赤眉軍的軍隊，可鄧禹把他們都一一擊破了。之後所經郡縣都紛紛開門歸順，其中西河太守宗育，還派兒子手持鄧禹的文書到各個地方去招降別人，鄧禹非常的感動，就推薦他去洛陽給皇帝效力。
對於鄧禹的好心，劉秀是十分的領情，可他總覺得赤眉軍佔據長安終究不是個事情，就邊誇鄧禹邊給鄧禹下了一道命令。
大司徒，在西邊百姓心中，你就是當年的堯帝再生，那赤眉賊寇就是夏桀在世，現在長安城的官吏百姓都被赤眉軍折騰慘了，他們都期盼有救星出現，你要把握好這個時機拿下長安，才能安撫當地百姓，取得民心。
接到命令，鄧禹收下表揚以後，把攻打長安的命令放在一邊，繼續按照自己的路線走。就在鄧禹計劃順利進行的時候，內部出事了。當時鄧禹要帶軍北上，就派馮愔和宗歆兩位將軍在枸邑駐紮，也不知道是不是鄧禹沒有交代清楚，這二位為了爭奪最高控制權打了起來，結果是馮愔殺掉了宗歆，為了怕鄧禹責怪，他先下手去攻擊鄧禹。
這要是赤眉軍來整事，鄧禹早就一拳揮過去了，現在是自己內部出了亂子，鄧禹有點心虛，就派使者把這個事情稟報了皇帝。接到奏報以後，劉秀就問使者，馮愔在軍中和誰關係最好啊？使者告訴他是黃防。劉秀想了想，你回去讓大司徒放寬心，以後黃防會解決馮愔問題的，隨後就派人去招降黃防。一個多月以後，黃防果然抓住了馮愔，而後馮愔被押解到洛陽，劉秀寬宏大度赦免了馮愔。
就在劉秀的預言實現不久以後，鄧禹的預言也成為了現實，因為赤眉軍在長安呆不下去，他們出城往西邊尋糧食去了。接到了消息以後，鄧禹馬上集合人馬南下，不費吹灰之力，就佔領了長安。
進了長安之後，鄧禹是心情大好，他先擺下酒宴犒賞將士，而後率領諸位將軍們，選了一個良辰吉日沐浴更衣，請出漢朝前十一代君主的神位，派人把它們送到洛陽去享受供奉，然後又把劉家祖宗的宗祠好生侍候。
幹完了這些事情，還沒等鄧禹鞏固長安周圍的勢力，赤眉軍就回來了。鄧禹當然不想讓他們來了，就主動出擊想據赤眉軍於長安城之外，就像當初鄧禹預測的那樣，赤眉軍的戰鬥力還是十分強的，鄧禹這頭雖然人數不少，可還是被赤眉軍打敗了。
這個時候鄧禹對長安城也瞭解了，這個缺少糧食的城市還是很不好守的，他就帶兵撤出長安城，來到了高陵。由於這次在長安城光顧著搞場面了，鄧禹的後勤補給做的很不到位，他們的糧食很快就不夠了，很多人都靠打棗採野菜充飢。雖然日子過的這麼慘，可鄧禹還是沒有撤軍東歸找救濟，他一直在等待機會再圖長安。
功夫不負有心人啊，機會終於來了，當時在長安周邊一帶啊，還有一個稱霸一方的梟雄，此人名叫延岑（這個人的事蹟很多會在後面慢慢的講給大家）。所謂一山不容二虎，當延岑想求發展駐兵杜陵的時候，赤眉軍就不幹了，他們派出了逢安，讓他帶領十萬人馬去攻打延岑。鄧禹得知赤眉軍主力外出以後，那面黃肌瘦的小臉馬上就精神起來了，他就帶領這群飢餓的弟兄們攻打長安。
鄧禹打算的是不錯，逢安帶走了主力部隊，長安城內就剩下劉盆子和一些老弱病殘，可他忽略了一點，那就是赤眉軍裡可不止逢安一支隊伍。很快當年派人弄死更始帝的謝祿及時趕到了，鄧禹大軍本來是想撿便宜捏軟柿子的，沒想到來了一塊硬骨頭，幾口沒啃動之後，也只好撤軍保命。
之後鄧禹又幾次找機會和赤眉軍打架，可因為已經處於下風頭了，所以是一次便宜也沒撈著。這個時候馮異帶領大軍趕過來了，怎麼回事哪？原來啊，鄧禹被趕出長安的消息傳到洛陽以後，漢光武帝就有點著急了，他不能眼瞅著大好的局面就這麼慘淡收場啊，就馬上派出得力干將馮異去收拾局面。
為了表示重視，在馮異臨行之前，劉秀對他是好一番囑咐。
馮將軍啊，長安和周邊的三輔地區，之前被王莽和更始帝折騰的夠嗆，現在又被赤眉軍和延岑糟蹋，那地方的百姓是災難深重有苦沒處說。這次派你帶兵前往，不是讓你去搶地盤，也不是讓你去那裡殺人立威風，而是要你去平定戰亂，讓百姓重新過上好日子。
要說打仗，我們這些將軍們都是好樣的，可他們這些年也養成了殺人搶掠的毛病，我這次派你去，就是看中你的馭人之能，希望你能領會我的苦心，不要讓百姓再受苦了。
皇帝的心情，馮異自是萬分的理解，他叩頭領命之後，就開始帶兵向西而行。馮異這一路一直是貫徹劉秀的政策，所到之處是儘量的安撫百姓，把皇帝的天恩四處播撒，有不少地方的武裝部隊，都歸順了馮異。
馮異大軍就這麼一路向西，終於在華陰一帶就遇到了赤眉軍，因為都摸不透對方的底細，雙方都試試探探的沒敢決戰，就在雙方僵持的六十多天裡，一共就打了十多次，最後馮異的一方佔了上風，赤眉的將領劉始和王宣等人率領五千多人向馮異投降。
在對赤眉作戰方面，馮異算是佔了先機，當然了，好事總是成雙的，因為馮異的優異表現，在公元27年的春天，漢光武帝派使者來到馮異軍中，拜馮異為徵西大將軍。就在馮異當上徵西大將軍不久，就遇到了老熟人鄧禹。
鄧禹這會正是落魄，幾次攻擊赤眉軍都吃了癟子，現在他和車騎將軍鄧弘帶著手下正要東歸，遇到了馮異大軍之後，鄧禹二人頓時就覺得看到了希望，就想要馮異和自己一起去攻打赤眉軍。
可馮異並沒有那麼著急，他告訴這二位，我已經和前面的赤眉軍耗了幾十天了，雖然搞定了他們一部分人，可沒搞定的還是佔大多數，如果要用武力征服，恐怕沒那麼容易，我想一點點的瓦解他們，再找機會把他們一舉搞定。
二位將軍不要撇嘴，皇上已經料定那赤眉軍在長安也難以長久，現在正帶著將士們駐紮在黽池一帶，準備截斷他們的東歸之路，我帶著人在西邊慢慢的和他們打，等他們真正在這頭待不住，準備往東走的時候，再大舉進攻往包圍圈送他們一程，這才是成大功之策。
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