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沒有誰規定核潛艇必須三個月返航，核潛艇理論上續航能力可以達到數十萬甚至上百萬海里，不考慮其他因素影響的話，繞地球跑幾十圈都沒問題，但一般情況下核潛艇的自持力也就在1-3個月（俄羅斯“奧斯卡級”核潛艇可達4個月！），關鍵是“其他因素”的制約不可抗拒，具體包括：
海上狂飆的美國“俄亥俄級”戰略核潛艇
1）艇員生活、補給品等存量有限：核潛艇一般配備上百名艇員（法國2600噸的“紅寶石級”艇員約70人），在“寸土寸金”的核潛艇內部還必須想方設法儘量多儲備艇員日常生活必須的食品、用品等，巡航時間就受物資儲備的限制；此外，核潛艇長期水下潛航對艇員的心理影響極大，為保證艇員心理健康及核潛艇的安全，也不允許核潛艇無限制的在水下航行！
美國“弗吉尼亞級”核潛艇的艇員在餐廳就餐
英國“前衛級”戰略核潛艇內狹小的生活空間，對艇員心理承受能力考驗極大！2）核潛艇機械設備需定期檢修：核潛艇的核動力系統具備無限巡航的能量儲備，但是核潛艇畢竟是一個由大量機械設備組成的整體，是機械設備就肯定會發生老化、故障，就像汽車需要定期保養一樣，核潛艇也需要定期檢修、更換部件，這也是限制核潛艇不能無限制巡航的核心因素之一！
俄羅斯“颱風級”戰略核潛艇內部大量的儀表設備
英國“前衛級”戰略核潛艇內部玲琅滿目的機械設備 3）根據不同任務調整武器配置：核潛艇執行任務前會根據需求配置武器系統，根據任務對象配置魚雷、水雷、反艦導彈、甚至潛射彈道導彈（戰略核潛艇巡航也不會一直滿載核導彈），而且其所攜帶的武器也需要定期檢查，保障裝備的可靠性。
法國“凱旋級”戰略核潛艇吊裝M51潛射彈道導彈
美國“弗吉尼亞級”核潛艇魚雷艙
其實，上述第一點是限制核潛艇巡航時間的最核心因素，我國第一代核潛艇官兵曾創造了水下連續航行90天的世界紀錄，那是全體艇員冒著生命危險開展的極限試驗，據說艇員上岸都需要別人攙扶、而且還進行了心理疏導，這樣的長航並不具備實戰意義！即使再先進的裝備，也要受人的控制和限制！
參加南海閱兵的國產核潛艇！
威吶解析
皇家海軍的“特拉法爾加級”核潛艇在執行了3個月的北海巡邏任務後返回朴茨茅斯母港。核潛艇所謂“無限航行”只是相對的，理論上來說，1990年代中期製造的核潛艇採用的是“全壽命反應堆”與艇體壽命基本一致，使用了93%以上的武器級鈾235，潛艇在服役期內不需要更換核燃料…但這也得“省著用”可以維持150萬海里左右的航程，所以核潛艇“無限”並不存在。
那麼，核潛艇一次執行任務為何要定在90天左右？核潛艇或者水面艦艇都有一個專業名詞叫做：自持時間。這個詞彙的解釋就是：艦艇一次性加滿燃料、淡水、食物…夠在海上巡邏的時間（天數），當然有補給艦可以增加巡邏的時間。
美軍核潛艇的節日餐，有牛排和蟹腿…潛艇官兵的伙食標準是海軍當中最高的。核潛艇由於有核反應堆相對的“無限航行”，淡水也可以海水淡化，這兩樣可以不做主要考慮 但是食品問題是要考慮的，畢竟核潛艇的食品儲存也是有限的不可能無限供應，而核潛艇巡邏一次基本上不做外界再補給（現在潛艇支援艦隻在個別情況下給核潛艇進行補給）到了食物快告缶的時間核潛艇也必須返航。
這是潛艇裡的掛鐘，上面是24小時的叫做“全日鍾”潛艇裡沒有白天黑夜，艇員每班8小時輪換一次。還有一個最主要的問題是就是艇上官兵的身心健康問題，潛艇在水下見不到太陽，根本分不清白天還是晚上，雖然現代潛艇有模擬日光的燈，但是與真正的陽光相比差距甚遠，人整日的在這種“黑白顛倒”的封閉空間環境下工作要有非常好的心理素質，並且潛艇要求靜音，除了管道里的各種液體流動聲音和一些避免不了的機械噪音，不允許有明顯的生活噪音發出，可以看電視、聽音樂但都必須使用耳機……總之，工作之餘的生活也是枯燥乏味的！基本上都是戰備、吃飯、睡覺這樣的三點一線，現代社會是豐富多彩的，冷不丁的上百號人被禁錮在一個經常碰頭的大鐵罐子裡，精神的緊張、心情的壓抑常人是無法體會到的，而且這種緊張和壓抑要持續90天左右的時間，長期這樣下去艇員患上自閉症、憂鬱症的可能性會增加……現代軍事醫學發達，潛艇兵都有心理諮詢師，需要進行心理輔導。
這些皇家海軍的潛艇兵經過遠航之後，精神狀態還算不錯！都颳了鬍子說明淡水充足，潛艇上安裝了M60通用機槍，可以對付小艇。總之 核潛艇一次出航3個月（90天）時間是自身攜帶給養的數量所定的，吃飯可是大事兒！另一個原因就是醫學和心理學對艇員的身心健康狀況做過研究和測試，說的更清楚一些，就是：人的精神狀態和心理健康程度在黑暗的封閉空間至多保持在三個月（女性加入艇員的隊伍可能會有所緩解，外軍已經這樣做了）！這還是經過訓練的軍人，普通人能經受一個星期就很了不起了！
皇家橡樹1972
1955年1月~4月，美國海軍第一艘核潛艇“鸚鵡螺號”創造了水下自持潛航84天的世界記錄，這個記錄一直保持到30年之後才被打破；1985年11月至次年2月，我國海軍核潛艇部隊的403號艇以90天的極限潛航試驗刷新了世界核潛艇水下自持潛航最長的記錄，該記錄至今仍沒有被打破；本次潛航試驗，403艇的總航程約為23625海里，這也是目前海軍核潛艇史上的最高記錄，這一消息在1987年元旦當天由新華社率先發布。 
鸚鵡螺號 核潛艇理論上雖然可以“無限航行”，不過要考慮到潛艇裡的食物儲備還有艇員們在水下的心理生理承受能力，這90天的潛航時間基本已經是最高的極限了。正常情況下，核潛艇很少達到90天的自持力，目前各國的核潛艇常規巡邏基本線是40天左右，比如有時執行遠洋任務時，去的時候用10天，任務區域巡航20天，返航的時候也是10天，按90天最高潛航記錄的一半，核潛艇能夠潛航40天這對於執行常規任務都已經足夠。
403艇核潛艇在真正執行潛航任務期間，遊弋並不是目的，關鍵是如何隱蔽自己的同時還能感知外界態勢，獲取上級指示，完成作戰任務。因此在現代戰爭中，如果沒有海外基地補給，光靠潛艇的自持力維持一個月就不錯了；而且核潛艇空間有限，各種狹窄逼仄，加之長時間呆在水底，那種壓抑和恐懼不言而喻，遇到緊急狀況後，鐺鐺響的主動聲納聲像鋼丸一樣打在艇體上……很難想象在這種環境下還能長時間堅持戰鬥，至少在艇員們看來，40天已經不少了。
我國的核潛艇梁無咎
理論上的確可以無限續航，但艇員表示:我受不了這委屈！
下海三個月，比在岸上三年難熬。這是絕對的。別看核潛艇可以搭載多少潛射導彈，可以造成多大程度的殺傷。對於潛艇艇員來說，這都是次要的，自己的生活質量才是最需要考慮的。
核潛艇由於自身的戰略原因，必須常年在水下航行。這與航母不同，航母光明正大在海上航行，時不時還可以停靠一下軍港，最不濟也可以由補給艦運送補給，新鮮的水果之類的還是吃的到。
然而核潛艇就比較苦逼了，因為其本身就是作為戰略核反擊和未知核威懾角色使用的。所以，一般，沒有停靠，沒有補給！想看風景？窗外一片黑乎乎。以為艇員看到的是碧水藍天，各種五彩斑斕的魚類游來游去？對不起，那是熱帶淺海才看得到的景觀，要是艇員這麼大看到這種景觀，那離擱淺也就不遠了，準備叫國際救援吧。
所以核潛艇艇員真實生活就是，連續幾十天只能在艦內狹小的空間活動，時不時還要精神緊繃做好戰鬥準備。食物大部分是真空包裝的，蔬菜大部分是脫氧的，營養倒不會差，但長期吃這些東西，誰都會厭煩。
在這種高壓環境下，艇員能堅持三個月已經很不錯了，常規潛艇一次出海也就十幾天就可以返航，核潛艇艇員已經是扛住了幾倍的壓力。如果時間再長，戰鬥力會大大下降不說，甚至可能會出現譁變，這就得不償失了。
戰火觀察室
崤山小虎第132條回答。
小虎雖然當過12年兵，但從事的是地面的工作。當兵之前一直都很崇拜特種兵和飛行員，直到當兵第一年我知道了“361潛艇事故”，從此以後我對潛艇兵那種深深的敬意就再未退卻。
題主有一點說的不對，不是大多數潛艇，是所有的潛艇“一次潛航不得超過三個月”。
“潛航”和“返航”是兩碼事。
“潛航”三個月，就是紮紮實實的90天，不能上浮，沒有補給，沒得上浮至潛望鏡位置換氣等。目前最長潛航記錄是“長征三號”核潛艇90天。
三個月“返航”，就是離港到回港時間是三個月，至於中途有沒有補給，有沒有上潛，有沒有到其他基地大修都沒做要求。
但我想題主肯定問的是“潛航”為什麼不能超過三個月。
我沒當過潛艇兵，不能給出準確無誤的答案。但從“人”的角度我有一點自己淺顯的認識。
某年，小虎有幸隨部隊到某地駐防，期間有一個月的時間是在地下指揮部工作。這一個月的時間只見燈光，不見陽光。唯有陰天下雨時，才有一次15~20分鐘的機會到地面“放風”。
每次“放風”，即使烏雲蔽日，剛上去的兩三分鐘依然感覺眼睛難受的要命，身上三、五天不見陽光，皮膚髮白、血管發青發亮。即便如此，只要能遇到放風，哪怕是後半夜(當時對時間已經麻木)都要屁顛屁顛的起來看星星。感覺是這輩子最開心的事情了。大夥都不說話，靜靜地看一會兒天空(洞口的大照明燈照例是不能開的)。時間到了，極不情願的回到地下。
不到一個月大家都變得寡言寡語，日子已然記不得了，最後一天凌晨12:00，終於被告知可以返回地面。感覺自己好像經歷了好幾年，終於得以解脫。
再來看看潛艇兵，潛航三個月，潛艇的空間自然是沒有地下指揮部大，待的時間也要長兩個月。而且沒有補給，沒有新鮮空氣，試問，這樣的環境三個月，如果沒有強大的心理和生理素質，誰能承受得了？
我們的潛艇兵愣是再這樣枯燥無味的生活環境下，為國守海三個月，如何不讓人佩服之至？
題外話:如果有寫的不對不妥的地方，還望各位讀者批評指正。
哨兵小虎
現在核潛艇理論上來說可以實現無限續航。單身一般情況下，執行任務的週期也就是三個月左右，目前潛艇潛航的世界紀錄是我國403艇在1985年11月至次年2月期間創下的90天的極限挑戰。
但是，為啥世界紀錄也才潛航90天呢？非常簡單的前提是什麼？他是潛伏在水下的殺手，可以說它是暗無天日的，與世隔絕的，並且潛艇潛艇在水下，那就是個活棺材，出了任何故障，可以說一整艘潛艇的人都涼了。屍骨無存
。
甚至如果水面艦艇被擊沉了臉好的話，起碼事故還能被撈出來，但是潛艇撈都沒法撈。
所以說在潛艇裡面人的心理壓力非常大。
時間長了，被逼瘋都是有可能的。所以為了潛艇乘員，有一個比較良好的心理狀態，各國的潛艇兵軍不會長期的下潛甚至於長時間下潛完了還會有強制性的休假。
當然了，我尋思的還是自動化程度不夠，要不然的話拉幾個死宅下去，你讓人家出，人家都不一定往出走
還有一個方向的問題，也就是沒有什麼新鮮的食物，每天就能吃個罐頭，吃罐頭以吃更多的罐頭。這個時間長了，這實在吃不下去了。
更何況潛艇兵是非常孤獨的。深淺之後，你能聽到的只有你們船上人的聲音。除此以外再無其他這心裡壓力還用說嗎？
心裡壓力，生理壓力，精神壓力，外加食物不好，這幾方面綜合之下。長時間潛航是不太靠譜的
也許拉幾個自閉症患者能好點。
尋找丟失的方向盤
正如很多高票答案所說，潛艇的環境對艇員的身體和心理挑戰極大，正常戰備值勤或巡邏三個月（間或有浮潛）還好，如果完全是潛航的話，三個月不見天日，對艇員的心理挑戰太大了。
一句話：太不人道了。尤其是潛艇（核潛艇）都被視為國之重器，輪流戰備值勤是題中應有之義，這也意味著，總會有若干艘核潛艇處於戰備狀態。
所以，未來潛艇發展的趨勢也是無人艇，這也是各國目前在潛艇裝備和控制領域中比較集中研發的領域。
搬不動的小強
等著那個科學家用基因編輯造出，無限續航的人種，就可以了。
那河那江那海
機器受得了，人受不了，要瘋
顏巔峰2018
這和汽車可以連續高速奔馳上千公里也沒問題一樣，問題是人受不了啊。。。總得吃喝拉撒啊。。。裝備很多時候都是被人限制了，畢竟人是血肉之軀，很脆弱很麻煩
